Prosaposin - Prosaposin

PSAP
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologů : PDBe RCSB
Seznam ID kódů PDB
	1M12 , 1N69 , 1SN6 , 2DOB , 2GTG , 2QYP , 2R0R , 2R1Q , 2RB3 , 2Z9A , 3BQP , 3BQQ , 4DDJ , 4UEX , 4V2O
Identifikátory
Přezdívky	PSAP , GLBA, SAP1, prosaposin, SAP2, PSAPD, PARK24
Externí ID	OMIM : 176801 MGI : 97783 HomoloGene : 37680 GeneCards : PSAP
Umístění genu ( člověk )
Chr.	Chromozom 10 (člověk)
Konec	71 851 325 bp
Umístění genu ( myš )
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	60 302 597 bp
Vzorec pro expresi RNA
	; ;
	Více referenčních výrazů
Genová ontologie
Molekulární funkce	• spřažený s G proteinem vázající receptor ; • GO: vazba 0001948 protein ; • vazebnou lipid ; • GO: 0010577 enzymu aktivátor aktivita ; • beta-galaktosidázy aktivita ; • fosfolipid vazby ; • homodimerizace aktivita proteinu ; • vazba gangliosidy GM1 ; • vazba gangliosid GM2 ; • vazba gangliosid GM3 ; • gangliosidy GT1B vazba ; • vazba gangliozidu GP1c ; • vazba identického proteinu ; • vazba proteázy;
Buněčná složka	• lysozomální membrány ; • nedílnou součást membrány ; • mitochondrie ; • lysosomální lumen ; • extracelulární Exosom ; • extracelulární prostor ; • lysosom ; • plazmatická membrána ; • azurofilnich granule membrána ; • intracelulární membránou ohraničených organel ; • GO: 0005578 extracelulární matrix ; • extracelulární oblast ; • cytoplasma ; • kolagen obsahující extracelulární matrix ; • pozdní endozom;
Biologický proces	• metabolismus lipidů ; • transport lipidů ; • diferenciace epiteliálních buněk zapojená do vývoje prostaty ; • regulace kaskády MAPK ; • metabolický proces glykosfingolipidu ; • vývojový růst ; • signální dráha receptoru spřažená s G proteinem adenylát cyklázou ; • regulace autofagie ; • pozitivní regulace kaskády MAPK ; • buněčná odpověď na organickou látku ; • negativní regulace buněčné smrti vyvolané peroxidem vodíku ; • regulace lipidového metabolického procesu ; • růst prostaty ; • degranulace destiček ; • metabolický proces sfingolipidů ; • GO: 0048554 pozitivní regulace katalytické aktivity ; • degranulace neutrofilů ; • gangliozid transport GM1 na membránu ; • vývoj korneocytů ; • katabolický proces galaktosylceramidu ; • signální dráha receptoru spřažená s G proteinem ; • smyslové vnímání zvuku ; • myelinizace ; • neuromuskulární proces řídící rovnováhu ; • pozitivní regulace aktivity hydrolázy ; • močení ; • vývoj hlemýždě ; • chování při chůzi ; • cornified envel ope montáž ; • lysozomální transport;
	Zdroje: Amigo / QuickGO
Ortology
	5660
	19156
	ENSG00000197746
	ENSMUSG00000004207
	P07602 ; Q5BJH1
	Q61207
	NM_002778 ; NM_001042465 ; NM_001042466
NM_001146120 ; NM_001146121 ; NM_001146122 ; NM_001146123 ; NM_001146124;
	NM_011179
	NP_001035930 ; NP_001035931 ; NP_002769 ; NP_002769.1
NP_001139592 ; NP_001139593 ; NP_001139594 ; NP_001139595 ; NP_001139596;
	NP_035309
	Wikidata
Zobrazit/upravit člověka	Zobrazit/upravit myš

Prosaposin , také známý jako centra tísňového volání , je protein, který je u lidí kódován PSAP genu .

Tento vysoce konzervovaný glykoprotein je prekurzorem pro 4 produkty štěpení: saposiny A, B, C a D. Saposin je zkratka pro S phingolipid A ctivator P r O [ S ] te IN s. Každá doména prekurzorového proteinu je dlouhá přibližně 80 aminokyselinových zbytků s téměř identickým umístěním cysteinových zbytků a glykosylačních míst. Saposiny AD se lokalizují primárně do lysozomálního kompartmentu, kde usnadňují katabolismus glykosfingolipidů s krátkými oligosacharidovými skupinami. Prekurzorový protein existuje jak jako sekreční protein, tak jako integrální membránový protein a má neurotrofní aktivity.

Saposiny A – D jsou nutné pro hydrolýzu určitých sfingolipidů specifickými lysozomálními hydrolázami.

