Protein S100 - S100 protein

Doména vázající vápník typu S100/ICaBP
Protein S100B PDB 1b4c.png
Struktura proteinu S100B. Na základě vykreslování PyMOL PDB 1b4c.
Identifikátory
Symbol S_100
Pfam PF01023
InterPro IPR013787
PROSITE PDOC00275
SCOP2 1 cnp / SCOPe / SUPFAM

Tyto proteiny S100 jsou rodinou molekulovou hmotností nízké proteiny nalezené v vertebrates vyznačená dvěma vápníku míst vázajících které helix-loop-helix ( „ EF-hand -typ“) konformaci. Je známo alespoň 21 různých proteinů S100. Jsou kódovány rodinou genů, jejichž symboly používají předponu S100 , například S100A1 , S100A2 , S100A3 . Jsou také považovány za molekuly molekulárního vzoru spojené s poškozením (DAMP) a knockdown arylového uhlovodíkového receptoru downreguluje expresi proteinů S100 v buňkách THP-1.

Struktura

Většina proteinů S100 se skládá ze dvou identických polypeptidů (homodimerních), které jsou drženy pohromadě nekovalentními vazbami. Strukturálně jsou podobné kalmodulinu . Liší se od kalmodulinu v ostatních funkcích. Například jejich expresní vzorec je specifický pro buňky, tj. Jsou vyjádřeny v konkrétních typech buněk. Jejich vyjádření závisí na faktorech prostředí. Naproti tomu kalmodulin je všudypřítomný a univerzální intracelulární Ca2 + receptor široce exprimovaný v mnoha buňkách.

Normální funkce

Proteiny S100 jsou normálně přítomny v buňkách odvozených z neurální lišty ( Schwannovy buňky a melanocyty ), chondrocytech , adipocytech , myoepiteliálních buňkách , makrofágech , Langerhansových buňkách , dendritických buňkách a keratinocytech. Mohou být přítomny v některých buňkách epitelu prsu .

Proteiny S100 se podílejí na řadě intracelulárních a extracelulárních funkcí, jako je regulace fosforylace proteinů, transkripční faktory, homeostáza Ca 2+ , dynamika složek cytoskeletu, aktivity enzymů, buněčný růst a diferenciace a zánětlivá odpověď. Bylo zjištěno, že S100A7 (psoriasin) a S100A15 působí jako cytokiny při zánětu, zejména při autoimunitních kožních stavech, jako je psoriáza.

Patologie

Několik členů rodiny proteinů S100 je užitečných jako markery pro určité nádory a epidermální diferenciaci. Mohou být nalezeny v melanomech , 100% schwannomů, 100% neurofibromů (slabších než schwannomů), 50% maligních nádorů pochvy periferního nervu (mohou být slabé a/nebo fokální), paragangliomových stromálních buňkách, histiocytomu a čirých buňkách sarkomy . Proteiny S100 jsou dále markery zánětlivých onemocnění a mohou zprostředkovat zánět a působit jako antimikrobiální látky. Proteiny S100 byly v laboratoři použity jako buněčné markery pro anatomickou patologii .

Lidské geny

Nomenklatura

Předpona symbolu „S100“ označuje, že tyto proteiny jsou rozpustné ve 100%, tj. Nasyceném síranu amonném při neutrálním pH . Symbol byl často dělen, ale současná genová a proteinová nomenklatura , jako například názvoslovná komise pro genovou nomenklaturu HUGO , nepoužívá v symbolech pomlčky.

Viz také

Reference

Další čtení

externí odkazy