Prohlížeč genomu - Genome browser

V bioinformatice je prohlížeč genomu grafickým rozhraním pro zobrazení informací z biologické databáze pro genomová data. Prohlížeče genomu umožňují vědcům vizualizovat a procházet celé genomy s anotovanými daty, včetně predikce a struktury genů, proteinů, exprese, regulace, variací, srovnávací analýzy atd. Anotovaná data jsou obvykle z různých zdrojů. Liší se od běžných biologických databází v tom, že zobrazují data v grafickém formátu, se souřadnicemi genomu na jedné ose s anotacemi nebo grafikou vyplňující prostor pro zobrazení analýz genů, jako je frekvence genů, jejich profily exprese atd.

K dispozici je velké množství prohlížečů genomu, mnoho z nich zdarma a s databází přístupnou online. Mezi nejznámější patří UCSC Genome Browser , Ensembl Genome Browser a NCBI 's Genome Data Viewer. Tyto prohlížeče genomu mohou podporovat více genomů, jiné prohlížeče genomu však mohou být specifické pro konkrétní druhy. Tyto prohlížeče mohou poskytovat souhrn údajů z genomových databází a srovnávací hodnocení různých genetických sekvencí u různých druhů a umožňují vizualizaci dat různými způsoby, aby se usnadnilo hodnocení a interpretace těchto komplexních údajů.

Reference