Členové rodiny

Saposin A byl identifikován jako N-koncová doména v prosaposinové cDNA před jeho izolací. Je známo, že stimuluje enzymatickou hydrolýzu 4-methylumbelliferyl-p-glukosidu, glukocerebrozidu a galaktoocerebrozidu .
Saposin B byla první, aby se objevil a byl zjištěno, že je zapotřebí jako faktor tepelně stabilní k hydrolýze sulfatidy podle arylsulfatázy A . Je znám pod mnoha různými názvy, jako je například sfingolipidový aktivátorový protein-1 (SAP-1), sulfatidový aktivační protein, GM ₁ gangliozidový aktivátor, disperzin a nespecifický. Bylo pozorováno, že tento konkrétní saposin aktivuje mnoho enzymů interakcí se substráty, nikoli s enzymy samotnými.
Saposin C byl druhým saposinem, který byl objeven, a stimuluje hydrolýzu glykocerebrozidu glykosylceramidázou a galactocerebroside galaktosylceramidázou.
Saposin D není v tuto chvíli dobře znám kvůli nedostatku vyšetřování. Bylo předpovězeno ze sekvence cDNA prosaposinu, jako je saposin A. Enzymatická stimulace je pro tento konkrétní glykoprotein velmi specifická a není zcela pochopena.
GM2A (GM2 gangliozidový aktivátor) byl považován za člena rodiny SAP a byl nazýván SAP-3 (sfingolipidový aktivátorový protein 3)

Krystalové struktury lidských saposinů AD

Saposin A ( PDB : 2DOB ).
Saposin B ( PDB : 1N69 ).
Dimer saposinu C v otevřené konformaci ( PDB : 2QYP ).
Saposin D ( PDB : 2RB3 ).

Struktura

Každý saposin obsahuje asi 80 aminokyselinových zbytků a má šest stejně umístěných cysteinů, dva proliny a glykosylační místo (dva v saposinu A, po jednom v saposinech B, C a D). Vzhledem k tomu, že saposiny vykazují extrémní tepelnou stabilitu, množství disulfidových vazeb a odolnost vůči většině proteáz, jsou považovány za extrémně kompaktní a pevně disulfidově vázané molekuly. Každý saposin má a-helikální strukturu, která je považována za důležitou pro stimulaci, protože tato struktura je maximální při pH 4,5; což je optimální pro mnoho lysozomálních hydroláz. Tato šroubovicová struktura je patrná u všech (zejména u první oblasti), ale podle předpovědi saposinu bude konfigurace β-listu způsobena prvními 24 aminokyselinami N-konce.

Funkce

Působí pravděpodobně tak, že izolují lipidový substrát od okolí membrány, čímž se stávají dostupnějšími pro rozpustné degradační enzymy . který obsahuje čtyři domény Saposin-B , čímž se získají aktivní saposiny po proteolytickém štěpení, a dvě domény Saposin-A, které jsou odstraněny v aktivační reakci. Domény saposinu-B se vyskytují také v jiných proteinech, z nichž mnohé jsou aktivní při lýze membrán.

Klinický význam

Mutace v tomto genu jsou spojeny s Gaucherovou nemocí , Tay – Sachsovou chorobou a metachromatickou leukodystrofií .

