Lantibiotika - Lantibiotics
Gallidermin | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||||
Symbol | Gallidermin | ||||||||
Pfam | PF02052 | ||||||||
InterPro | IPR006079 | ||||||||
SCOP2 | 1 mqy / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
TCDB | 1. C. 20 | ||||||||
Superrodina OPM | 161 | ||||||||
OPM protein | 1 mqy | ||||||||
|
Lantibiotika jsou třídou polycyklických peptidových antibiotik, která obsahují charakteristické thioetherové aminokyseliny lanthionin nebo methyllanthionin , jakož i nenasycené aminokyseliny dehydroalanin a 2-aminoisomáselná kyselina . Patří k ribozomálně syntetizovaným a posttranslačně modifikovaným peptidům .
Lanthionin se skládá ze dvou alaninových zbytků, které jsou zesítěné na svých atomy β-uhlíky thioetherovou (monosulfidovou) vazbou.
Lantibiotika produkuje velké množství grampozitivních bakterií, jako jsou Streptococcus a Streptomyces, za účelem napadení jiných grampozitivních bakterií, a jako taková jsou považována za členy bakteriocinů . Bakteriociny jsou klasifikovány podle rozsahu posttranslační modifikace . Lantibiotika jsou třídou rozsáhleji modifikovaných bakteriocinů, nazývaných také bakteriociny I. třídy . (Bakteriociny, pro které jsou disulfidové vazby jedinou modifikací peptidu, jsou bakteriociny třídy II .)
Lantibiotika jsou dobře studována kvůli komerčnímu využití těchto bakterií v potravinářském průmyslu pro výrobu mléčných výrobků, jako je sýr .
Nisin a epidermin jsou členy rodiny lantibiotik, které se vážou na lipid II , lipidovou složku prekurzoru buněčné stěny cílových bakterií a narušují produkci buněčné stěny. Duramycinu rodina lantibiotika váže fosfoethanolaminu v membránách svých cílových buněk a zdá se, že narušení několik fyziologických funkcí.
Dějiny
Název lantibiotika byl zaveden v roce 1988 jako zkratka pro „peptidová antibiotika obsahující lanthionin“. První struktury těchto antimikrobiálních látek byly vytvořeny průkopnickou prací Grosse a Morella na konci šedesátých a na začátku sedmdesátých let, což znamenalo formální zavedení lantibiotik. Od té doby se lantibiotika, jako je nisin, příznivě používají k uchovávání potravin a dosud se nesetkaly s významnou bakteriální rezistencí . Tyto atributy lantibiotik vedly k podrobnějšímu výzkumu jejich struktur a biosyntetických drah .
Klasifikace
- Typu A lantibiotika jsou dlouhé flexibilní molekuly - například nisin , bisin , subtilin , epidermin , gallidermin Podskupina AI obsahuje mutacin II; podskupina AII zahrnuje mutacin I a III.
- Lantibiotika typu B jsou kulovitá - např. Mersacidin . actagardin , duramycinu a cinnamycin .
Některé obsahují 2 peptidy, např. Haloduracin .
Příklady
Lantibiotikum | Typ | # zbytků |
Počet thioetherových odkazů |
Další odkazy |
odkazy |
---|---|---|---|---|---|
nisin subtilin |
A | 34 | 5 | 0 | |
gallidermin epidermin |
A | 21 | 3 | 1 | |
mersacidin | B | 20 | 4 | ||
aktagardina | B | 19 | 4 | 0 | |
cinnamycin duramycinu |
B | 19 | 3 | 1 | |
sublancin 168 | ? | 37 | 1 | 2 | |
plantaricin C | B | 27 | 4 | 0 |
(Sublancin může být S-vázaná glykopeptid .
Biosyntéza
Jsou syntetizovány vedoucí sekvencí polypeptidu, která je odstraněna pouze během transportu molekuly ze syntetizující buňky. Jsou syntetizovány ribozomy , které je odlišují od většiny přírodních antibiotik. Existují čtyři známé enzymy (lanthipeptid syntetázy) zodpovědné za produkci lanthioninových kruhů.
Mechanismus účinku
Lantibiotika vykazují značnou specificitu pro některé složky (např. Lipid II ) bakteriálních buněčných membrán, zejména grampozitivních bakterií. Lantibiotika typu A rychle zabíjejí tvorbou pórů, lantibiotika typu B inhibují biosyntézu peptidoglykanu. Jsou aktivní ve velmi nízkých koncentracích.
aplikace
Konzervace potravin
Lantibiotika jsou produkována grampozitivními bakteriemi a vykazují silné antimikrobiální působení vůči celé řadě dalších grampozitivních bakterií. Jako takové se staly atraktivními kandidáty pro použití při konzervaci potravin ( inhibicí patogenů, které způsobují zkažení potravin) a farmaceutickém průmyslu (k prevenci nebo potírání infekcí u lidí nebo zvířat).
Veterinární antibiotikum
Duramycin se používá pro kuřata.
Klinické antibiotikum
Jeden typ známý jako B lantibiotikum NVB302 vstoupil v roce 2011 do klinických studií fáze 1 pro použití proti Clostridium difficile a v roce 2012 hlásil dobré výsledky.
Databáze
BACTIBASE je otevřená databáze pro bakteriociny včetně lantibiotik. LANTIBASE je specifický lantibiotický zdroj.
Reference
Další čtení
- Jack R, Bierbaum G, Heidrich C, Sahl HG (září 1995). „Genetika lantibiotické biosyntézy“. BioEsays . 17 (9): 793–802. doi : 10,1002/bies.950170909 . PMID 8763832 . S2CID 32393523 .
- Sahl HG, Jack RW, Bierbaum G (červen 1995). „Biosyntéza a biologické aktivity lantibiotik s unikátními posttranslačními modifikacemi“ . Eur. J. Biochem . 230 (3): 827–53. doi : 10.1111/j.1432-1033.1995.0827g.x . PMID 7601145 .
- Sahl HG, Bierbaum G (1998). „Lantibiotika: biosyntéza a biologické aktivity unikátně modifikovaných peptidů z grampozitivních bakterií“. Annu. Rev. Microbiol . 52 : 41–79. doi : 10,1146/annurev.micro.52.1.41 . PMID 9891793 .
- Stein T (květen 2005). „Bacillus subtilis antibiotika: struktury, syntézy a specifické funkce“. Mol. Mikrobiol . 56 (4): 845–57. doi : 10.1111/j.1365-2958.2005.04587.x . PMID 15853875 . S2CID 20144405 .
- Smith JL (2002). Strukturální a funkční charakterizace lantibiotického mutacinu (PDF) (Ph.D.). University of Florida.
externí odkazy
- Lantibase , databáze lantibiotik
- „Kompletní seznam lantibiotik“ . Databáze BACTIBASE .