Typ (biologie) -Type (biology)

Typový exemplář pro Marocaster coronatus - Muséum de Toulouse

V biologii je typem zvláštní vzorek (nebo v některých případech skupina vzorků) organismu , ke kterému je formálně připojen vědecký název tohoto organismu. Jinými slovy, typ je příklad, který slouží k ukotvení nebo centralizaci definujících znaků daného taxonu . Ve starším použití (v botanice před rokem 1900) byl typ spíše taxonem než exemplářem.

Taxon je vědecky pojmenované seskupení organismů s jinými podobnými organismy, soubor , který zahrnuje některé organismy a jiné vylučuje, na základě podrobného zveřejněného popisu (například popisu druhu ) a poskytnutí typového materiálu, který je obvykle dostupný vědci ke zkoumání ve velké muzejní výzkumné sbírce nebo podobné instituci.

Typový vzorek

Podle přesného souboru pravidel stanovených v Mezinárodním kódu zoologické nomenklatury (ICZN) a Mezinárodním kódu nomenklatury řas, hub a rostlin (ICN) je vědecký název každého taxonu téměř vždy založen na jednom konkrétním exempláři . nebo v některých případech exempláře. Typy mají velký význam pro biology, zejména pro taxonomy . Typy jsou obvykle fyzické exempláře, které jsou uchovávány v muzejní nebo herbářové výzkumné sbírce, ale pokud tomu tak není, někdy byl jako typ označen obrázek jedince tohoto taxonu. Popis druhů a určení typových exemplářů je součástí vědecké nomenklatury a taxonomie alfa .

Při identifikaci materiálu se vědec pokusí aplikovat jméno taxonu na exemplář nebo skupinu exemplářů na základě toho, že rozumí relevantním taxonům, na základě (alespoň) přečtení popisů typu, nejlépe také na základě vyšetření veškerého typového materiálu všech příslušných taxonů. Pokud existuje více než jeden pojmenovaný typ, které se všechny zdají být stejným taxonem, pak nejstarší jméno má přednost a je považováno za správné jméno daného materiálu. Pokud se na druhé straně zdá, že taxon nebyl nikdy pojmenován, pak vědec nebo jiný kvalifikovaný odborník vybere typový exemplář a zveřejní nové jméno a oficiální popis.

Tento proces je zásadní pro biologickou taxonomii . Představy lidí o tom, jak by měly být živé věci seskupovány, se v průběhu času mění. Jak víme, že to, co nazýváme " Canis lupus ", je totéž, nebo přibližně totéž, jako to, co oni budou nazývat " Canis lupus " za 200 let? Je možné si to ověřit, protože ve Švédsku je uchován konkrétní exemplář vlka a každý, kdo toto jméno použije – bez ohledu na to, co tím myslí, bude tento konkrétní exemplář zahrnovat.

V závislosti na nomenklaturním kódu použitém na daný organismus může být typem vzorek, kultura, ilustrace nebo (pod bakteriologickým kódem) popis. Některé kódy považují za typ podřízený taxon, ale podle botanického kódu je typem vždy exemplář nebo ilustrace.

Například ve výzkumné sbírce Přírodovědného muzea v Londýně se nachází ptačí exemplář s číslem 1886.6.24.20. Jedná se o exemplář druhu ptáka běžně známého jako moták skvrnitý , který v současnosti nese vědecký název Circus assimilis . Tento konkrétní exemplář je holotypem pro tento druh; jméno Circus assimilis odkazuje podle definice na druh tohoto konkrétního exempláře. Tento druh pojmenovali a popsali Jardine a Selby v roce 1828 a holotyp byl umístěn do muzejní sbírky, aby se na něj ostatní vědci mohli v případě potřeby odvolávat.