Viz také

Proteinová doména saposinu

Reference

Další čtení

Gieselmann V, Zlotogora J, Harris A a kol. (1995). „Molekulární genetika metachromatické leukodystrofie“. Hučení. Mutat . 4 (4): 233–42. doi : 10,1002/humu.1380040402 . PMID 7866401 . S2CID 23519007 .
Schnabel D, Schröder M, Fürst W a kol. (1992). "Současný nedostatek proteinů aktivátoru sfingolipidů 1 a 2 je způsoben mutací iniciačního kodonu jejich společného genu" . J. Biol. Chem . 267 (5): 3312–5. doi : 10,1016/S0021-9258 (19) 50733-5 . PMID 1371116 .
Hiraiwa M, Soeda S, Kishimoto Y, O'Brien JS (1993). „Vazba a transport gangliosidů prosaposinem“ . Proč. Natl. Akadem. Sci. USA . 89 (23): 11254–8. doi : 10,1073/pnas.89.23.11254 . PMC 50528 . PMID 1454804 .
Rorman EG, Scheinker V, Grabowski GA (1992). „Struktura a evoluce chromozomálního genu pro lidský prosaposin“. Genomika . 13 (2): 312–8. doi : 10,1016/0888-7543 (92) 90247-P . PMID 1612590 .
Kondoh K, Hineno T, Sano A, Kakimoto Y (1992). „Izolace a charakterizace prosaposinu z lidského mléka“. Biochem. Biofy. Res. Komun . 181 (1): 286–92. doi : 10,1016/S0006-291X (05) 81415-9 . PMID 1958198 .
Holtschmidt H, Sandhoff K, Fürst W a kol. (1991). „Organizace genu pro lidský aktivátorový protein cerebroside sulfátového aktivátoru“. FEBS Lett . 280 (2): 267–70. doi : 10,1016/0014-5793 (91) 80308-P . PMID 2013321 . S2CID 38952277 .
Holtschmidt H, Sandhoff K, Kwon HY a kol. (1991). "Protein aktivátor sulfatidu. Alternativní sestřih, který generuje tři mRNA a nově nalezenou mutaci zodpovědnou za klinickou nemoc" . J. Biol. Chem . 266 (12): 7556–60. doi : 10,1016/S0021-9258 (20) 89483-6 . PMID 2019586 .
Hineno T, Sano A, Kondoh K a kol. (1991). „Sekrece prekurzoru aktivátoru sfingolipidové hydrolázy, prosaposin“. Biochem. Biofy. Res. Komun . 176 (2): 668–74. doi : 10,1016/S0006-291X (05) 80236-0 . PMID 2025281 .
Schnabel D, Schröder M, Sandhoff K (1991). „Mutace v proteinu 2 aktivátoru sfingolipidů u pacienta s variantou Gaucherovy choroby“. FEBS Lett . 284 (1): 57–9. doi : 10,1016/0014-5793 (91) 80760-Z . PMID 2060627 . S2CID 42681055 .
Zhang XL, Rafi MA, DeGala G, Wenger DA (1991). „Mechanismus inzerce 33 nukleotidů v mRNA způsobující metachromatickou leukodystrofii s deficitem sfingolipidového aktivačního proteinu (SAP-1)“. Hučení. Genet . 87 (2): 211–5. doi : 10,1007/BF00204185 . PMID 2066109 . S2CID 23791396 .
Fürst W, Schubert J, Machleidt W a kol. (1990). „Kompletní sekvence aminokyselin aktivačního proteinu lidského gangliozidu GM2 a aktivátoru proteinu cerebroside sulfátu“. Eur. J. Biochem . 192 (3): 709–14. doi : 10.1111/j.1432-1033.1990.tb19280.x . PMID 2209618 .
Rafi MA, Zhang XL, DeGala G, Wenger DA (1990). „Detekce bodové mutace v mRNA proteinu 1 aktivátoru sfingolipidového aktivátoru u pacientů s variantní formou metachromatické leukodystrofie“. Biochem. Biofy. Res. Komun . 166 (2): 1017–23. doi : 10,1016/0006-291X (90) 90912-7 . PMID 2302219 .
Kretz KA, Carson GS, Morimoto S, et al. (1990). „Charakterizace mutace v rodině s nedostatkem saposinu B: defekt místa glykosylace“ . Proč. Natl. Akadem. Sci. USA . 87 (7): 2541–4. Bibcode : 1990PNAS ... 87.2541K . doi : 10,1073/pnas.87.7.2541 . PMC 53725 . PMID 2320574 .
Nakano T, Sandhoff K, Stümper J a kol. (1989). „Struktura cDNA plné délky kódující sulfatidový aktivátor, Co-beta-glukosidázu a dva další homologní proteiny: dvě alternativní formy sulfatidového aktivátoru“. J. Biochem . 105 (2): 152–4. doi : 10,1093/oxfordjournals.jbchem.a122629 . PMID 2498298 .
Rorman EG, Grabowski GA (1990). „Molekulární klonování cDNA lidské co-beta-glukosidázy: důkaz, že čtyři aktivační proteiny sfingolipidové hydrolázy jsou kódovány jednotlivými geny u lidí a potkanů“. Genomika . 5 (3): 486–92. doi : 10,1016/0888-7543 (89) 90014-1 . PMID 2515150 .
Morimoto S, Martin BM, Yamamoto Y a kol. (1989). „Saposin A: druhý protein aktivátor cerebrosidázy“ . Proč. Natl. Akadem. Sci. USA . 86 (9): 3389–93. Bibcode : 1989PNAS ... 86,3389M . doi : 10,1073/pnas.86.9.3389 . PMC 287138 . PMID 2717620 .
Dewji NN, Wenger DA, O'Brien JS (1988). „Nukleotidová sekvence klonované cDNA pro lidský prekurzor proteinu 1 lidského sfingolipidového aktivátoru“ . Proč. Natl. Akadem. Sci. USA . 84 (23): 8652–6. doi : 10,1073/pnas.84.23.8652 . PMC 299604 . PMID 2825202 .
O'Brien JS, Kretz KA, Dewji N a kol. (1988). „Kódování dvou aktivačních proteinů sfingolipidů (SAP-1 a SAP-2) stejným genetickým lokusem“. Věda . 241 (4869): 1098–101. Bibcode : 1988Sci ... 241.1098O . doi : 10,1126/věda.2842863 . PMID 2842863 .
Morimoto S, Martin BM, Kishimoto Y, O'Brien JS (1988). „Saposin D: aktivátor sfingomyelinázy“ . Biochem. Biofy. Res. Komun . 156 (1): 403–10. doi : 10,1016/S0006-291X (88) 80855-6 . PMID 2845979 .
Dewji N, Wenger D, Fujibayashi S a kol. (1986). „Molekulární klonování proteinu 1 aktivátoru sfingolipidů (SAP-1), aktivátoru sulfatid sulfatázy“. Biochem. Biofy. Res. Komun . 134 (2): 989–94. doi : 10,1016/S0006-291X (86) 80518-6 . PMID 2868718 .

externí odkazy

Saposiny v USA Národní knihovna lékařských lékařských oborových nadpisů (MeSH)

Languages

In other projects