Filoviridae -Filoviridae
Filoviridae | |
---|---|
Struktura a genom ebolaviru | |
Elektronová mikrofotografie z viru Marburg | |
Klasifikace virů | |
(nezařazeno): | Virus |
Říše : | Riboviria |
Království: | Orthornavirae |
Kmen: | Negarnaviricota |
Třída: | Monjiviricetes |
Objednat: | Mononegavirales |
Rodina: | Filoviridae |
Rody | |
Filoviridae ( / ˌ f aɪ l oʊ V ɪr ɪ d já / ) je rodina z jednořetězcových negativní-sense RNA viry v řádu Mononegavirales . Dva členové rodiny, kteří jsou běžně známí, jsou virus Ebola a virus Marburg . Oba viry a někteří jejich méně známí příbuzní způsobujíu lidí a nelidských primátů vážná onemocnění veformě virových hemoragických horeček .
Všechny filoviry jsou klasifikovány USA jako vybranými agenty , Světovou zdravotnickou organizací jako patogeny rizikové skupiny 4 (vyžadující omezení biologické bezpečnosti úrovně 4 ), Národními zdravotními ústavy / Národním ústavem pro alergii a infekční choroby jako prioritními patogeny kategorie A , a Centry pro kontrolu a prevenci nemocí jako agenti bioterorismu kategorie A a jsou uvedeni jako biologičtí agenti pro kontrolu exportu australskou skupinou .
Použití termínu
Rodina Filoviridae je virologické taxon , který byl definován v roce 1982 a emended v roce 1991, 1998, 2000, 2005, 2010 a 2011 se rodina v současné době zahrnuje šest virus rody Cuevavirus , Dianlovirus , Ebolavirus , Marburgvirus , Striavirus, a Thamnovirus a je zahrnuta v pořadí Mononegavirales . Členům rodiny (tj. Skutečným fyzickým entitám) se říká filoviry nebo filoviry. Název Filoviridae je odvozen z latinského podstatného jména filum (narážka na vláknitou morfologii filovirionů) a taxonomické přípony -viridae (která označuje rodinu virů).
Poznámka
Podle pravidel pro pojmenování taxonů stanovených Mezinárodním výborem pro taxonomii virů (ICTV) má být jméno Filoviridae vždy psáno velkými písmeny , kurzívou , nikdy nesmí být zkráceno a před ním musí být uvedeno slovo „rodina“. Jména jejích členů (filoviry nebo filoviry) se zapisují malými písmeny, nejsou psána kurzívou a používají se bez článků .
Životní cyklus
Životní cyklus filoviru začíná připojením virionu ke specifickým receptorům buněčného povrchu , následuje fúze virionového obalu s buněčnými membránami a současné uvolnění virového nukleokapsidu do cytosolu . Virová RNA-dependentní RNA polymerázu (RdRp, nebo RNA replikázy) částečně uncoats nukleokapsid a přepisuje se geny do pozitivním řetězcem mRNA , které jsou pak přeloženy do strukturálních a nestrukturálních proteinů . Filovirus RdRps se váže na jeden promotor umístěný na 3 'konci genomu. Transkripce buď končí po genu, nebo pokračuje k dalšímu genu po proudu. To znamená, že geny blízké 3 'konci genomu jsou transkribovány v největší hojnosti, zatímco ty směrem k 5' konci jsou transkribovány nejméně. Genový řád je tedy jednoduchá, ale účinná forma regulace transkripce. Nejhojnějším produkovaným proteinem je nukleoprotein , jehož koncentrace v buňce určuje, kdy RdRp přepne z genové transkripce na replikaci genomu. Výsledkem replikace jsou antigeny s pozitivními vlákny v plné délce, které jsou následně transkribovány do kopií genomu potomstva virového potomstva negativního řetězce. Nově syntetizované strukturní proteiny a genomy se samy shromažďují a hromadí se uvnitř nitra buněčné membrány . Viriony bud pryč z buňky, získává své obálky z buněčné membrány, které Bud z. Zralé částice potomstva pak infikují další buňky, aby cyklus opakovaly.
