Neomura - Neomura
Neomura je možné clade složený ze dvou domén života z Archaea a Eukaryota . Skupinu pojmenoval Thomas Cavalier-Smith v roce 2002. Její název znamená „nové stěny“, což odráží jeho hypotézu, že se vyvinula z bakterií , a jednou z hlavních změn bylo nahrazení buněčných stěn peptidoglykanu jinými glykoproteiny . V srpnu 2017 neomuranská hypotéza není většinou pracovníků akceptována; molekulární fylogenetie naznačují, že eukaryoty jsou nejblíže příbuzné jedné skupině archaeanů a vyvinuly se z nich, než aby tvořily clade se všemi archaeany.
Morfologie
Neomura, považovaná za kladu, je velmi různorodá skupina, která obsahuje všechny mnohobuněčné druhy a také nejextrémofilnější druhy, ale všechny sdílejí určité molekulární charakteristiky. Všechny neomurany mají histony, které pomáhají při balení chromozomů , a většina z nich má introny . Všichni používají molekulu methionin jako iniciátorovou aminokyselinu pro syntézu bílkovin (bakterie používají formylmethionin ). Nakonec všichni neomurané používají několik druhů RNA polymerázy , zatímco bakterie používají pouze jednu.
Fylogeneze
Existuje několik hypotéz o fylogenetických vztazích mezi archaejci a eukaryoty.
Zobrazení ve třech doménách
Když Carl Woese v roce 1990 poprvé publikoval svůj systém tří domén , věřilo se, že domény Bacteria , Archaea a Eukaryota jsou stejně staré a stejně příbuzné na stromě života. Nicméně určité důkazy začaly naznačovat, že Eukaryota a Archaea jsou si navzájem bližší než s bakteriemi. Tento důkaz zahrnoval běžné používání cholesterolu a proteazomů , což jsou složité molekuly, které se ve většině bakterií nenacházejí, což vedlo k závěru, že kořen života leží mezi bakteriemi na jedné straně a Archaea a Eukaryota na straně druhé, tj. byly dvě primární větve života následující po LUCA - Bakterie a Neomura (tehdy ještě neoznačené tímto názvem).
|
|||||||||||||
Scénář „tří primárních domén“ (3D) byl jednou ze dvou hypotéz, které byly v přehledu původu eukaryot v roce 2010 považovány za věrohodné.
Odvozený pohled na clade
V dokumentu z roku 2002 a v dalších článcích Thomas Cavalier-Smith a spolupracovníci vyhlásili hypotézu, že Neomura byla kladu hluboce zasazenou do Eubacteria s Actinobacteria jako sesterskou skupinou. Napsal: „Eukaryoty a archebakterie tvoří clade neomura a jsou sestrami, jak je rozhodujícím způsobem prokázáno geny fragmentovanými pouze v archaebakteriích a mnoha sekvenčních stromech. Toto sesterstvo vyvrací všechny teorie, které eukaryoty vznikly sloučením archeobakterií a α-proteobakterií, které také nezohledňují řadu funkcí sdílených konkrétně eukaryoty a aktinobakteriemi. "
Patří sem přítomnost cholesterolu a proteazomů u Actinobacteria i Neomura. Rysy této složitosti se pravděpodobně nebudou vyvíjet více než jednou v samostatných větvích, takže buď došlo k horizontálnímu přenosu těchto dvou cest, nebo se Neomura vyvinula z této konkrétní větve bakteriálního stromu.
LUCA |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zobrazení dvou domén
Již v roce 2010 byl hlavním konkurentem scénáře tří domén původu eukaryot scénář „dvou domén“ (2D), ve kterém se eukaryoty vynořily z archaea. Objev hlavní skupiny v Archaea, Lokiarchaeota , ke kterému jsou eukaryoty geneticky podobnější než k jiným archaejcům, není v souladu s hypotézou Neomura. Místo toho podporuje hypotézu, že eukaryoty vzešly z jedné skupiny archaeanů:
|
Archaea
|
2D studie podporuje studie z roku 2016 s použitím 16 univerzálně konzervovaných ribozomálních proteinů . Jeho „nový pohled na strom života“ ukazuje eukaryoty jako malou skupinu vnořenou do Archaea, zejména do TACK superphylum. Původ eukaryot však zůstává nevyřešen a scénáře dvou domén a tří domén zůstávají životaschopnými hypotézami.
Viz také
Reference
Další čtení
- Cavalier-Smith T (1987). „Původ eukaryotických a archeobakteriálních buněk“. Ann. NY Acad. Sci . 503 : 17–54. doi : 10.1111/j.1749-6632.1987.tb40596.x . PMID 3113314 . S2CID 38405158 .
- Cavalier-Smith T (leden 2002). „Neomuranský původ archebakterií, negibakteriální kořen univerzálního stromu a bakteriální megaklasifikace“ . Int. J. Syst. Evol. Mikrobiol . 52 (Pt 1): 7–76. doi : 10,1099/00207713-52-1-7 . PMID 11837318 .
- Cavalier-Smith T (2006). „Zakořenění stromu života pomocí přechodových analýz“ . Biol. Přímo . 1 : 19. doi : 10,1186/1745-6150-1-19 . PMC 1586193 . PMID 16834776 .
- Skophammer RG, Servin JA, Herbold CW, Lake JA (srpen 2007). „Důkaz pro grampozitivní, eubakteriální kořen stromu života“ . Mol. Biol. Evol . 24 (8): 1761–8. doi : 10,1093/molbev/msm096 . PMID 17513883 .
- Cox, CJ; Foster, PG; Mikina, RP; Harris, SR; Embley, TM (10. prosince 2008). „Archebakteriální původ eukaryot“ (PDF) . Sborník Národní akademie věd . 105 (51): 20356–20361. doi : 10,1073/pnas.0810647105 . PMC 2629343 . PMID 19073919 .
- Cavalier-Smith, T. (2. září 2014). „Neomuranská revoluce a fagotrofický původ eukaryot a cilií ve světle nitrobuněčné koevoluce a revidovaného stromu života“ . Perspektivy studeného jarního přístavu v biologii . 6 (9): a016006. doi : 10,1101/cshperspect.a016006 . PMC 4142966 . PMID 25183828 .