PubMed Central - PubMed Central

PubMed Central
Výrobce United States National Library of Medicine (USA)
Dějiny 2000 do současnosti
Přístup
Náklady Volný, uvolnit
Dosah
Disciplíny Lék
Zaznamenejte hloubku Rejstřík, abstrakt a plný text
Formát pokrytí Články v časopisech
Odkazy
webová stránka https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/
Seznam titulů https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/journals/

PubMed Central ( PMC ) je bezplatné digitální úložiště, které archivuje otevřené přístupy k plným textům vědeckých článků, které byly publikovány v biomedicínských a biologických časopisech. Jako jedna z hlavních výzkumných databází vyvinutých Národním centrem pro biotechnologické informace (NCBI) je PubMed Central více než úložiště dokumentů. Příspěvky do PMC jsou indexovány a formátovány pro vylepšená metadata , lékařskou ontologii a jedinečné identifikátory, které obohacují strukturovaná data XML pro každý článek. Obsah v PMC lze propojit s dalšími databázemi NCBI a získat k němu přístup prostřednictvím vyhledávacích a vyhledávacích systémů Entrez , což dále zvyšuje schopnost veřejnosti objevovat, číst a stavět na svých biomedicínských znalostech.

PubMed Central se liší od PubMed . PubMed Central je bezplatný digitální archiv plných článků, přístupný komukoli a odkudkoli prostřednictvím webového prohlížeče (s různými ustanoveními pro opětovné použití). Naopak, i když je PubMed prohledávatelnou databází biomedicínských citací a abstraktů, fulltextový článek je umístěn kdekoli jinde (v tištěné nebo online podobě, zdarma nebo za předplatitelskou bránou ).

V prosinci 2018 obsahoval archiv PMC více než 5,2 milionu článků, přičemž příspěvky pocházely od vydavatelů nebo autorů, kteří ukládali své rukopisy do úložiště podle zásad NIH Public Access Policy . Dřívější data ukazují, že od ledna 2013 do ledna 2014 vklady iniciované autorem překročily během 12 měsíců 103 000 článků. PMC identifikuje přibližně 4 000 časopisů, které se do určité míry podílejí na uložení jejich publikovaného obsahu do úložiště PMC. Někteří vydavatelé odkládají vydání svých článků v PubMed Central na stanovenou dobu po zveřejnění, která se označuje jako „období embarga“, a to v závislosti na deníku od několika měsíců do několika let. (Nejběžnější jsou embarga na šest až dvanáct měsíců.) PubMed Central je klíčovým příkladem „systematické externí distribuce třetí stranou“, což je stále zakázáno dohodami přispěvatelů mnoha vydavatelů.

Přijetí

Úložiště, které bylo spuštěno v únoru 2000, se rychle rozrostlo, protože politika veřejného přístupu NIH je navržena tak, aby veškerý výzkum financovaný Národními instituty zdraví (NIH) byl volně přístupný komukoli a navíc mnoho vydavatelů spolupracuje s NIH poskytnout bezplatný přístup k jejich dílům. Na konci roku 2007 byl do zákona podepsán zákon o konsolidovaných rozpočtových prostředcích z roku 2008 (HR 2764), který obsahoval ustanovení vyžadující, aby NIH upravila své zásady a vyžadovala zahrnutí úplných elektronických kopií jejich recenzovaného výzkumu a zjištění z NIH financovaných NIH do jejich PubMed Central výzkum. Tyto články musí být zahrnuty do 12 měsíců od zveřejnění. Je to poprvé, co vláda USA požaduje, aby agentura poskytovala otevřený přístup k výzkumu, a jde o vývoj od politiky z roku 2005, kdy NIH požádala vědce, aby dobrovolně přidali svůj výzkum do PubMed Central.

Verze systému PubMed Central ve Velké Británii , UK PubMed Central (UKPMC) , byla vyvinuta společností Wellcome Trust a Britskou knihovnou jako součást devíti silné skupiny výzkumných pracovníků ve Velké Británii. Tento systém byl spuštěn v lednu 2007. Dne 1. listopadu 2012 se stal Evropou PubMed Central . Kanadský člen mezinárodní sítě PubMed Central , PubMed Central Canada , byl spuštěn v říjnu 2009.

National Library of Medicine "NLM Journal Publishing Tag Set" článek v časopise značkovací jazyk je volně k dispozici. Association of Learned a Professional Society Publishers poznamenává, že „je pravděpodobné, aby se stal standardem pro přípravu vědeckého obsahu obou knih a časopisů“. Pro knihy je k dispozici související DTD . Library of Congress a Britská knihovna již oznámila podporu pro NLM DTD. To bylo také oblíbené u poskytovatelů deníkových služeb.

S vydáním plánů veřejného přístupu pro mnoho agentur mimo NIH je PMC v procesu, kdy se stává úložištěm pro širší škálu článků. To zahrnuje obsah NASA s rozhraním označeným jako „PubSpace“.

