Neomura - Neomura

Shluk buněk Halobacterium sp. kmen NRC-1, archaean

Neomura je možné clade složený ze dvou domén života z Archaea a Eukaryota . Skupinu pojmenoval Thomas Cavalier-Smith v roce 2002. Její název znamená „nové stěny“, což odráží jeho hypotézu, že se vyvinula z bakterií , a jednou z hlavních změn bylo nahrazení buněčných stěn peptidoglykanu jinými glykoproteiny . V srpnu 2017 neomuranská hypotéza není většinou pracovníků akceptována; molekulární fylogenetie naznačují, že eukaryoty jsou nejblíže příbuzné jedné skupině archaeanů a vyvinuly se z nich, než aby tvořily clade se všemi archaeany.

Morfologie

Neomura, považovaná za kladu, je velmi různorodá skupina, která obsahuje všechny mnohobuněčné druhy a také nejextrémofilnější druhy, ale všechny sdílejí určité molekulární charakteristiky. Všechny neomurany mají histony, které pomáhají při balení chromozomů , a většina z nich má introny . Všichni používají molekulu methionin jako iniciátorovou aminokyselinu pro syntézu bílkovin (bakterie používají formylmethionin ). Nakonec všichni neomurané používají několik druhů RNA polymerázy , zatímco bakterie používají pouze jednu.

Fylogeneze

Existuje několik hypotéz o fylogenetických vztazích mezi archaejci a eukaryoty.

Zobrazení ve třech doménách

Když Carl Woese v roce 1990 poprvé publikoval svůj systém tří domén , věřilo se, že domény Bacteria , Archaea a Eukaryota jsou stejně staré a stejně příbuzné na stromě života. Nicméně určité důkazy začaly naznačovat, že Eukaryota a Archaea jsou si navzájem bližší než s bakteriemi. Tento důkaz zahrnoval běžné používání cholesterolu a proteazomů , což jsou složité molekuly, které se ve většině bakterií nenacházejí, což vedlo k závěru, že kořen života leží mezi bakteriemi na jedné straně a Archaea a Eukaryota na straně druhé, tj. byly dvě primární větve života následující po LUCA - Bakterie a Neomura (tehdy ještě neoznačené tímto názvem).

Bakterie

(Neomura)

Eukaryota

Archaea

Scénář „tří primárních domén“ (3D) byl jednou ze dvou hypotéz, které byly v přehledu původu eukaryot v roce 2010 považovány za věrohodné.

Odvozený pohled na clade

V dokumentu z roku 2002 a v dalších článcích Thomas Cavalier-Smith a spolupracovníci vyhlásili hypotézu, že Neomura byla kladu hluboce zasazenou do Eubacteria s Actinobacteria jako sesterskou skupinou. Napsal: „Eukaryoty a archebakterie tvoří clade neomura a jsou sestrami, jak je rozhodujícím způsobem prokázáno geny fragmentovanými pouze v archaebakteriích a mnoha sekvenčních stromech. Toto sesterstvo vyvrací všechny teorie, které eukaryoty vznikly sloučením archeobakterií a α-proteobakterií, které také nezohledňují řadu funkcí sdílených konkrétně eukaryoty a aktinobakteriemi. "

Patří sem přítomnost cholesterolu a proteazomů u Actinobacteria i Neomura. Rysy této složitosti se pravděpodobně nebudou vyvíjet více než jednou v samostatných větvích, takže buď došlo k horizontálnímu přenosu těchto dvou cest, nebo se Neomura vyvinula z této konkrétní větve bakteriálního stromu.

LUCA 

Chlorobakterie

Hadobakterie

Sinice

Gracilicutes

Eurybacteria

Endobakterie

Aktinobakterie

 Neomura 

Archaea

Eukaryota

Zobrazení dvou domén

Již v roce 2010 byl hlavním konkurentem scénáře tří domén původu eukaryot scénář „dvou domén“ (2D), ve kterém se eukaryoty vynořily z archaea. Objev hlavní skupiny v Archaea, Lokiarchaeota , ke kterému jsou eukaryoty geneticky podobnější než k jiným archaejcům, není v souladu s hypotézou Neomura. Místo toho podporuje hypotézu, že eukaryoty vzešly z jedné skupiny archaeanů:

Bakterie

Eukaryota

archaejci

archaejci

Archaea

2D studie podporuje studie z roku 2016 s použitím 16 univerzálně konzervovaných ribozomálních proteinů . Jeho „nový pohled na strom života“ ukazuje eukaryoty jako malou skupinu vnořenou do Archaea, zejména do TACK superphylum. Původ eukaryot však zůstává nevyřešen a scénáře dvou domén a tří domén zůstávají životaschopnými hypotézami.

Viz také

Reference

Další čtení