XBP1 - XBP1

XBP1
Identifikátory
Přezdívky	XBP1 , TREB5, XBP-1, XBP2, TREB-5, X-box vázající protein 1
Externí ID	OMIM : 194355 MGI : 98970 HomoloGene : 3722 Genové karty : XBP1
Umístění genu ( člověk )
Chr.	Chromozom 22 (člověk)
Konec	28 800 597 bp
Umístění genu ( myš )
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	5 525 893 bp
Vzorec pro expresi RNA
	Více referenčních výrazů
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na estrogenový receptor ; • aktivita homodimerizace proteinu ; • vazba proteázy ; • GO: vazba proteinu 0001948 ; • vazba protein kinázy ; • vazba DNA specifická pro sekvenci ; • GO: 0001158 vazba DNA specifická pro cis-regulační oblast sekvence ; • aktivita heterodimerizace proteinu ; • vazba chromatinové DNA ; • ubikvitin protein ligáza vazba ; • vazebné DNA ; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 DNA vázající transkripční faktor aktivity ; • vázání RNA polymerázy II transkripční regulační oblast specifická pro sekvenci DNA ; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO : 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II ; • GO: 0000980 RNA polymeráza II vazba DNA specifická pro sekvenci v cis-regulační oblasti ; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• cytosol ; • membrána ; • nedílnou součást membrány ; • Nucleoplasm ; • integrální součástí endoplazmatického retikula membrána ; • endoplazmatického retikula membrána ; • cytoplasma ; • endoplazmatické retikulum ; • jádro;
Biologický proces	• pozitivní regulace biosyntetického procesu MHC třídy II ; • pozitivní regulace fosforylace proteinů ; • negativní regulace reakce rozvinutého endoplazmatického retikula ; • pozitivní regulace produkce imunoglobulinu ; • vývoj svalových orgánů ; • signální dráha receptoru vaskulárního endotelového růstového faktoru ; • signalizace fosfatidylinositol 3-kinázy ; • apoptotický proces ; • regulace transkripce, templátovaná DNA ; • regulace stability proteinu ; • homeostáza glukózy ; • transkripce, templátovaná DNA ; • buněčný růst ; • pozitivní regulace apoptotického procesu endoteliálních buněk ; • reakce na rozvinutý protein ; • biosyntetický proces mastné kyseliny ; • transport proteinu ; • pozitivní regulace signalizace TOR ; • vývoj exokrinní slinivky ; • negativní regulace vnitřní apoptotické signální dráhy vyvolané stresem endoplazmatického retikulu ; • buněčná diferenciace ; • pozitivní regulace autofagie ; • buněčná odpověď na napětí ve smyku laminární tekutiny ; • pozitivní regulace transkripce z R Promotor NA polymerázy II v reakci na stres endoplazmatického retikula ; • pozitivní regulace diferenciace B buněk ; • negativní regulace transkripce RNA polymerázou II ; • buněčná odpověď na stres ve smyku tekutin ; • organizace organel ; • regulace autofagie ; • imunitní odpověď ; • pozitivní regulace katabolické proteázy proces ; • pozitivní regulace diferenciace plazmatických buněk ; • pozitivní regulace diferenciace T lymfocytů ; • pozitivní regulace endoplazmatického retikula rozvinutá odezva proteinu ; • pozitivní regulace histonové methylace ; • metabolismus lipidů ; • zrání epiteliálních buněk zapojených do vývoje slinných žláz ; • pozitivní regulace acetylace proteinů ; • pozitivní regulace katabolického procesu proteinů závislých na ubikvitinu závislých na ER ; • autofagie ; • vývoj mnohobuněčných organismů ; • reakce rozvinutého proteinu zprostředkovaná ATF6 ; • reakce rozvinutého proteinu zprostředkovaná IRE1 ; • vnitřní apoptotická signální dráha v reakci na endoplazmatické retikulum st ress ; • zrání epiteliálních buněk ; • buněčná reakce na oxidační stres ; • buněčná odpověď na stimul vaskulárního endoteliálního růstového faktoru ; • destabilizace proteinu ; • buněčná odpověď na stimul peptidového hormonu ; • pozitivní regulace transkripce RNA polymerázou II ; • negativní regulace fosforylace proteinů SMAD omezených na cestu ; • vývoj tukové tkáně ; • pozitivní regulace vaskulární migrace buněk hladkého svalstva ; • vývoj jater ; • buněčná homeostáza triglyceridů ; • homeostáza cholesterolu ; • negativní regulace signální dráhy transformačního růstového faktoru beta receptoru ; • pozitivní regulace laktace ; • buněčná odpověď na stimul aminokyselin ; • angiogeneze ; • buněčná reakce na hladovění glukózy ; • reakce na stimul růstového faktoru podobného inzulínu ; • negativní regulace kaskády ERK1 a ERK2 ; • homeostáza mastných kyselin ; • pozitivní regulace proliferace buněk hladkého svalstva asociovaných s cévami ; • pozitivní regulace proliferace hepatocytů n ; • homeostáza sterolů ; • buněčná odpověď na interleukin-4 ; • pozitivní regulace signalizace protein kinázy B ; • katabolický proces proteinů závislých na ubikvitin ; • pozitivní regulace diferenciace tukových buněk ; • negativní regulace apoptotického procesu ; • proliferace endoteliálních buněk ; • transkripce RNA polymerázou II ; • pozitivní regulace proliferace buněčné populace ; • negativní regulace diferenciace myotube ; • pozitivní regulace buněčné migrace ; • endoplazmatické retikulum rozvinutá proteinová odpověď ; • buněčná odpověď na živiny ; • buněčná odpověď na inzulínový podnět ; • reakce na stres endoplazmatického retikula ; • pozitivní regulace hojení cévních ran ; • pozitivní regulace angiogeneze ; • vývoj neuronů ; • buněčná odpověď na lipopolysacharid ; • buněčná odpověď na stimul fruktózy ; • buněčná odpověď na glukózový podnět ; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II zapojeného do reakce rozvinutého proteinu ; • buněčná odpověď na leukem mj. inhibiční faktor ; • pozitivní regulace importu proteinu do jádra ; • regulace buněčného růstu;
	Zdroje: Amigo / QuickGO
Ortology
	7494
	22433
	ENSG00000100219
	ENSMUSG00000020484
	P17861
	O35426
	NM_005080 ; NM_001079539 ; NM_001393999 ; NM_001394000
	NM_001271730 ; NM_013842
	NP_001073007 ; NP_005071
	NP_001258659 ; NP_038870
	Wikidata
Zobrazit/upravit člověka	Zobrazit/upravit myš