Technologie

Články jsou do PubMed Central zasílány vydavateli v XML nebo SGML pomocí různých DTD článků . Starší a větší vydavatelé mohou mít vlastní zavedené interní DTD, ale mnoho vydavatelů používá DTD NLM Journal Publishing (viz výše).

Přijaté články jsou převedeny pomocí XSLT na velmi podobný archiv NLM a Interchange DTD. Tento proces může odhalit chyby, které jsou hlášeny zpět vydavateli k opravě. Grafika je také převedena do standardních formátů a velikostí. Původní a převedené formuláře se archivují. Převedený formulář se přesune do relační databáze spolu s přidruženými soubory pro grafiku, multimédia nebo jiná přidružená data. Mnoho vydavatelů také poskytuje soubory PDF svých článků a ty jsou k dispozici beze změny.

Bibliografické citace jsou analyzovány a automaticky propojeny s příslušnými abstrakty v PubMed, články v PubMed Central a zdroji na webech vydavatelů. Odkazy PubMed také vedou na PubMed Central. Nevyřešitelné odkazy, například na deníky nebo konkrétní články, které dosud nejsou k dispozici u některého z těchto zdrojů, jsou sledovány v databázi a automaticky se aktivují, jakmile budou zdroje k dispozici.

Interní indexovací systém poskytuje možnosti vyhledávání a je si vědom biologické a lékařské terminologie , jako jsou obecná a patentovaná léčiva a alternativní názvy pro organismy, nemoci a anatomické části.

Když uživatel přistupuje k číslu časopisu, obsah se automaticky generuje načtením všech článků, dopisů, úvodníků atd. Pro dané číslo. Když je dosaženo skutečné položky, jako je článek, PubMed Central převede označení NLM na HTML pro doručení a poskytuje odkazy na související datové objekty. To je možné, protože rozmanitost příchozích dat byla nejprve převedena na standardní DTD a grafické formáty.

V samostatném toku podání mohou autoři financovaní NIH ukládat články do PubMed Central pomocí NIH Manuscript Submission (NIHMS). Takto odeslané články obvykle procházejí značkami XML, aby mohly být převedeny na NLM DTD.

Recepce

Reakce PubMed Central mezi vědeckou publikační komunitou se pohybují mezi skutečným nadšením některých lidí a obezřetnými obavami ostatních.

Zatímco PMC je vítaným partnerem pro vydavatele s otevřeným přístupem ve své schopnosti rozšířit objevování a šíření biomedicínských znalostí, stejná pravda způsobuje, že se ostatní obávají, že provoz bude odkloněn od zveřejněné verze záznamu , ekonomické důsledky i menší čtenářství jako účinek na udržení komunity vědců v rámci učených společností. Analýza z roku 2013 našla přesvědčivé důkazy o tom, že veřejná úložiště publikovaných článků byla zodpovědná za „odvádění značného počtu čtenářů od webových stránek časopisů“ a že „účinek PMC v průběhu času roste“.

Knihovny, univerzity, příznivci otevřeného přístupu, skupiny prosazující zdraví spotřebitelů a organizace pro práva pacientů tleskali PubMed Central a doufají, že uvidí podobná úložiště veřejného přístupu vyvinutá jinými federálními finančními agenturami, aby mohli svobodně sdílet jakékoli výzkumné publikace, které byly výsledkem podpory daňových poplatníků .

Antelmanova studie publikování s otevřeným přístupem zjistila, že ve filozofii, politologii, elektrotechnickém a elektronickém inženýrství a matematice měly dokumenty s otevřeným přístupem větší dopad na výzkum. Randomizovaná studie zjistila nárůst stahování obsahu dokumentů s otevřeným přístupem, bez citační výhody oproti přístupu k předplatnému jeden rok po zveřejnění.

Zásady NIH a práce v úložišti otevřeného přístupu inspirovaly prezidentskou směrnici z roku 2013, která vyvolala akci i v dalších federálních agenturách.

V březnu 2020 PubMed Central zrychlil své depozitní postupy pro úplné znění publikací o koronaviru . NLM tak učinil na žádost Úřadu pro vědu a technologii v Bílém domě a mezinárodních vědců, aby zlepšili přístup pro vědce, poskytovatele zdravotní péče, inovátory v oblasti těžby dat , výzkumníky v oblasti zdravotní péče v oblasti umělé inteligence a širokou veřejnost.

PMCID

PMCID (PubMed Central identifier), známý také jako referenční číslo PMC, je bibliografický identifikátor pro databázi PubMed Central, podobně jako PMID je bibliografický identifikátor pro databázi PubMed . Tyto dva identifikátory jsou však odlišné. Skládá se z „PMC“ následovaného řetězcem sedmi čísel. Formát je:

  • PMCID: PMC1852221

Autoři žádající o ceny NIH musí do své žádosti zahrnout PMCID.

Viz také

Reference

externí odkazy