Kritéria zahrnutí rodiny
Virus, který splňuje kritéria pro zařazení do řádu Mononegavirales, je členem čeledi Filoviridae, pokud:
- u některých primátů způsobuje virovou hemoragickou horečku
- nakazí v přírodě primáty , prasata nebo netopýry
- je třeba přizpůsobena přes sériovou pasáží způsobit onemocnění u hlodavců
- to výlučně replikuje v cytoplazmě části hostitelské buňky
- má genom ≈19 kbp na délku
- má genom RNA, který tvoří ≈1,1% hmotnosti virionů
- jeho genom má molekulovou hmotnost o ≈4.2 x 10 6
- jeho genom obsahuje jeden nebo více genových přesahů
- jeho genom obsahuje sedm genů v pořadí 3' -UTR - NP - VP35 - VP40 - GP - VP30 - VP24 - L - 5' -UTR
- jeho gen VP24 není homologní s geny jiných mononegavirů
- jeho genom obsahuje signály iniciace a ukončení transkripce, které se nenacházejí v genomech jiných mononegavirů
- tvoří nukleokapsidy s plovoucí hustotou v CsCl ≈ 1,32 g/cm 3
- tvoří nukleokapsidy s centrálním axiálním kanálem (≈10–15 nm na šířku) obklopeným tmavou vrstvou (≈20 nm na šířku) a vnější šroubovicovou vrstvou (≈50 nm na šířku) s příčným pruhováním (periodicita ≈5 nm)
- exprimuje fúzní glykoprotein třídy I, který je na svém cytoplazmatickém ocasu vysoce N - a O - glykosylovaný a acylovaný
- exprimuje primární matricový protein, který není glykosylován
- tvoří viriony, které vycházejí z plazmatické membrány
- tvoří viriony, které jsou převážně vláknité (ve tvaru písmene U a 6) a které mají šířku ≈80 nm a několik set nm a délku až 14 μm
- tvoří viriony, které mají od sebe vzdálené povrchové projekce ≈7 nm na délku ≈10 nm
- tvoří viriony s molekulovou hmotností o ≈3.82 x 10 8 ; S 20W alespoň 1,40; a vznosné hustotu v vínanu draselného o ≈1.14 g / cm 3
- tvoří viriony, které jsou in vivo špatně neutralizovány
Rodinná organizace
Rodové jméno | Název druhu | Název viru (zkratka) |
---|---|---|
Cuevavirus | Lloviu cuevavirus | Virus Lloviu (LLOV) |
Dianlovirus | Mengla dianlovirus | Virus Měnglà (MLAV) |
Ebolavirus | Bombali ebolavirus | Bombali virus (BOMV) |
Bundibugyo ebolavirus | Virus Bundibugyo (BDBV; dříve BEBOV) | |
Restonujte ebolavirus | Reston virus (RESTV; dříve REBOV) | |
Súdánský ebolavirus | Súdánský virus (SUDV; dříve SEBOV) | |
Lesní ebolavirus Taï | Virus Taï Forest (TAFV; dříve CIEBOV) | |
Zaire ebolavirus | Virus Ebola (EBOV; dříve ZEBOV) | |
Marburgvirus | Marburg marburgvirus | Virus Marburg (MARV) |
Ravn virus (RAVV) | ||
Striavirus | Xilang striavirus | Virus Xīlǎng (XILV) |
Thamnovirus | Huangjiao thamnovirus | Virus Huángjiāo (HUJV) |
Fylogenetika
Míra mutace v těchto genomech byla odhadnuta na 0,46 × 10–4 až 8,21 × 10–4 nukleotidové substituce/místo/rok. Nejnovějším společným předkem sekvenovaných variant filovirů bylo odhadováno na 1971 (1960–1976) pro virus Ebola, 1970 (1948–1987) pro virus Reston a 1969 (1956–1976) pro súdánský virus, přičemž posledním společným předkem byl mezi čtyřmi druhy zahrnutými v analýze (virus Ebola, virus Tai Forest, virus Súdán a virus Reston) odhadovaný na 1000–2100 let. Zdá se, že nejnovější společný předek druhů Marburg a Súdán se vyvinul 700 a 850 let před současností. Ačkoli mutační hodiny umístily dobu divergence existujících filovirů na ~ 10 000 let před současností, datování ortologických endogenních prvků (paleovirů) v genomech křečků a hrabošů naznačovalo, že existující rody filoviridů měly společného předka přinejmenším stejně starého jako Miocén (asi před 16–23 miliony let).
Paleovirologie
Filoviry mají historii, která sahá několik desítek milionů let. Endogenní virové prvky (EVE), které se zdají být odvozeny z virů podobných filovirům, byly identifikovány v genomech netopýrů , hlodavců , rejsků , tenreků , nártounů a vačnatců . Ačkoli se většina EVI podobných filovirům jeví jako pseudogeny , evoluční analýzy naznačují, že ortology izolované z několika druhů netopýrů rodu Myotis byly zachovány selekcí.
Vakcíny a starosti
V současné době existuje velmi omezený počet vakcín pro známý filovirus. Účinná vakcína proti EBOV, vyvinutá v Kanadě, byla schválena pro použití v roce 2019 v USA a Evropě. Podobně probíhá úsilí o vývoj vakcíny proti viru Marburg. Existuje naléhavá obava, že velmi malá genetická mutace na filovirus, jako je EBOV, by mohla mít za následek změnu přenosového systému z přímého přenosu tělních tekutin na přenos vzduchem, jak bylo vidět u viru Reston (další člen rodu Ebolavirus) mezi infikovanými makaků. Podobná změna v současných cirkulujících kmenech EBOV by mohla výrazně zvýšit počet infekcí a chorob způsobených EBOV. Neexistuje však žádný záznam o tom, že by jakýkoli kmen Ebola někdy provedl tento přechod u lidí.
Reference
Další čtení
- Klenk, Hans-Dieter (1999). Viry Marburg a Ebola. Aktuální témata z mikrobiologie a imunologie . 235 . Berlín, Německo: Springer-Verlag. ISBN 978-3-540-64729-4.
- Klenk, Hans-Dieter; Feldmann, Heinz (2004). Viry Ebola a Marburg - molekulární a buněčná biologie . Wymondham, Norfolk, Velká Británie: Horizon Bioscience. ISBN 978-0-9545232-3-7.
- Kuhn, Jens H. (2008). Filoviry - souhrn 40 let epidemiologických, klinických a laboratorních studií. Archiv přílohy Virologie . 20 . Vídeň, Rakousko: Springer. ISBN 978-3-211-20670-6.
- Ryabchikova, Elena I .; Cena, Barbara B. (2004). Viry Ebola a Marburg - pohled na infekci pomocí elektronové mikroskopie . Columbus, Ohio, USA: Battelle Press. ISBN 978-1-57477-131-2.
externí odkazy
- Zpráva ICTV: Filoviridae
- " Filoviridae " . Prohlížeč taxonomie NCBI . 11266.
- „ FILOVIR “ . Vědecké zdroje pro výzkum filovirů.
- Teoretický důkaz, že kmen viru Ebola zaire může být závislý na selenu: faktor patogeneze a virových ohnisek? Taylor 1995
- Může být selenit konečným inhibitorem eboly a dalších virových infekcí? Lipinski 2015
- Mnoho lidí v západní Africe může být imunní vůči viru Ebola New York Times