2011 Německo E. coli O104: vypuknutí H4 -2011 Germany E. coli O104:H4 outbreak

2011 Německo *E. coli* O104: vypuknutí H4
2011 Německo E. coli O104: vypuknutí H4
	Schistocyty pozorované u osoby s hemolyticko-uremickým syndromem
	Mapa případů a omezení v souvislosti s ohniskem (klikněte pro klíč a zvětšená verze)
Kmen bakterií	Escherichia coli O104: H4
Zdroj	Znečištěné organické klíčky pískavice
Umístění	Západní a severní Evropa , Spojené státy a Kanada
První ohnisko	Aachen , Německo
datum	1. května - 21. července 2011
Potvrzené případy	3950
Těžké případy	800
Úmrtí	53

Nový kmen bakterií Escherichia coli O104: H4 způsobil v květnu až červnu 2011 vážné ohnisko nemocí přenášených potravinami zaměřených v severním Německu. Nemoc byl charakterizován krvavým průjmem s vysokou frekvencí závažných komplikací, včetně hemolyticko-uremického syndromu (HUS ), což je stav, který vyžaduje naléhavou léčbu. Původně se předpokládalo, že toto ohnisko bylo způsobeno enterohemoragickým (EHEC) kmenem E. coli , ale později se ukázalo, že bylo způsobeno enteroaggregačním kmenem E. coli (EAEC), který získal geny k produkci toxinů Shiga , přítomné v organických výhoncích pískavice .

Epidemiologické terénní práce naznačovaly, že zdrojem infekce byla čerstvá zelenina. Ministr zemědělství Dolního Saska označil za pravděpodobný zdroj ohniska E. coli ekologickou farmu v německém Bienenbüttelu , která produkuje různé naklíčené potraviny . Farma byla zavřená. Ačkoli laboratoře v Dolním Sasku nezjistily bakterii v produktech, laboratoř v Severním Porýní-Vestfálsku později našla vypuklý kmen ve vyřazeném balíčku klíčků z podezřelé farmy. Kontrolní vyšetřování potvrdilo farmu jako zdroj ohniska. Dne 30. června 2011 německý Bundesinstitut für Risikobewertung (BfR) (Spolkový institut pro hodnocení rizik), institut německého spolkového ministerstva pro výživu, zemědělství a ochranu spotřebitele , oznámil, že pravděpodobně zdrojem semen organické pískavice dovážené z Egypta nákaza.

Celkem bylo zasaženo 3 950 lidí a 53 zemřelo, 51 z nich bylo v Německu. 800 lidí trpělo hemolyticko -uremickým syndromem (HUS), který může vést k selhání ledvin. Několik případů bylo hlášeno v několika dalších zemích, včetně Švýcarska , Polska , Nizozemska , Švédska , Dánska , Velké Británie, Kanady a USA. V podstatě všichni postižení lidé byli krátce před onemocněním v Německu nebo ve Francii.

Zpočátku němečtí představitelé uváděli nesprávná prohlášení o pravděpodobném původu a kmeni Escherichia coli . Německé zdravotní úřady bez výsledků probíhajících testů nesprávně spojily sérotyp O104 s okurkami dovezenými ze Španělska. Později poznali, že španělské skleníky nejsou zdrojem E. coli a vzorky okurek neobsahovaly konkrétní variantu E. coli způsobující ohnisko. Španělsko následně vyjádřilo hněv nad tím, že je jeho produkce spojena se smrtící epidemií E. coli , která stála španělské vývozce 200 milionů USD týdně. Rusko od začátku června do 22. června 2011 zakázalo dovoz veškeré čerstvé zeleniny z Evropské unie.

Pozadí

Enterohemoragická E. coli je přinejmenším od počátku 80. let 20. století spojována s propuknutím krvavých průjmů a hemolyticko -uremického syndromu v potravinách. Většina onemocnění byla přičítána E. coli se sérotypem O157: H7 ; s lidským průjmovým onemocněním je však spojeno více než 100 sérotypů E. coli .

V pěti letech před vypuknutím (2006 až 2010) zaznamenalo Německo v průměru 218 případů gastroenteritidy EHEC a 13 případů hemolyticko -uremického syndromu ročně. Podle německého národního referenčního centra pro salmonely a jiné enterické patogeny byly v těchto letech nejběžnější sérotypy O157, O26, O103 a O91. V letech před vypuknutím nákazy byl sérotyp O104 v Evropě relativně vzácný, v letech 2004 až 2009 bylo v EU a Norsku hlášeno pouze 11 případů.