Všimněte si, že alespoň u typových exemplářů není požadavek na použití "typického" jedince. Rody a čeledi , zejména ty, které založili raní taxonomové, bývají pojmenovávány podle druhů, které jsou pro ně „typickější“, ale ani zde tomu tak vždy není a kvůli změnám v systematice tomu tak být nemůže . Proto se někdy používá termín typ nesoucí jméno nebo onomatofor k označení skutečnosti, že biologické typy nedefinují „typické“ jedince nebo taxony , ale spíše fixují vědecký název na konkrétní operační taxonomickou jednotku . Typové exempláře mohou být teoreticky dokonce aberantními nebo deformovanými jedinci nebo barevnými variacemi, i když se to zřídka volí, protože je obtížné určit, ke které populaci jedinec patřil.

Použití termínu typ je poněkud komplikováno mírně odlišným použitím v botanice a zoologii . Ve PhyloCode jsou typově založené definice nahrazeny fylogenetickými definicemi .

Starší terminologie

V některých starších taxonomických pracích bylo slovo „typ“ někdy používáno odlišně. Význam byl podobný v prvních zákonech botanické nomenklatury , ale má význam blíže k termínu taxon v některých jiných dílech:

Ce seul caractère permet de distinguer ce type de toutes les autres espèces de la section. … Après avoir étudié ces differents formes, j'en arrivai à lessidérer comme appartenant à un seul et même type specific.

Překlad: Tento jediný znak umožňuje [člověk] odlišit tento typ od všech ostatních druhů ze sekce... Po prostudování různých podob jsem je začal považovat za patřící k jednomu a témuž specifickému typu.

V botanice

V botanické nomenklatuře je typ ( typus , nomenklaturní typ ) "tím prvkem, ke kterému je trvale připojeno jméno taxonu." (článek 7.2) V botanice je typem buď vzorek, nebo ilustrace. Exemplář je skutečná rostlina (nebo jedna nebo více částí rostliny nebo mnoho malých rostlin), mrtvá a udržovaná v bezpečí, "vyléčená", v herbáři (nebo ekvivalentu pro houby). Příklady, kde může ilustrace sloužit jako typ, zahrnují:

  • Detailní kresba, malba atd., zobrazující rostlinu, z počátků rostlinné taxonomie. Sušenou rostlinu bylo obtížné přepravovat a bylo těžké ji udržet v bezpečí pro budoucnost; mnoho exemplářů z počátků botaniky bylo od té doby ztraceno nebo poškozeno. Botanici byli někdy zaměstnáni vysoce zručnými botanickými umělci, aby vytvořili věrné a podrobné ilustrace. Některé takové ilustrace se staly nejlepším záznamem a byly vybrány, aby sloužily jako typ taxonu.
  • Detailní obrázek něčeho, co lze vidět pouze mikroskopem . Drobná „rostlina“ na mikroskopickém sklíčku je špatným typem: podložní sklíčko se může ztratit nebo poškodit, nebo může být velmi obtížné najít příslušnou „rostlinu“ mezi čímkoli jiným, co je na podložním sklíčku. Ilustrace umožňuje mnohem spolehlivější typ (článek 37.5 vídeňského zákoníku , 2006).

Všimněte si, že typ neurčuje vymezení taxonu. Například pampeliška obecná je kontroverzním taxonem: někteří botanici ji považují za složenou z více než stovky druhů a jiní ji považují za jediný druh. Typ názvu Taraxacum officinale je stejný, ať už okruh druhu zahrnuje všechny tyto malé druhy ( Taraxacum officinale je „velký“ druh), nebo zda je okruh omezen pouze na jeden malý druh z dalších stovek ( Taraxacum officinale je "malý" druh). Název Taraxacum officinale je stejný a typ jména je stejný, ale rozsah toho, na co se jméno ve skutečnosti vztahuje, se velmi liší. Stanovení vymezení taxonu provádí taxonom v publikaci.

Různé poznámky:

  1. Pouze druh nebo vnitrodruhový taxon může mít svůj vlastní typ. Pro většinu nových taxonů (zveřejněných 1. ledna 2007 nebo později, článek 37) v těchto řadách by typ neměl být ilustrací.
  2. Rod má stejný typ jako jeden z jeho druhů (článek 10).
  3. Čeleď má stejný typ jako jeden z jejích rodů ( článek 10).

