PTPRC - PTPRC
Protein tyrosin fosfatáza, receptor typu, C, také známý jako PTPRC je enzym , že u lidí, je kódován PTPRC genem . PTPRC je také známý jako antigen CD45 (CD znamená shluk diferenciace ), který byl původně nazýván běžný antigen leukocytů ( LCA ).
Funkce
Proteinový produkt tohoto genu, nejlépe známý jako CD45, je členem rodiny proteinů tyrosin fosfatázy (PTP). PTP jsou signální molekuly, které regulují řadu buněčných procesů, včetně buněčného růstu, diferenciace, mitotického cyklu a onkogenní transformace. CD45 obsahuje extracelulární doménu, jeden transmembránový segment a dvě tandemové intracytoplazmatické katalytické domény, a proto patří do rodiny receptorů typu PTP.
CD45 je transmembránový protein typu I, který je přítomen v různých isoformách na všech diferencovaných hematopoetických buňkách (kromě erytrocytů a plazmatických buněk ). Ukázalo se, že CD45 je základním regulátorem signalizace receptoru antigenu T- a B-buněk. Funguje buď přímou interakcí se složkami komplexů receptoru antigenu prostřednictvím jeho extracelulární domény (forma společné stimulace ), nebo aktivací různých kináz rodiny Src požadovaných pro signalizaci receptoru antigenu prostřednictvím jeho cytoplazmatické domény. CD45 také potlačuje JAK kinázy , a tak funguje jako negativní regulátor signalizace receptoru cytokinů .
Bylo popsáno mnoho alternativně sestřižených transkriptových variant tohoto genu, které kódují odlišné izoformy. Protilátky proti různým izoformám CD45 se používají v rutinní imunohistochemii k rozlišení typů imunitních buněk a také k rozlišení histologických řezů od lymfomů a karcinomů.
Izoformy
Rodina proteinů CD45 se skládá z několika členů, které jsou všechny produkty jednoho komplexního genu. Tento gen obsahuje 34 exonů , které produkují masivní protein s extracelulárními a cytoplazmatickými doménami, které jsou neobvykle velké. Exony 4, 5 a 6 (odpovídající proteinovým oblastem A, B a C) jsou alternativně spojeny za vzniku až osmi různých proteinových produktů s kombinacemi nula, jeden, dva nebo všechny tři exony.
Velká extracelulární doména CD45 je vysoce glykosylovaná a těchto osm izoforem umožňuje širokou variabilitu struktury jejích postranních řetězců. Izoformy ovlivňují N-koncovou oblast proteinu, která lineárně vystupuje z buňky a nese O-vázané glykanové řetězce.
Izoformy CD45 vykazují specifickou expresi buněčného typu a stupně diferenciace, což je vzor, který je u savců poměrně dobře konzervován. Tyto izoformy se často používají jako markery, které identifikují a rozlišují různé typy imunitních buněk.
Naivní T lymfocyty jsou typicky pozitivní na CD45RA, který zahrnuje pouze oblast A proteinu. Aktivované a paměťové T lymfocyty exprimují CD45RO, nejkratší izoformu CD45, která postrádá všechny tři oblasti A, B a C. Tato nejkratší izoforma usnadňuje aktivaci T buněk.
CD45R (také známý jako CD45RABC) obsahuje všechny tři možné exony. Je to nejdelší protein a při izolaci z T buněk migruje na 200 kDa. B buňky také exprimují CD45R s těžší glykosylací, čímž se molekulová hmotnost zvýší na 220 kDa, odtud název B220 (B buněčná izoforma 220 kDa).
Interakce
Bylo prokázáno, že PTPRC interaguje s:
Nedávno bylo ukázáno, že CD45 interaguje s proteinem HCMV UL11. Tato interakce vede k funkční paralýze T buněk . Kromě toho se ukázalo, že CD45 je cílem proteinu adenoviru 19a E3/49K druhu D pro inhibici aktivace NK a T buněk.
Klinický význam
CD45 je pan-leukocytový protein s aktivitou tyrosin fosfatázy zapojený do regulace přenosu signálu při krvetvorbě. CD45 nekolokalizuje lipidovými rafty na myších a lidských netransformovaných hematopoetických buňkách, ale polohování CD45 v lipidových raftech se během jejich onkogenní transformace mění na akutní myeloidní leukémii . CD45 kolokalizuje lipidovými rafty na AML buňkách, což přispívá ke zvýšené intenzitě signálu GM-CSF zapojené do proliferace leukemických buněk.
Použijte jako kongenní marker
U myší existují dvě identifikovatelné alely CD45: CD45.1 (historicky Ly5.1) a CD45.2 (historicky Ly5.2). Tyto dva typy CD45 jsou považovány za funkčně totožné. Jako takové se běžně používají ve vědeckém výzkumu, aby umožnily identifikaci buněk. Například, leukocyty mohou být přeneseny z dárcovské myši CD45.1, do CD45.2 hostitelské myši, a může být následně identifikovány vzhledem k jejich expresi CD45.1. Tato technika se také běžně používá při generování chimér. Alternativním systémem je použití alel CD90 (Thy1), přičemž systém CD90.1/CD90.2 se používá stejným způsobem jako systém CD45.1/CD45.2.
V roce 2016 byla na pozadí C57Bl/6 vygenerována nová knock-in myš, aby byl dokonalým kongenním kmenem. Tato myš, přezdívaná myš CD45.1STEM, se liší od kmene C57Bl/6 jediným párem bází, což má za následek jedinou změnu aminokyseliny, která propůjčuje rozdíl v reaktivitě protilátkami anti-CD45.1 a anti-CD45.2. Tento kmen byl navržen pro kompetitivní testy transplantace kostní dřeně a prokázal dokonalou ekvivalenci, na rozdíl od předchozího standardu, myši „SJL“, více formálně známé jako Pep Boy.
Reference
Bibliografie
- Tchilian EZ, Beverley PC (2002). „CD45 v paměti a nemoci“. Archivum Immunologiae et Therapiae Experimentalis . 50 (2): 85–93. PMID 12022705 .
- Ishikawa H, Tsuyama N, Abroun S, Liu S, Li FJ, Otsuyama K, et al. (Září 2003). „Interleukin-6, CD45 a src-kinázy při proliferaci myelomových buněk“. Leukémie a lymfom . 44 (9): 1477–81. doi : 10,3109/10428190309178767 . PMID 14565647 . S2CID 19867177 .
- Stanton T, Boxall S, Bennett A, Kaleebu P, Watera C, Whitworth J, et al. (Květen 2004). „CD45 variantní alely: možná zvýšená frekvence nového polymorfismu exonu 4 CD45 u HIV séropozitivních Ugandanů“. Imunogenetika . 56 (2): 107–10. doi : 10,1007/s00251-004-0668-z . PMID 15057492 . S2CID 10179258 .
- Huntington ND, Tarlinton DM (červenec 2004). „CD45: přímá a nepřímá vláda imunitní regulace“. Imunologické dopisy . 94 (3): 167–74. doi : 10.1016/j.imlet.2004.05.011 . PMID 15275963 .
- Jameson R (2006). „CD45“ . Imunologický kurz pro vysokoškoláky . Davidson College . Citováno 2011-10-24 .