CCL3L1 - CCL3L1

CCL3L1
Identifikátory
Aliasy	CCL3L1 , 464.2 , D17S1718, G0S19-2, LD78, LD78-beta (1-70), LD78BETA, MIP1AP, SCYA3L, SCYA3L1, CC motiv chemokinový ligand 3 jako 1
Externí ID	OMIM: 601395 GeneCards: CCL3L1
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivity chemokinů ; • cytokinové aktivity ; • CCR chemokinový receptor vázající ;
Buněčná složka	• extracelulární oblast ; • extracelulární ;
Biologický proces	• lymfocytů chemotaxe ; • chemokinem zprostředkovanou signální dráha ; • G-proteinem spojený receptor signální dráhu ; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulaci GTPázy aktivity ; • buněčné odpovědi na tumor nekrotizujícího faktoru ; • chemotaxe ; • zánětlivé reakce ; • buněčné odpovědi na interleukin-1 ; • chemotaxi monocytů ; • chemotaxi neutrofilů ; • negativní regulaci buněčné proliferace ; • pozitivní regulace ERK1 a ERK2 kaskády ; • imunitní reakce ; • buněčné odpovědi na interferon-gama ; • regulace aktivity receptoru ; • cytokinem zprostředkované signální dráha ; • pozitivní regulace zánětlivé reakce ;
	Zdroje: Amigo / QuickGO
Ortology
	6349
	n / a
	n / a
	n / a
	P16619
	n / a
	NM_021006
	n / a
	NP_001001437 ; NP_066286
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Chemokinů (CC motiv) ligand 3 jako 1 , také známý jako CCL3L1 , je protein, který je u lidí kódován CCL3L1 genem .

Funkce

Tento gen je jedním z několika genů chemokinů seskupených na q-rameni chromozomu 17. Chemokiny jsou rodinou vylučovaných proteinů zapojených do imunoregulačních a zánětlivých procesů. Chemokiny konkrétně přitahují lymfocyty na místa infekce nebo poškození. Tento protein se váže na několik chemokinových receptorů, včetně chemokin vázajícího proteinu 2 ( CCBP2 nebo D6) a chemokinového (CC motiv) receptoru 5 ( CCR5 ).

CCR5 je ko-receptor pro HIV a vazba CCL3L1 na CCR5 inhibuje vstup HIV. Kromě toho vazba způsobí, že receptor bude přijat do buňky endocytózou , aby byl nakonec znovu zpracován a znovu exprimován.

Genová organizace

Referenční sestava lidského genomu obsahuje dvě plné kopie genu (CCL3L1 a CCL3L3) a další částečnou duplikaci, o které se předpokládá, že povede k pseudogenu , označenému jako CCL3L2. Tento záznam představuje telomernější gen plné délky.

Klinický význam

Počet kopií tohoto genu se u jednotlivců liší. Předpokládá se, že to je způsobeno segmentální duplikací oblasti obsahující CCL3 . Většina jedinců má v diploidním genomu 1–6 kopií , i když vzácní jedinci mají nula nebo více než šest kopií. Se zvýšeným počtem kopií je více exprimováno CCL3L1, a tak se zvyšuje konkurence pro vazebné místo CCR5. To vede k pomalejšímu postupu onemocnění u jedinců infikovaných HIV, což dává osobám s vyšším počtem kopií větší odolnost.

Interakce

Ukázalo se, že CCL3L1 interaguje s CCR5 .

Reference

externí odkazy

Umístění lidského genomu CCL3L1 a stránka s podrobnostmi o genu CCL3L1 v prohlížeči genomu UCSC .

