Subclade - Subclade

V genetice je subclade podskupinou haploskupiny .

Konvence pojmenování

Ačkoli jsou haploskupiny a subclades lidské mitochondriální DNA (mtDNA) a chromozomové DNA Y (Y-DNA) pojmenovány podobným způsobem, jejich názvy patří do zcela oddělených systémů.

mtDNA

mtDNA haplogroups jsou definovány přítomností řady jednonukleotidový polymorfismus (SNP) markerů v hypervariabilní oblasti a kódující oblasti z mitochondriální DNA . Jsou pojmenovány velkými písmeny A až Z, přičemž další subclades jsou pojmenovány čísly a malými písmeny.

Y-DNA

Y-DNA haplogroups jsou definovány přítomností řady SNP markerů na chromozomu Y . Subclades jsou definovány koncovým SNP , SNP nejdále ve fylogenetickém stromu chromozomů Y.

Lidská Y-DNA

Chromozomu Y Consortium (YCC) vyvinul systém pojmenování hlavní lidský Y-DNA haploskupin Velká písmena A až T, s dalšími subclades pojmenovány čísla a malá písmena (Ycc latince názvosloví ). Zkrácená nomenklatura YCC pojmenovává haploskupiny Y-DNA a jejich subclades s prvním písmenem hlavní haploskupiny Y-DNA následovaným pomlčkou a názvem definujícího koncového SNP. Nomenklatura haploskupiny Y-DNA se v průběhu času mění, aby vyhovovala rostoucímu počtu objevovaných a testovaných SNP a výsledné expanzi fylogenetického stromu chromozomů Y. Tato změna nomenklatury má za následek použití nekonzistentní nomenklatury v různých zdrojích. Tato nekonzistentnost a stále těžkopádnější dlouhovlasá nomenklatura vedla k přechodu k používání jednodušší zkratkové nomenklatury.

Viz také

Reference