Haploskupina R1 - Haplogroup R1

*Haploskupina R1*
Haploskupina R1
Možné místo původu	Sibiř , Střední Asie .
Předek	R (R-M207)
Potomci	R1a (M420), R1b (M343)
Definování mutací	M173/P241/Page29, CTS916/M611/PF5859, CTS997/M612/PF6111, CTS1913/M654, CTS2565/M663, CTS2680, CTS2908/M666/PF6123, CTS3123/M670, CTS3321/M673, CTS3321/M673 CTS7085/M716/Y481, CTS8116/M730, F93/M621/PF6114, F102/M625/PF6116, F132/M632, F211/Y290, F245/M659/Y477, FGC189/Y305, L875/M706/PF6 M785/YSC0000230, M306/PF6147/S1, M640/PF6118, M643, M689, M691/CTS4862/PF6042/YSC0001281, M710/PF6132/YSC0000192, M748/YSC0000207, P231, P781, P2 PF6115, P242/PF6113, P245/PF6117, P286/PF6136, P294/PF6112, PF6120

Haploskupina R1 nebo R-M173 je haploskupina DNA chromozomu DNA . Primární podtřída Haploskupiny R (R-M207) je definována SNP M173. Druhou primární podskupinou Haplogroup R je Haplogroup R2 (R-M479).

Muži nesoucí R-M173 v moderních populacích se zdají zahrnovat dva subclades: R1a a R1b , které se nacházejí hlavně v populacích původních v Eurasii (kromě východní a jihovýchodní Asie ). R-M173 obsahuje většinu zástupců haploskupiny R ve formě jejích subclades, R1a a R1b ( Rosser 2000 , Semino 2000 a Genographic 2011 ).

Struktura

Fylogenetický strom lidské Y-DNA

Haploskupina R1

M173 (R1)

M420 (R1a)

M459 (R1a1)

M512	(R1a1a)

	(R1a1*)

	(R1a*)

M343 (R1b)

L278 (R1b1)

L754	(R1b1a)

M335	(R1b1b)

PH155	(R1b1c)

(R1b*)

Původy

Původ haploskupiny R1 zůstává nejasný. On a jeho sourozenecký klade R2 (R-M79) jsou jedinými bezprostředními potomky Haplogroup R (R-M207). R je přímým potomkem Haplogroup P1 (P-M45), a sourozeneckým kladem tedy Haplogroup Q (Q-M242).

Starověký záznam DNA ukazuje, že nejranější R* se objevují v kultuře Sallia Malpata-Bureta v mladém paleolitu před 24 tisíci lety, což představuje starověký severní Eurasian . Následně se R1a objevuje v mezolitické východní Evropě mezi východními lovci a sběrači s genotypem odvozeným z velké části od starověkých severoevropanů.

Obecná distribuce

Eurasie

Haploskupina R1 je velmi běžná v celé Eurasii kromě východní Asie a jihovýchodní Asie . Předpokládá se, že její distribuce je spojena s opětovným osídlením Eurasie po posledním glaciálním maximu . Jeho hlavní podskupiny jsou R1a a R1b . Jedna podskupina haploskupiny R1b (zejména R1b1a2) je nejběžnější haploskupinou v západní Evropě a Baškortostánu ( Lobov 2009 ) , zatímco podskupina haploskupiny R1a (zejména haploskupina R1a1 ) je nejběžnější haploskupinou ve velkých částech jižní Asie , východní Evropy , Střední Asii , Západní Čínu a Jižní Sibiř .

Jedinci, jejichž chromozomy Y mají všechny mutace na vnitřních uzlech stromu Y-DNA až do M207 (který definuje Haploskupinu R ) včetně, ale kteří nevykazují ani mutaci M173, která definuje haploskupinu R1, ani mutaci M479, která definuje Haploskupinu R2, jsou zařazeni do této kategorie. jako patřící do skupiny R * (R-M207). R* bylo nalezeno v 10,3% (10/97) vzorku Burusho a 6,8% (3/44) ve vzorku Kalash ze severního Pákistánu ( Firasat 2007 ) .

