Haploskupina L5 (mtDNA) - Haplogroup L5 (mtDNA)

Haploskupina L5
Možná doba vzniku 114 200–126 200 YBP
Možné místo původu Východní Afrika , údolí horního Nilu
Předek L2-6
Potomci L5a , L5c
Definování mutací 3423, 7972, 12432, 12950

Haploskupina L5 je clade lidské mitochondriální DNA (mtDNA). To bylo dříve známé jako L1e .

Původ

Rozdělení

L5 je malá haploskupina se středem ve východní Africe . Nejvyšší frekvence je u Mbuti Pygmejů z východní a střední Afriky na 15%. Je přítomen v relativně malých frekvencích v Tanzanii ( Sandawe a další), v Keni, Etiopii, Súdánu, Núbii, Egyptě a Saúdské Arábii.

Haploskupina L5 byla pozorována u exemplářů na ostrovním hřbitově v Kulubnarti v Súdánu , které pocházejí z raně křesťanského období (550–800 nl).

Subclades

Strom

Tento fylogenetický strom subcladů haploskupiny L5 je založen na příspěvku Mannisa van Ovena a Manfreda Kaysera Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA a následný publikovaný výzkum.

  • Nejnovější společný předek (MRCA)
    • L1-6
      • L2-6
        • L5
          • L5a
            • L5a1
              • L5a1a
              • L5a1b
              • L5a1c
            • L5a2
          • L5c
            • L5c1
            • L5c2

Reference

  1. ^ Soares, P; Ermini, L; Thomson, N; Mormina, M; Rito, T; Röhl, A; Salas, A; Oppenheimer, S; MacAulay, V (2009). "Oprava pro očistný výběr: Vylepšené lidské mitochondriální molekulární hodiny" . American Journal of Human Genetics . 84 (6): 740–59. doi : 10.1016 / j.ajhg.2009.05.001 . PMC   2694979 . PMID   19500773 .
  2. ^ a b van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13. října 2008). "Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA" . Lidská mutace . 30 (2): E386 – E394. doi : 10,1002 / humu.20921 . PMID   18853457 . S2CID   27566749 .
  3. ^ Sarah A. Tishkoff a kol. 2007, History of Click-Speaking Population of Africa Inferred from mtDNA and Y Chromosome Genetic Variation. Molecular Biology and Evolution 2007 24 (10): 2180-2195
  4. ^ Stevanovitch, A; A. Gilles; E. Bouzaid; R. Kefi; F. Paříž; RP Gayraud; JL Spadoni; F. El-Chenawi; E. Béraud-Colomb (29. ledna 2004). „Mitochondriální DNA sekvenční rozmanitost v sedavé populaci z Egypta“. Annals of Human Genetics . 68 (1): 23–39. doi : 10,1046 / j.1529-8817.2003.00057.x . PMID   14748828 . S2CID   44901197 .
  5. ^ Abu-Amero a kol. 2008 únor. „Struktura mitochondriální DNA na Arabském poloostrově“ , BMC Evolutionary Biology. 8 (45): 52.
  6. ^ Sirak, Kendra; Frenandes, Daniel; Novak, Mario; Van Gerven, Dennis; Pinhasi, Ron (2016). Abstract Book of the IUAES Inter-Congress 2016 - A community split? Odhalení komunitních genomů středověkého Kulubnarti pomocí sekvenování nové generace . IUAES. CS1 maint: používá parametr autorů ( odkaz )

Poznámky

externí odkazy

Fylogenetický strom haploskupin lidské mitochondriální DNA (mtDNA)

  Mitochondriální Eva ( L )    
L0 L1–6  
L1 L2   L3     L4 L5 L6
M N  
CZ D E G Q   Ó A S R   Já Ž X Y
C Z B F R0   před JT   P   U
HV JT K.
H PROTI J T


Ikona pahýl

Tento článek o genetice je útržek . Wikipedii můžete pomoci rozšířením .