ICN poskytuje seznam různých typů typů (článek 9 a glosář), z nichž nejdůležitější je holotyp. Tyto jsou

  • holotyp – jediný exemplář nebo ilustrace, které autor (autoři) jasně označili jako nomenklatorický typ jména
  • lektotyp – exemplář nebo ilustrace označená z původního materiálu jako nomenklaturní typ, pokud nebyl specifikován holotyp nebo byl holotyp ztracen nebo zničen
  • izotyp – duplikát holotypu
  • syntype – jakýkoli exemplář (nebo ilustrace) citovaný v původním popisu, pokud neexistuje žádný holotyp, nebo kterýkoli ze dvou či více exemplářů současně označených jako typy
  • paratyp – jakýkoli exemplář (nebo ilustrace) citovaný v původním popisu, který není holotypem, izotypem ani jedním ze syntypů
  • neotyp – exemplář nebo ilustrace vybrané tak, aby sloužily jako nomenklatorický typ, pokud není k dispozici žádný materiál z původního popisu
  • epityp – exemplář nebo ilustrace vybrané tak, aby sloužily jako interpretační typ, obvykle když jiný typ typu nevykazuje kritické znaky potřebné pro identifikaci

Všimněte si, že slovo „typ“ se v botanické literatuře objevuje jako součást některých starších termínů, které nemají v rámci ICN žádný status : například klonotyp.

V zoologii

Motýl okřídlený , Jamides elioti :
1) dorzální a 2) ventrální aspekt holotypu,
3) dorzální a 4) ventrální aspekt paratypu

V zoologické nomenklatuře je typem druhu nebo poddruhu exemplář nebo série exemplářů. Typ rodu nebo podrodu je druh. Typ supragenerického taxonu (např. čeleď atd.) je rod. Jména vyšší než hodnost nadrodiny nemají typy. "Typ nesoucí jméno" je vzorek nebo obrázek, který "poskytuje objektivní referenční standard, kterým lze určit použití jména nominálního taxonu."

Definice

  • Typový exemplář je lidový termín (nikoli formálně definovaný termín), který se obvykle používá pro jednotlivce nebo fosílii, což je některý z různých typů nesoucích jméno pro daný druh . Například typovým exemplářem pro druh Homo neanderthalensis byl exemplář „Neanderthal-1“ objevený Johannem Karlem Fuhlrottem v roce 1856 ve Feldhoferu v údolí Neander v Německu, sestávající z lebky , stehenních kostí, části pánve a některých žeber. a některé pažní a ramenní kosti. Může existovat více než jeden typový exemplář, ale existuje (alespoň v moderní době) pouze jeden holotyp.
  • Typový druh je nominální druh , který je jmenným typem nominálního rodu nebo podrodu .
  • Typový rod je nominální rod , který je jmenným typem nominálního taxonu rodinné skupiny.
  • Typovou řadou jsou všechny ty exempláře zahrnuté autorem do formálního popisu taxonu, pokud je autor výslovně nebo implicitně nevyloučí jako součást série.

Použití typových vzorků

Typová ilustrace Mormopterus acetabulosus

Ačkoli ve skutečnosti mohou biologové prozkoumat mnoho exemplářů (pokud jsou k dispozici) nového taxonu před napsáním oficiálního zveřejněného popisu druhu, podle formálních pravidel pro pojmenovávání druhů (Mezinárodní kód zoologické nomenklatury) musí být určen jeden typ, jako část zveřejněného popisu.

Popis typu musí obsahovat diagnózu (obvykle diskuzi o podobnostech a rozdílech od blízce příbuzných druhů) a údaj o tom, kde jsou typový vzorek nebo vzorky uloženy k vyšetření. Zeměpisná poloha, kde byl typový exemplář původně nalezen, se nazývá jeho typová lokalita . V případě parazitů termíntyp hostitele (nebo symbiotyp) se používá k označení hostitelského organismu, ze kterého byl typový vzorek získán.