Amerika

Přítomnost haploskupiny R1 mezi skupinami domorodých Američanů je předmětem kontroverzí. Nyní je po různých Q-M242 nejběžnější haploskupinou , zejména v Severní Americe u lidí Ojibwe na 79%, Chipewyan 62%, Seminole 50%, Cherokee 47%, Dogrib 40%a Tohono O'odham 38%.

Některé úřady poukazují na větší podobnost mezi podtypy haploskupiny R1 nalezenými v Severní Americe a těmi, které se nacházejí na Sibiři (např. Lell a Raghavan), což naznačuje prehistorickou imigraci z Asie a/nebo Beringie .

Afrika

Jeden subclade, nyní známý jako R1b1a2 (R-V88), se nachází pouze na vysokých frekvencích mezi populacemi původem ze západní Afriky , jako jsou Fulani , a věří se, že odráží prehistorickou zpětnou migraci z Eurasie do Afriky.

Distribuce subclade

R1a (R-M420)

Rozdělení R1a (M420) se počítá přibližně před 25 000 lety (95% CI: 21, 300–29 000 000 BP), neboli zhruba posledním ledovcovým maximem . Velká studie provedená v roce 2014 (Underhill et al. 2015) s použitím 16 244 jedinců z více než 126 populací z celé Eurasie dospěla k závěru, že existují přesvědčivé důkazy, že „počáteční epizody diverzifikace haploskupiny R1a se pravděpodobně vyskytly v blízkosti dnešního Íránu . " Subclade M417 (R1a1a1) diverzifikoval ca. Před 5 800 lety. Distribuce M417 subclades R1-Z282 (včetně R1-Z280) ve střední a východní Evropě a R1-Z93 v Asii naznačuje, že R1a1a se diverzifikovala v rámci euroasijských stepí nebo oblasti Blízkého východu a Kavkazu . Místo původu těchto subclades hraje roli v debatě o původu Indoevropanů . Vysoké frekvence haploskupiny R1a se nacházejí mezi West Bengal Brahmins (72%), a Uttarpradéš Brahmins, (67%), ve Ishkashimi (68%), ve Tajik populace Panjikent (64%), ve kyrgyzského populace střední Kyrgyzstán ( 63,5%), Srbové (63,39%), Bihar Brahmins (60,53%), Shors (58,8%), Poláci (56,4%), Teleuts (55,3%), Jižní Altaj (58,1%), Ukrajinci (50%) a Rusové ( 50%) ( Semino 2000 , Wells 2001 , Behar 2003 a Sharma 2007 ).

R1b (R-M343)

Haploskupina R1b pravděpodobně vznikla v Eurasii před nebo během posledního zalednění. Jedná se o nejběžnější haploskupinu v západní Evropě a Baškortostánu . ( Lobov 2009 ) Možná přežilo poslední ledovcové maximum , v refugii poblíž jižního pohoří Ural a Egejského moře . ( Lobov 2009 ) .

Je také přítomen v nižších frekvencích v celé východní Evropě, s vyšší diverzitou než v západní Evropě, což naznačuje starověkou migraci haploskupiny R1b z východu. Haploskupina R1b se také vyskytuje na různých frekvencích v mnoha různých populacích v blízkosti pohoří Ural a střední Asie , což je pravděpodobná oblast původu.

Mezi touto haploskupinou a šířením indoevropských jazyků větve Centum v jižní a západní Evropě může existovat korelace . Například moderní výskyt R1b dosahuje mezi 60% a 90% mužské populace ve většině částí Španělska , Portugalska , Francie , Británie a Irska . Clade se také vyskytuje na frekvencích až 90% v Čadské pánvi a je také přítomen v severní Africe , kde jeho frekvence v některých částech Alžírska přesahuje 10% .

Ačkoli je v jižní Asii vzácný , některé populace vykazují relativně vysoké procento R1b. Patří sem Lambadi vykazující 37% ( Kivisild 2005 ) , Hazara 32% ( Sengupta 2005 ) a Agharia (ve východní Indii ) na 30% ( Sengupta 2005 ) . Kromě toho se R1b objevil v Balochi (8%), Bengalis (6,5%), Chenchu (2%), Makrani (5%), Newars (10,6%), Pallan (3,5%) a Punjabis (7,6%) ( Kivisild 2003 , Sengupta 2005 a Gayden 2007 ).

