Chromozom 16 - Chromosome 16

Chromozom 16
Lidský mužský karyotpe s vysokým rozlišením - chromozom 16 oříznutý.png
Pár lidských chromozomů 16 po G-bandingu .
Jeden je od matky, jeden je od otce.
Lidský mužský karyotpe s vysokým rozlišením - chromozom 16.png
Pár chromozomů 16
v lidském mužském karyogramu .
Funkce
Délka ( bp ) 90 338 345 bp
( GRCh38 )
Počet genů 795 ( CCDS )
Typ Autosome
Poloha centromer Metacentrický
(36,8 Mbp)
Kompletní seznamy genů
CCDS Seznam genů
HGNC Seznam genů
UniProt Seznam genů
NCBI Seznam genů
Externí prohlížeče map
Ensembl Chromozom 16
Entrez Chromozom 16
NCBI Chromozom 16
UCSC Chromozom 16
Úplné sekvence DNA
Ref NC_000016 ( FASTA )
GenBank CM000678 ( FASTA )

Chromozom 16 je jedním z 23 párů chromozomů u lidí . Lidé obvykle mají dvě kopie tohoto chromozomu. Chromozom 16 pokrývá asi 90 milionů párů bází (stavební materiál DNA) a představuje necelá 3% celkové DNA v buňkách .

Geny

Počet genů

Níže jsou uvedeny některé z odhadů počtu genů lidského chromozomu 16. Protože výzkumníci používají různé přístupy k anotaci genomu, jejich předpovědi počtu genů na každém chromozomu se liší (technické detaily viz predikce genů ). Mezi různými projekty má projekt sekvenční kódovací spolupráce ( CCDS ) extrémně konzervativní strategii. Predikce počtu genů CCDS tedy představuje dolní hranici celkového počtu genů kódujících lidský protein.

Odhaduje Geny kódující proteiny Nekódující geny RNA Pseudogeny Zdroj Datum vydání
CCDS 795 - - 2016-09-08
HGNC 802 251 365 2017-05-12
Ensembl 865 1046 462 29. 3. 2017
UniProt 838 - - 2018-02-28
NCBI 912 652 502 19. 05. 2017

Seznam genů

Viz také: Kategorie: Geny na lidském chromozomu 16

Následuje částečný seznam genů na lidském chromozomu 16. Úplný seznam naleznete v odkazu v infoboxu vpravo.

Nemoci a poruchy

Přidružené vlastnosti

Cytogenetický pás

Ideogramy G-páskování lidského chromozomu 16
Ideogram G-bandingu lidského chromozomu 16 v rozlišení 850 bphs. Délka pásma v tomto diagramu je úměrná délce páru základen. Tento typ ideogramu se obecně používá v genomových prohlížečích (např. Ensembl , UCSC Genome Browser ).
Vzory G-páskování lidského chromozomu 16 ve třech různých rozlišeních (400, 550 a 850). Délka pásma v tomto diagramu vychází z ideogramů ISCN (2013). Tento typ ideogramu představuje skutečnou relativní délku pásma pozorovanou pod mikroskopem v různých okamžicích mitotického procesu .
G-pásy lidského chromozomu 16 v rozlišení 850 bphs
Chr. Paže Kapela ISCN
start 		ISCN
zastávka 		párů bazí
začátek
Zastávka základny		 Skvrna Hustota
16 p 13.3 0 352 1 7 800 000 gneg
16 p 13.2 352 596 7 800 001 10 400 000 gpos 50
16 p 13,13 596 813 10 400 001 12 500 000 gneg
16 p 13.12 813 948 12 500 001 14 700 000 gpos 50
16 p 13.11 948 1070 14 700 001 16 700 000 gneg
16 p 12.3 1070 1246 16 700 001 21 200 000 gpos 50
16 p 12.2 1246 1409 21 200 001 24 200 000 gneg
16 p 12.1 1409 1558 24 200 001 28 500 000 gpos 50
16 p 11.2 1558 1856 28 500 001 35 300 000 gneg
16 p 11.1 1856 2045 35 300 001 36 800 000 acen
16 q 11.1 2045 2194 36 800 001 38 400 000 acen
16 q 11.2 2194 2709 38 400 001 47 000 000 gvar
16 q 12.1 2709 2953 47 000 001 52 600 000 gneg
16 q 12.2 2953 3142 52 600 001 56 000 000 gpos 50
16 q 13 3142 3346 56 000 001 57 300 000 gneg
16 q 21 3346 3657 57 300 001 66 600 000 gpos 100
16 q 22.1 3657 4023 66 600 001 70 800 000 gneg
16 q 22.2 4023 4118 70 800 001 72 800 000 gpos 50
16 q 22.3 4118 4294 72 800 001 74 100 000 gneg
16 q 23.1 4294 4551 74 100 001 79 200 000 gpos 75
16 q 23.2 4551 4659 79 200 001 81 600 000 gneg
16 q 23.3 4659 4768 81 600 001 84 100 000 gpos 50
16 q 24.1 4768 4930 84,100,001 87 000 000 gneg
16 q 24.2 4930 5025 87 000 001 88 700 000 gpos 25
16 q 24.3 5025 5120 88 700 001 90,338,345 gneg

Reference

externí odkazy

  • Národní institut zdraví. „Chromozom 16“ . Genetika Home Reference . Archivovány od originálu 3. srpna 2004 . Citováno 2017-05-06 .
  • "Chromozom 16" . Informační archiv projektu lidského genomu 1990–2003 . Citováno 2017-05-06 .