Genetická příměs - Genetic admixture
Genetická příměs nastává, když se dříve rozbíhají nebo izolované genetické linie mísí. Admixture má za následek zavedení nových genetických linií do populace.
Příklady
Klimatické cykly usnadňují genetickou příměs v chladných obdobích a genetickou diverzifikaci v teplých obdobích. Přirozené záplavy mohou způsobit genetickou příměs v populacích migrujících druhů ryb. Genetická příměs může mít důležitou roli pro úspěch populací, které kolonizují novou oblast a kříží se s jedinci původních populací.
Mapování
Admixture mapping je metoda genového mapování, která využívá populaci smíšeného původu (smíšená populace) k nalezení genetických lokusů, které přispívají k rozdílům v chorobách nebo jiných fenotypech nalezených mezi různými populacemi předků. Metoda se nejlépe aplikuje na populace s nedávnou příměsí ze dvou populací, které byly dříve geneticky izolovány. Metoda se pokouší korelovat stupeň původu v blízkosti genetického lokusu s požadovaným fenotypem nebo nemocí. V celém genomu jsou potřeba genetické markery, které se liší frekvencí mezi rodovými populacemi.
Mapování příměsí je založeno na předpokladu, že rozdíly v míře onemocnění nebo fenotypech jsou částečně způsobeny rozdíly ve frekvencích genetických variant způsobujících onemocnění nebo fenotypy mezi populacemi. Ve smíšené populaci se tyto kauzální varianty vyskytují častěji na chromozomálních segmentech zděděných z té či oné rodové populace. První skeny příměsí byly publikovány v roce 2005 a od té doby byly zmapovány genetické přispěvatele k různým rozdílům mezi chorobami a rysy. Do roku 2010 byly pro Afričany, Latino/Hispanics a Ujgury postaveny mapovací panely s vysokou hustotou .
Viz také
Reference
Další čtení
- Plešatění (2007). „Glosář genetických pojmů“ . Příručka statistické genetiky, svazek 1 . ISBN 978-0-470-05830-5.
- Foulkes (28. dubna 2009). „Slovníček pojmů“ . Aplikovaná statistická genetika s R: Pro populační asociační studie . p. 250. ISBN 978-0-387-89553-6.
- Kámen; et al. (2007). „Slovníček pojmů“ . Geny, kultura a evoluce člověka: syntéza . ISBN 978-1-4051-5089-7.
- Kolbe JJ, Glor RE, Schettino LR, Lara AC, Losos AL, Losos JB (2004) Genetická variabilita se zvyšuje během biologické invaze kubánského ještěra . Nature 431: 171-181
- Lenormand T (2002). Tok genů a limity přirozeného výběru . Trendy v ekologii a evoluci. 17: 183-189
- Shriner 2013, „Přehled mapování příměsí“