Lidská mitochondriální haploskupina DNA - Human mitochondrial DNA haplogroup
V lidské genetiky , je humánní mitochondriální DNA Haplogroup je haplogroup definován rozdílů v humánní mitochondriální DNA . Haploskupiny se používají k reprezentaci hlavních větvových bodů mitochondriálního fylogenetického stromu. Pochopení evoluční cesty ženské linie pomohlo populačním genetikům vysledovat matrilineární dědičnost moderních lidí zpět k lidskému původu v Africe a následné šíření po celém světě.
Názvy písmen haploskupin (nejen haploskupin mitochondriální DNA) probíhají od A do Z. Protože haploskupiny byly pojmenovány podle pořadí jejich objevu, nemá abecední uspořádání žádný význam, pokud jde o skutečné genetické vztahy.
Hypotetická žena u kořene všech těchto skupin (což znamená jen mitochondriální haploskupiny DNA) je matrilineálním nejnovějším společným předkem (MRCA) pro všechny v současnosti žijící lidi . Běžně se jí říká mitochondriální Eva .
Rychlost, kterou mitochondriální DNA mutuje, je známá jako mitochondriální molekulární hodiny . Jedná se o oblast probíhajícího výzkumu, kdy jedna studie uvádí jednu mutaci za 8000 let.
Fylogeneze
Část série na |
Genetická genealogie |
---|
Pojmy |
související témata |
Tento fylogenetický strom je založen na Van Oven (2009).
- L ( mitochondriální Eva )
Chronologie
Haploskupina | Est. čas vzniku ( kya ) | Možné místo původu | Nejvyšší frekvence |
---|---|---|---|
L | 200 | ||
L1-6 | 170 | východní Afrika | |
L2-6 | 150 | východní Afrika | |
L0 | 150 | východní Afrika | |
L1 | 140 | Střední Afrika | |
L3-6 | 130 | ||
L5 | 120 | ||
L2 | 90 | ||
L3 | 70 | východní Afrika | |
N. | 70 | Východní Afrika nebo západní Asie | |
M | 60 | Východní Afrika, západní Asie nebo jižní Asie | |
R. | 60 | ||
U | 55 | Severovýchodní Afrika nebo Indie (jižní Asie) | |
RT'JT | 55 | střední východ | |
JT | 50 | střední východ | |
U8 | 50 | Západní Asii | |
R9 | 47 | ||
B4 | 44 | ||
F | 43 | ||
U4'9 | 42 | Střední Asie | |
U5 | 35 | Západní Asii | |
U6 | 35 | Severní Afrika | |
J. | 35 | ||
X | 30 | ||
K | 30 | ||
U5a | 27 | ||
HV | 27 | Blízký východ | |
J1a | 27 | Blízký východ | |
T | 27 | Mezopotámie | |
K1 | 27 | ||
Já | 26 | ||
J1 | 24 | Blízký východ | |
W | 20 | ||
U4 | 20 | Střední Asie | |
X2 | 20 | ||
H | 20 | Západní Asii | |
U5a1 | 18 | Evropa | |
J1b | 11 | ||
PROTI | 14 | ||
X2a | 13 | Severní Amerika | |
H1 | 12 | ||
H3 | 12 | ||
X1 | 10 |
Geografická distribuce
Dokument z roku 2004 naznačil, že nejběžnější haploskupiny v moderní evropské populaci byly: H, J, K, N1, T, U4, U5, V, X a W.
Africké haploskupiny: L0, L1, L2, L3, L4, L5, L6, T, U5a
Australské haploskupiny: M42a, M42c, M14, M15, Q, S, O, N, P. (odkazy 1, 2, 3, 4, 5, 6)
Asijské haploskupiny: F, C, W, M, D, N, K, U, T, A, B, C, Z, U mnoho číselných variant pro každou sekci
Viz také
- Lidská mitochondriální genetika
- Genetická genealogie
- Matrilineálnost
- Haploskupiny DNA lidského chromozomu Y
- Populační genetika
Reference
- ^ Rishishwar L, Jordan IK (2017). „Důsledky lidské evoluce a příměsi pro mitochondriální substituční terapii“ . BMC genomika . 18 (1): 140. doi : 10,1186/s12864-017-3539-3 . PMC 5299762 . PMID 28178941 .