Zoologické sbírky udržují univerzity a muzea. Zajištění toho, že typy jsou udržovány v dobrém stavu a zpřístupněny ke zkoumání taxonomy, jsou dvě důležité funkce takových sbírek. A i když je určen pouze jeden holotyp , mohou existovat další „typové“ exempláře, z nichž jsou formálně definovány následující:

Holotyp

Když je v původním popisu jasně označen jediný exemplář, je tento exemplář znám jako holotyp tohoto druhu. Holotyp je obvykle umístěn ve velkém muzeu nebo podobné známé veřejné sbírce, takže je volně dostupný pro pozdější zkoumání jinými biology.

Paratyp

Když původní popis označoval holotyp, mohou existovat další exempláře, které autor označuje jako další zástupce stejného druhu, nazývané paratypy. Toto nejsou typy nesoucí jméno .

Alotypie

Alotyp je exemplář opačného pohlaví než je holotyp, určený z paratypů. Toto slovo bylo také dříve používáno pro vzorek, který vykazuje rysy, které nejsou vidět v holotypu fosílie. Termín není regulován ICZN .

Neotypie

Neotyp je exemplář později vybraný, aby sloužil jako jednotypový exemplář, když byl původní holotyp ztracen nebo zničen nebo kde původní autor nikdy necitoval exemplář.

Syntype

Syntypem je jakýkoli jeden ze dvou nebo více exemplářů, který je uveden v popisu druhu, kde nebyl určen žádný holotyp; historicky byly syntypy jako takové často výslovně označovány a podle současného ICZN je to požadavek, ale moderní pokusy publikovat popis druhů založený na syntypech jsou praktikujícími taxonomy obecně odsuzovány a většina je postupně nahrazována lektotypy. Ty, které stále existují, jsou stále považovány za typy nesoucí jména.

Lektotyp

Lektotyp je vzorek později vybraný, aby sloužil jako jediný typový vzorek pro druhy původně popsané ze souboru syntypů . V zoologii je lektotyp druhem pojmenovaného typu . Když byl druh původně popsán na základě typu nesoucího jméno sestávajícího z více exemplářů, jeden z nich může být označen jako lektotyp. Jediný typ nesoucí jméno snižuje možnost záměny, zvláště uvážíme-li, že není neobvyklé, že řada syntypů obsahuje exempláře více než jednoho druhu.

Pozoruhodným příkladem je návrh, že Carl Linnaeus by měl představovat lektotyp pro druh Homo sapiens .

Paralektotyp

Paralektotyp je jakýkoli další vzorek ze souboru syntypů poté, co byl z nich označen lektotyp. Toto nejsou typy, které nesou jména.

Hapantotyp

Zvláštní případ u Protistanů , kde typ sestává ze dvou nebo více exemplářů „přímo příbuzných jedinců představujících různá stádia životního cyklu“; tyto jsou kolektivně považovány za jeden celek a lektotypy z nich nelze určit.

ikonotyp

Ilustrace, na které byl založen nový druh nebo poddruh. Například krajta barmská, Python bivittatus , je jedním z mnoha druhů, které jsou založeny na ilustracích Alberta Seby (1734).

Ergatotyp

Ergatotyp je vzorek vybraný tak, aby reprezentoval dělníka u blanokřídlých , kteří mají polymorfní kasty.

Alternativy k dochovaným exemplářům

Typové ilustrace využili i zoologové, jako v případě andulky Réunion , která je známá pouze z historických ilustrací a popisů.