X-box vázající protein 1 , také známý jako XBP1 , je protein, který je u lidí kódován XBP1 genem . XBP1 gen je umístěn na chromozomu 22 , zatímco úzce souvisí pseudogen byl identifikován a lokalizované na chromozomu 5 . Protein XBP1 je transkripční faktor, který reguluje expresi genů důležitých pro správné fungování imunitního systému a pro reakci buněčného stresu.

Objev

Protein 1 vázající X-box (XBP1) je transkripční faktor obsahující doménu bZIP . To bylo poprvé identifikován podle své schopnosti vázat se na Xbox, konzervovanou transkripční prvek v promotoru z lidského leukocytů antigenu (HLA) DR alfa .

Funkce

Regulace genů MHC třídy II

Exprese tohoto proteinu je nutná pro transkripci podskupiny hlavních genů histokompatibility třídy II . Kromě toho XBP1 heterodimerizuje s jinými transkripčními faktory bZIP, jako je c-fos .

Exprese XBP1 je řízena cytokinem IL-4 a protilátkou IGHM . XBP1 zase řídí expresi IL-6, který podporuje růst plazmatických buněk, a imunoglobulinů v B lymfocytech .

Diferenciace plazmatických buněk

XBP1 je rovněž nezbytné pro diferenciaci z plazmatických buněk (druh protilátky, vylučujících imunitních buněk). Tato diferenciace vyžaduje nejen expresi XBP1, ale také expresi sestříhané izoformy XBP1s. XBP1 reguluje diferenciaci plazmatických buněk nezávisle na jejích známých funkcích v stresové reakci endoplazmatického retikula (viz níže). Bez normální exprese XBP1 jsou dva důležité geny související s diferenciací plazmatických buněk, IRF4 a Blimp1, nesprávně regulovány, a plazmatické buňky postrádající XBP1 nedokážou kolonizovat své dlouhotrvající výklenky v kostní dřeni a udržet sekreci protilátek.

Diferenciace eozinofilů

XBP1 je vyžadován pro diferenciaci eozinofilů . Eozinofily postrádající XBP1 vykazují defekty v granulovaných proteinech.

Angiogeneze

XBP1 působí tak, že reguluje proliferaci endoteliálních buněk cestami růstového faktoru, což vede k angiogenezi . XBP1 navíc chrání endoteliální buňky před oxidačním stresem interakcí s HDAC3 .

Virová replikace

Tento protein byl také identifikován jako buněčný transkripční faktor, který se váže na zesilovač promotoru lidského T-lymfotropního viru 1 . Generování XBP1 během diferenciace plazmatických buněk se také zdá být klíčem k reaktivaci herpesviru spojeného s Kaposiho sarkomem a viru Epstein Barr z latence.

Reakce na stres endoplazmatického retikula

XBP1 je součástí stresové reakce endoplazmatického retikula (ER), rozvinuté proteinové odpovědi (UPR). Podmínky, které překračují kapacitu ER, vyvolávají stres ER a vyvolávají reakci rozvinutého proteinu (UPR). V důsledku toho se GRP78 uvolňuje z IRE1 na podporu skládání proteinů. IRE1 oligomerizuje a aktivuje svou doménu ribonukleázy pomocí automatické (vlastní) fosforylace . Aktivovaný IRE1 katalyzuje excizi 26 nukleotidového nekonvenčního intronu z všudypřítomně exprimované mRNA XBP1u způsobem mechanisticky podobným sestřihu pre-tRNA. Odstranění tohoto intronu způsobí posun rámce v sekvenci kódující XBP1, což vede k translaci izoformy 376 aminokyselin, 40 kDa, XBP-1s spíše než 261 aminokyselin, 33 kDa, XBP1u. Navíc poměr XBP1u/XBP1s (poměr XBP1-nesestřižený/XBP1-spojený) koreluje s úrovní exprese exprimovaných proteinů, aby se přizpůsobila skládací schopnost ER příslušným požadavkům.

Klinický význam

Abnormality v XBP1 vedou ke zvýšenému stresu ER a následně způsobují zvýšenou náchylnost k zánětlivým procesům, které mohou přispívat k Alzheimerově chorobě . V tlustém střevě byly anomálie XBP1 spojeny s Crohnovou chorobou .

Jednotlivým polymorfismem , C116G, v promotorové oblasti XBP1 byla zkoumána pro možné sdružení s rysy osobnosti . Žádné nebyly nalezeny.

Languages

In other projects