- ^ Loogvali, Eva-Liis; Kivisild, Toomas; Margus, Tõnu; Villems, Richard (2009), O'Rourke, Dennis (ed.), „Explaining the Imperfection of the Molecular Clock of Hominid Mitochondria“, PLOS ONE , 4 (12): e8260, Bibcode : 2009PLoSO ... 4.8260L , doi : 10.1371/journal.pone.000826060 , PMC 2794369 , PMID 20041137
- ^ Kivisild T (2015). „Mateřský původ a populační historie z celých mitochondriálních genomů“ . Investig Genet . 6 : 3. doi : 10,1186/s13323-015-0022-2 . PMC 4367903 . PMID 25798216 .
- ^ a b van Oven M, Kayser M (únor 2009). „Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA“ . Lidská mutace . 30 (2): E386–94. doi : 10,1002/humu.20921 . PMID 18853457 . S2CID 27566749 .
-
^ "Oprava pro očištění výběru: Vylepšené lidské mitochondriální molekulární hodiny doplňkové" (PDF) . 2009: 82–83 [89]. Archivováno z originálu (PDF) dne 2009-12-29.
Citační deník vyžaduje
|journal=
( nápověda ) - ^ Villems, Richard; Usanga, Esien; Mikerezi, Ilia; Gölge, Mukaddes; Claustres, Mireille; Michalodimitrakis, Emmanuel N .; Pappa, Kalliopi I .; Anagnou, Nicholas P .; Chaventré, André; Moisan, Jean-Paul; Richard, Christelle; Grechanina, Elena; Balanovská, Elena V .; Rudan, Pavao; Puzyrev, Valery; Stepanov, Vadim; Khusnutdinova, Elsa K .; Gusar, Vladislava; Balanovský, Oleg P .; Peričić, Marijana; Barać, Lovorka; Golubenko, Maria; Lunkina, Arina; Laos, Sirle; Pennarun, Erwan; Parik, Jüri; Tolk, Helle-Viivi; Reidla, Maere; Tambets, Kristiina; Metspalu, Ene; Kivisild, Toomas; Derenko, Miroslava V .; Malyarchuk, Boris A .; Roostalu, Urmas; Loogväli, Eva-Liis (1. listopadu 2004). „Rozporuplná uniformita: svrchní kladistické plátno mtDNA haploskupiny H v Eurasii“ . Molekulární biologie a evoluce . 21 (11): 2012–2021. doi : 10,1093/molbev/msh209 . PMID 15254257 - přes academy.oup.com .
externí odkazy
- Mitochondriální fylogenetické stromy
-
Kostra mitochondriální haploskupiny
- Motivy mitochondriální haploskupiny Vincenta Macaulaye
- Seznam projektů haploskupiny mtDNA
- MitoTool: webový server pro analýzu a získávání variací sekvence lidské mitochondriální DNA
- HaploGrep: stanovení haploskupiny mtDNA na základě PhyloTree.org
- HaploFind - rychlé automatické přiřazení haploskupiny pro lidskou mitochondriální DNA
Fylogenetický strom haploskupin lidské mitochondriální DNA (mtDNA) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mitochondriální Eva ( L ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L0 | L1–6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L1 | L2 | L3 | L4 | L5 | L6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
M | N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CZ | D | E | G | Otázka | Ó | A | S | R. | Já | W | X | Y | |||||||||||||||||||||||||||
C | Z | B | F | R0 | před JT | P | U | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HV | JT | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
H | PROTI | J. | T |