Nedávno byly popsány některé druhy, kde byl typový exemplář vypuštěn živý zpět do volné přírody, jako je Bulo Burti boubou ( křovík ), popsaný jako Laniarius liberatus , u kterého popis druhu zahrnoval sekvence DNA ze vzorků krve a peří. Za předpokladu, že neexistuje žádná budoucí otázka ohledně statusu takového druhu, nepřítomnost typového exempláře neznehodnocuje jméno, ale v budoucnu může být nutné určit neotyp pro takový taxon, pokud vyvstanou nějaké otázky. Nicméně v případě křoví ornitologové tvrdili, že exemplář byl vzácnou a dosud neznámou barevnou morfou dlouho známého druhu, s použitím pouze dostupných vzorků krve a peří. I když stále existuje určitá debata o potřebě uložit skutečně usmrcené jedince jako typové vzorky, lze pozorovat, že za předpokladu správného skladování a skladování mohou být vzorky tkání stejně cenné, pokud by se objevily spory o platnost druhu.

Formalizace typového systému

Různé výše uvedené typy jsou nezbytné, protože mnoho druhů bylo popsáno před jedním nebo dvěma stoletími, kdy jediný typový exemplář, holotyp, často nebyl označen. Také typy nebyly vždy pečlivě uchovány a události, jako jsou války a požáry, měly za následek zničení původního typového materiálu. Platnost jména druhu často spočívá na dostupnosti původních typových exemplářů; nebo, nelze-li typ nalézt, nebo nikdy neexistoval, na základě srozumitelnosti popisu.

ICZN existuje teprve od roku 1961, kdy vyšlo první vydání Kodexu. ICZN vždy nepožaduje typový exemplář pro historickou platnost druhu a existuje mnoho „beztypových“ druhů. Aktuální vydání Kodexu, článek 75.3, zakazuje označení neotypu , pokud neexistuje „výjimečná potřeba“ „objasnění taxonomického statusu“ druhu (článek 75.2).

Existuje mnoho dalších permutací a variací termínů používajících příponu „-typ“ (např. alotyp , kotyp, topotyp , generityp , izotyp , izoneotyp, izolektotyp atd.), ale tyto nejsou formálně upraveny Kodexem a mnoho jsou zastaralé a/nebo idiosynkratické. Některé z těchto kategorií se však mohou potenciálně vztahovat na originální typové exempláře, jako je neotyp; např. izotypové/topotypické vzorky jsou upřednostňovány před jinými vzorky, pokud jsou k dispozici v době výběru neotypu (protože jsou ze stejného času a/nebo místa jako původní typ).

Termín fixace používá Kodex pro deklaraci jmenného typu, ať již původním nebo následným označením.

Typové druhy

Ropucha obecná , Bufo bufo popsaná Linné , je typovým druhem pro rod Bufo

Každý rod musí mít určený typový druh (jednou se pro to používal termín „genotyp“, ale byl opuštěn, protože toto slovo se stalo mnohem známějším jako termín pro odlišný koncept v genetice ). Popis rodu se obvykle opírá především o jeho typový druh, modifikovaný a rozšířený o znaky dalších zahrnutých druhů. Rodové jméno je trvale spojeno s typem nositele jména jeho typového druhu.

V ideálním případě typový druh nejlépe ilustruje základní vlastnosti rodu, ke kterému patří, ale to je subjektivní a v konečném důsledku technicky irelevantní, protože to není požadavek Kodexu. Pokud se při bližším prozkoumání ukáže, že typový druh patří do již existujícího rodu (běžný výskyt), pak všechny základní druhy musí být buď přesunuty do již existujícího rodu, nebo se od původního typového druhu oddělit a dát jim nové druhové jméno; staré druhové jméno přechází v synonymii a je opuštěno, pokud neexistuje naléhavá potřeba udělat výjimku (rozhodováno případ od případu prostřednictvím petice Mezinárodní komisi pro zoologickou nomenklaturu).

Typ rod

Typový rod je ten rod, ze kterého je utvořeno jméno rodiny nebo podčeledi. Stejně jako u typových druhů není typový rod nutně nejreprezentativnějším, ale obvykle jde o nejdříve popsaný, největší nebo nejznámější rod. Není neobvyklé, že jméno rodiny je založeno na jménu typového rodu, který přešel do synonymie; příjmení není třeba v takové situaci měnit.

Viz také

Reference

externí odkazy