Další čtení

Hirashima M, Ono T, Nakao M, Nishi H, Kimura A, Nomiyama H, Hamada F, Yoshida MC, Shimada K (1993). „Nukleotidová sekvence třetího genu LD78 pro cytokiny a mapování všech tří lokusů genu LD78 na lidský chromozom 17“. Sekvence DNA . 3 (4): 203–12. doi : 10,3109 / 10425179209034019 . PMID 1296815 .
Nakao M, Nomiyama H, Shimada K (červenec 1990). "Struktury lidských genů kódujících cytokin LD78 a jejich exprese" . Molekulární a buněčná biologie . 10 (7): 3646–58. doi : 10,1128 / MCB.10.7.3646 . PMC 360801 . PMID 1694014 .
Irving SG, Zipfel PF, Balke J, McBride OW, Morton CC, Burd PR, Siebenlist U, Kelly K (červen 1990). „Dva geny zánětlivých mediátorů pro cytokiny jsou úzce spojeny a variabilně amplifikovány na chromozomu 17q“ . Výzkum nukleových kyselin . 18 (11): 3261–70. doi : 10.1093 / nar / 18.11.3261 . PMC 330932 . PMID 1972563 .
Blum S, Forsdyke RE, Forsdyke DR (březen 2009). "Tři lidské homology myšího genu kódujícího inhibitor proliferace kmenových buněk". DNA a buněčná biologie . 9 (8): 589–602. doi : 10,1089 / dna.1990.9.589 . PMID 2271120 .
Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, Fuldner RA, Bult CJ, Lee NH, Kirkness EF, Weinstock KG, Gocayne JD, White O (září 1995). „Počáteční posouzení diverzity lidských genů a vzorců exprese na základě 83 milionů nukleotidů sekvence cDNA“ (PDF) . Příroda . 377 (6547 Suppl): 3–174. PMID 7566098 .
Naruse K, Ueno M, Satoh T, Nomiyama H, Tei H, Takeda M, Ledbetter DH, Coillie EV, Opdenakker G, Gunge N, Sakaki Y, Iio M, Miura R (červen 1996). "YAC kontig humánních CC chemokinových genů seskupených na chromozomu 17q11.2". Genomika . 34 (2): 236–40. doi : 10,1006 / geno.1996.0274 . PMID 8661057 .
Nibbs RJ, Yang J, Landau NR, Mao JH, Graham GJ (červen 1999). „LD78beta, neallelická varianta lidského MIP-1alfa (LD78alfa), má zvýšené interakce s receptory a silnou aktivitu potlačující HIV“ . The Journal of Biological Chemistry . 274 (25): 17478–83. doi : 10,1074 / jbc.274.25.17478 . PMID 10364178 .
Xin X, Shioda T, Kato A, Liu H, Sakai Y, Nagai Y (srpen 1999). „Enhanced anti-HIV-1 activity of CC-chemokine LD78beta, a non-alelical variant of MIP-1alpha / LD78alpha“. FEBS Dopisy . 457 (2): 219–22. doi : 10.1016 / S0014-5793 (99) 01035-2 . PMID 10471782 . S2CID 84114854 .
Proost P, Menten P, Struyf S, Schutyser E, De Meester I, Van Damme J (září 2000). „Štěpení pomocí CD26 / dipeptidylpeptidázy IV převádí chemokin LD78beta na nejúčinnější atraktant monocytů a agonistu CCR1“. Krev . 96 (5): 1674–80. doi : 10,1182 / krev.V96.5.1674 . PMID 10961862 .
Lambeir AM, Proost P, Durinx C, Bal G, Senten K, Augustyns K, Scharpé S, Van Damme J, De Meester I (srpen 2001). „Kinetické zkoumání zkrácení chemokinů pomocí CD26 / dipeptidylpeptidázy IV odhalilo nápadnou selektivitu v rodině chemokinů“ . The Journal of Biological Chemistry . 276 (32): 29839–45. doi : 10,1074 / jbc.M103106200 . PMID 11390394 .
Struyf S, Menten P, Lenaerts JP, Put W, D'Haese A, De Clercq E, Schols D, Proost P, Van Damme J (červenec 2001). „Odlišné vazebné kapacity přírodních LD78beta izoforem makrofágový zánětlivý protein-1 alfa na CC chemokinových receptorů 1, 3 a 5 ovlivnit jejich anti-HIV-1 aktivitu a chemotaktické potence pro neutrofily a eosinofily“ . European Journal of Immunology . 31 (7): 2170–8. doi : 10.1002 / 1521-4141 (200107) 31: 7 <2170 :: AID-IMMU2170> 3.0.CO; 2-D . PMID 11449371 .
Miyakawa T, Obaru K, Maeda K, Harada S, Mitsuya H (únor 2002). "Identifikace aminokyselinových zbytků kritických pro LD78beta, varianta lidského makrofágového zánětlivého proteinu-1alfa, vazba na CCR5 a inhibice replikace viru lidské imunodeficience typu 1 R5" . The Journal of Biological Chemistry . 277 (7): 4649–55. doi : 10,1074 / jbc.M109198200 . PMID 11734558 .
Townson JR, Barcellos LF, Nibbs RJ (říjen 2002). „Počtem kopií genu reguluje produkci lidského chemokinového CCL3-L1“ . European Journal of Immunology . 32 (10): 3016–26. doi : 10.1002 / 1521-4141 (2002010) 32:10 <3016 :: AID-IMMU3016> 3.0.CO; 2-D . PMID 12355456 .
Modi WS (duben 2004). „Chemokinové geny CCL3L1 a CCL4L1 jsou lokalizovány v segmentální duplikaci na chromozomu 17q12“ . Genomika . 83 (4): 735–8. doi : 10.1016 / j.ygeno.2003.09.019 . PMID 15028295 .
Zhang Z, Henzel WJ (říjen 2004). "Predikce signálního peptidu na základě analýzy experimentálně ověřených štěpných míst" . Věda o bílkovinách . 13 (10): 2819–24. doi : 10.1110 / ps.04682504 . PMC 2286551 . PMID 15340161 .
Gonzalez E, Kulkarni H, Bolivar H, Mangano A, Sanchez R, Catano G, Nibbs RJ, Freedman BI, Quinones MP, Bamshad MJ, Murthy KK, Rovin BH, Bradley W, Clark RA, Anderson SA, O'connell RJ, Agan BK, Ahuja SS, Bologna R, Sen L, Dolan MJ, Ahuja SK (březen 2005). "Vliv segmentových duplikací genů obsahujících CCL3L1 na náchylnost k HIV-1 / AIDS". Věda . 307 (5714): 1434–40. Bibcode : 2005Sci ... 307.1434G . doi : 10,1126 / science.1101160 . PMID 15637236 . S2CID 8815153 .
Ryu OH, Choi SJ, Firatli E, Choi SW, Hart PS, Shen RF, Wang G, Wu WW, Hart TC (duben 2005). „Proteolýza makrofágových zánětlivých proteinů-1alfa izoforem LD78beta a LD78alfa serinovými proteázami odvozenými od neutrofilů“ . The Journal of Biological Chemistry . 280 (17): 17415–21. doi : 10,1074 / jbc.M500340200 . PMID 15728180 .
Burns JC, Shimizu C, Gonzalez E, Kulkarni H, Patel S, Shike H, Sundel RS, Newburger JW, Ahuja SK (červenec 2005). „Genetické variace v páru receptor-ligand CCR5 a CCL3L1 jsou důležitými determinanty citlivosti na Kawasakiho chorobu“ . The Journal of Infectious Diseases . 192 (2): 344–9. doi : 10,1086 / 430953 . PMC 2894631 . PMID 15962231 .

Languages

In other projects