Severní úsek, nazývaný také Spuyten Duyvil („chrlící ďábel“) , byl pro navigační účely výrazně změněn. Původně se zakřivovalo kolem severu Marble Hill , ale v roce 1895 byl mezi Manhattanem a Marble Hill vykopán Harlem River Ship Canal a v roce 1914 byl původní kurz vyplněn.
Harlem River byl tradiční veslařský kurz pro New York, analogický s Charles River v Bostonu a Schuylkill River ve Philadelphii . Na břehu Harlemu je loděnice pro posádku Kolumbijské univerzity a řeka je domovským kurzem pro univerzitní posádku. Od roku 1952 je velká plochá skalní stěna, nazývaná „(velká) C skála“, namalována kolumbijským univerzitním „C“. Na řece jsou také loděnice Peter Jay Sharp Boathouse a Harlem River Community Rowing, dvě komunitní veslařská zařízení. Řeku používají posádky z New York University , Fordham University a Manhattan College , ačkoli jedinou univerzitou se stálým zařízením na řece je Columbia.
Historicky byl západní břeh řeky Harlem také zábavní destinací. Oblast mezi 190. a 192. ulicí byla v letech 1895 až 1914 obsazena zábavním parkem Fort George , trolejbusovým / zábavním parkem . Jeho místo je nyní místem k sezení v Highbridge Parku . V devadesátých letech 19. století postavilo město New York závodní dráhu pro koně, Harlem River Speedway , podél břehu parku; projekt byl zahájen v roce 1894 a otevřen v červenci 1898. Ze Speedway se později stal Harlem River Drive a pravidelní motoristé byli poprvé vpuštěni na pohon v roce 1919.
Řeka Harlem je překlenuta sedmi výkyvnými mosty, třemi výtahovými mosty a čtyřmi obloukovými mosty a je splavná na jakékoli lodi s méně než 55 stop (16,8 m) vzdušného tahu . Každá loď vyžadující volný prostor větší než 1,5 metru však bude vyžadovat, aby se otevřel most Spuyten Duyvil . Všechny ostatní pohyblivé mosty na řece Harlem poskytují v zavřeném stavu minimálně 7,3 m volný prostor, takže lodím a lodím vyžadujícím volný prostor 1,5 až 7,3 m stačí mít otevřenou pouze jednu houpačku mostu. Tyto mosty nahradily na konci 19. století pevné nebo dolní mosty, aby se zlepšila navigace. High Bridge byl postaven v letech 1837 až 1848, aby přenesl krotónský akvadukt přes řeku. Jedná se o nejstarší most v New Yorku.
New York City Ministerstvo dopravy sděluje, že zatímco oni vyvinou veškeré úsilí, aby zajistila, že všechny mosty jsou v provozu, mnohé z nich jsou v opravě kdykoli, i mimo ně dodavatelé jsou odpovědni za otevření mostů v rámci opravy.