Medicago truncatula - Medicago truncatula

Medicago truncatula
Pobočka Medicago truncatula A17.JPG
Vědecká klasifikace
Království:
Plantae
(bez hodnocení):
Krytosemenné rostliny
(bez hodnocení):
Eudicots
(bez hodnocení):
Rosidy
Objednat:
Fabales
Rodina:
Fabaceae
Podčeleď:
Faboideae
Kmen:
Trifolieae
Rod:
Medicago
Druh:
M. truncatula
Binomické jméno
Medicago truncatula
Synonyma

Medicago tribuloides Desr.
Medicago tribuloides var. breviaculeata Moris
Medicago truncatula var. breviaculeata (Moris) Urb.
Medicago truncatula var. longiaculeata Urb.
Medicago truncatula var. tribuloides (Desr.) Burnat
Medicago truncatula f. tricycla Nègre
Medicago truncatula var. tricycla (Nègre) Heyn

Medicago truncatula se barrelclover , silný-spined tolice , barel zdravotník , nebo sud tolice , je malý roční lusk domácí v středomořské oblasti, která se používá v genomové výzkumu. Je to nízko rostoucí, jetelovitá rostlina vysoká 10–60 cm (3,9–23,6 palce) s trojlistými listy . Každý leták je zaoblený, dlouhý 1–2 centimetry (0,39–0,79 palce), často s tmavou skvrnou uprostřed. Tyto květy jsou žluté, vyrobené jednotlivě nebo v malé květenství dvou až pěti dohromady; plod je malý, ostnatý pod.

Tento druh je studován jako modelový organismus pro biologii luštěnin, protože má malý diploidní genom , je samoplodný, má rychlou generační dobu a plodnou produkci semen, je schopen genetické transformace a jeho genom byl sekvenován.

Vytváří symbiózy s rhizobií fixující dusík ( Sinorhizobium meliloti a Sinorhizobium medicae ) a arbuskulárními mykorhizními houbami včetně Rhizophagusregularisis (dříve Glomus intraradices ). Modelová rostlina Arabidopsis thaliana netvoří ani symbiózu, takže M. truncatula je důležitým nástrojem pro studium těchto procesů.

Je také důležitým druhem pícnin v Austrálii .

Sekvenování genomu

Návrh sekvence genomu kultivaru M. truncatula A17 byl publikován v časopise Nature v roce 2011.

Sekvencování bylo provedeno na základě mezinárodního partnerství výzkumných laboratoří zahrnují výzkumníky z University of Oklahoma (USA), J. Craig Venter Institute (USA), Genoscope (Francie), a Sanger Centre (UK). Mezi partnerské instituce patřily University of Minnesota (USA), University of California-Davis (USA), National Center for Genomic Resources (USA), John Innes Center (UK), Institut National de Recherche Agronomique (Francie), Mnichovské informační centrum pro Protein Sequences (Německo), Wageningen University (Nizozemsko) a Ghent University (Belgie). Medicago truncatula Sekvenování Consortium byla zahájena v roce 2001 s dotací osiva od Samuel Roberts Noble Foundation. V roce 2003 začala většinu financování poskytovat Národní vědecká nadace a 6. rámcový program Evropské unie. Do roku 2009 bylo dokončeno 84% shromáždění genomu.

Sestavení sekvence genomu v M. truncatula bylo založeno na bakteriálních umělých chromozomech (BAC). Jedná se o stejný přístup, který se používá k sekvenování genomů člověka, ovocné mouchy, Drosophila melanogaster a modelové rostliny, Arabidopsis thaliana . V červenci 2013 byla vydána verze 4.0 genomu. Tato verze kombinovala sekvence získané sekvenováním brokovnic se sekvenčními sestavami založenými na BAC, což pomohlo vyplnit mezery v dříve mapovaných sekvencích.

Paralelní skupina známá jako International Medicago Gene Annotation Group ( IMGAG ) je zodpovědná za identifikaci a popis domnělých genových sekvencí v genomové sekvenci.

Symbiózy s půdními mikroorganismy

Výzkumník Toby Kiers z VU University Amsterdam a spolupracovníci použili M. truncatula ke studiu symbióz mezi rostlinami a houbami - a ke zjištění, zda mohou partneři ve vztahu rozlišovat mezi dobrými a špatnými obchodníky / dodavateli. Použitím značeného uhlíku ke sledování zdroje živin protékajících arbuskulárním mykorhizním systémem vědci prokázali, že rostliny skutečně poskytly více uhlíku štědrým druhům hub. Omezením množství uhlíku, které rostliny daly houbě, vědci také prokázali, že houby předávaly více svého fosforu štědrým rostlinám.

Viz také

Reference

Další čtení

Courty, Pierre Emmanuel; Smith, Penelope; Koegel, Sally; Redecker, Dirk; Wipf, Daniel (1. června 2015). „Příjem a transport anorganického dusíku v prospěšných interakcích kořen-mikrob s rostlinou“. Kritické recenze v rostlinných vědách . 34 (1–3): 4–16. doi : 10.1080 / 07352689.2014.897897 . S2CID   85772198 .

externí odkazy