R-M343 (dříve Hg1 a Eu18 ) je nejčastější haploskupinou chromozomů Y v Evropě . Je to odnož R-M173, charakterizovaná markerem M343 . Drtivá většina členů R-M343 je klasifikována jako R-P25 (definováno značkou P25), zbytek jako R-M343* . Jeho četnost je nejvyšší v západní Evropě (a díky moderní evropské imigraci v některých částech Ameriky ). Většina nosičů R-M343 evropského původu patří do potomkové linie R-M269 (R1b1a2).

V populární kultuře

Fiktivní Animace Artem Lukichev spojuje historii R1, R1a a R1b na tradiční epos z Baškirština lidu těchto Uralu .

Viz také

Historie Eurasie

Genetika

Y-DNA R-M207 subclades

Reference

Citované práce

Gayden, T; Cadenas, AM; Regueiro, M; Singh, NB; Zhivotovsky, LA; Underhill, PA; Cavalli-Sforza, LL; Herrera, RJ (2007), „Himálaj jako směrová bariéra toku genů.“, American Journal of Human Genetics , 80 (5): 884–94, doi : 10.1086/516757 , PMC 1852741 , PMID 17436243
Behar; Thomas, MG; Skorecki, K; Hammer, MF; Bulygina, E; Rosengarten, D; Jones, AL; Držel, K; Moses, V (2003), „Multiple Origins of Ashkenazi Levites: Y Chromosome Evidence for both Near Eastern and European Ancestries“ (PDF) , Am. J. Hum. Genet. , 73 (4), s. 768–779, doi : 10,1086/378506 , PMC 1180600 , PMID 13680527
Luigi Luca Cavalli-Sforza (1994), The History and Geography of Human Genes , Princeton University Press, ISBN 978-0-691-08750-4
Cinnioğlu, C; a kol. (2004), „Excavating Y-chromosome haplotype vrstva in Anatolia“, Hum Genet , 114 (2): 127–48, doi : 10,1007/s00439-003-1031-4 , PMID 14586639 , S2CID 10763736
Passarino; a kol. (2002), „Různé genetické složky v norské populaci odhalené analýzou polymorfismů mtDNA a chromozomů Y“, Eur. J. Hum. Genet. , 10 (9), s. 521–9, doi : 10,1038/sj.ejhg.5200834 , PMID 12173029
Saha; a kol. (2005), „Genetická afinita mezi pěti různými populačními skupinami v Indii odrážející tok genů chromozomu Y“, J. Hum. Genet. , 50 (1), s. 49–51, doi : 10,1007/s10038-004-0219-3 , PMID 15611834
Semino; a kol. (2000), "genetická Legacy paleolitických Homo sapiens sapiens v dochovaných Evropanů" (PDF) , Science , 290 (5494), pp 1155-9,. Doi : 10,1126 / science.290.5494.1155 , PMID 11073453 , archivovat z originál (PDF) ze dne 2003-11-25
Sengupta; a kol. (2005), „Polarita a dočasnost distribucí chromozomů Y s vysokým rozlišením v Indii identifikuje jak domorodé, tak exogenní expanze a odhaluje menší genetický vliv středoasijských pastevců“, Am. J. Hum. Genet. , 78 (2), s. 202–21, doi : 10,1086/499411 , PMC 1380230 , PMID 16400607
Soares; a kol. (2010), "The Archaeogenetics of Europe", Current Biology , 20 (4): R174–83, doi : 10.1016/j.cub.2009.11.054 , PMID 20178764 , S2CID 7679921
Studny; a kol. (2001), "The Euroasian Heartland: Kontinentální pohled na rozmanitost chromozomů Y", Proc. Natl. Akadem. Sci. USA , 98 (18), s. 10244–9, Bibcode : 2001PNAS ... 9810244W , doi : 10,1073/pnas.171305098 , PMC 56946 , PMID 11526236. Také [1]