Nákaza

Případy

Případy začaly již 1. května 2011 a muž v Cáchách hlásil krvavý průjem. Případy se poté rychle zvýšily, každý den do 16. května bylo hlášeno více než 100 případů EHEC gastroenteritidy a/nebo HUS. Epidemie se soustředila na pět severoněmeckých států Hamburk, Šlesvicko-Holštýnsko, Brémy, Dolní Sasko a Meklenbursko-Přední Pomořansko. Případy budou nakonec hlášeny ve všech 16 německých státech; nicméně většina případů mimo severní státy byla spojena s cestováním v severním Německu. Kromě toho byl hlášen malý počet případů z jiných zemí, ačkoli většina nemocných již dříve cestovala do Německa. Nejvýznamnější ohnisko mimo Německo bylo v Bordeaux ve Francii, kde bylo 15 případů EHEC gastroenteritidy spojeno se stejným kmenem E. coli, který způsobil vypuknutí v Německu. Francouzské případy dříve necestovaly do Německa, což naznačuje, že bakterie získali kontaminovanými klíčky pěstovanými ve Francii. Případy EHEC HUS a gastroenteritidy vyvrcholily 21. a 22. května. Případy pak následující měsíc pomalu klesaly, přičemž případy byly hlášeny v průběhu měsíce června a končily v průběhu července 2011. Německé úřady považovaly vypuknutí za začátkem července 2011.

Epidemie nepřiměřeně zasáhla dospělé a starší osoby. 88% pacientů s hemolyticko-uremickým syndromem bylo starších 17 let a medián věku pacientů s hemolyticko-uremickým syndromem byl 42 let. Střední věk pacientů, kteří zemřeli na gastroenteritidu, byl 82 let, zatímco medián věku pacientů, kteří zemřeli na hemolyticko-uremický syndrom, byl 74 let.

Věřilo se, že většina nebo všechny oběti se nakazily v Německu nebo ve Francii. Potvrzené případy jsou uvedeny níže podle místa, kde byly diagnostikovány.

Počet případů hlášených WHO ke dni 21. července 2011
Země	Případy mimo HUS	HUS případy	Úmrtí
Rakousko	4	1	0
Kanada	1	0	0
Česká republika	1	0	0
Dánsko	16	10	0
Francie	4	9	0
Německo	2947	818	51
Řecko	1	0	0
Lucembursko	1	1	0
Holandsko	7	4	0
Norsko	1	0	0
Polsko	1	2	0
Španělsko	1	1	0
Švédsko	35	18	1
Švýcarsko	5	0	0
Spojené království	3	4	0
Spojené státy	2	4	1
Celkový	2987	855	53

Vyšetřování zdroje

Vyšetřování příčiny ohniska oficiálně začalo oznámením Institutu Roberta Kocha ze dne 19. května o třech případech HUS u dětí v Hamburku. 26. května němečtí zdravotničtí představitelé narychlo a předčasně oznámili, že okurky ze Španělska byly identifikovány jako zdroj ohniska E. coli v Německu, přičemž ve skutečnosti byly zdrojem egyptské klíčky. Dne 27. května 2011 vydali němečtí představitelé výstrahu distribuovanou do okolních zemí, která identifikovala organické okurky ze Španělska a stáhla je z trhu. Evropská komise 27. května uvedla, že dva španělské skleníky, u nichž se předpokládalo, že jsou zdrojem, byly uzavřeny a jsou vyšetřovány. Šetření zahrnovalo analýzu vzorků půdy a vody z dotyčných skleníků, nacházejících se v oblasti Andalusie , s výsledky očekávanými do 1. června. Vzorky okurek z andaluských skleníků nevykazovaly kontaminaci E. coli , ale křížová kontaminace při přepravě v Německu a distribuci v Hamburku není zlevněna; ve skutečnosti je nejpravděpodobnější příčinou křížová kontaminace uvnitř Německa. Institut Robert Koch v Německu nedoporučuje jíst surová rajčata, okurky a saláty, aby se předešlo dalším případům.

31. května úředník EU uvedl, že dopravní řetězec je tak dlouhý, že okurky ze Španělska mohly být kontaminovány v kterémkoli místě tranzitní trasy. Španělští představitelé již dříve uvedli, že neexistuje žádný důkaz, že ohnisko pochází ze Španělska; Španělský státní tajemník pro evropské záležitosti Diego López Garrido řekl: „Původ této nemoci nemůžete připsat Španělsku.“

V úterý 31. května laboratorní testy ukázaly, že dvě ze čtyř zkoumaných okurek obsahovaly kmeny E. coli produkující toxiny , ale ne kmen O104 nalezený u pacientů. Bakterie v dalších dvou okurkách zatím nebyly identifikovány.

Genomické sekvenování pomocí BGI Shenzhen potvrzuje zjištění z roku 2001, že sérotyp O104 : H4 má některé enteroaggregační vlastnosti E. coli (EAEC nebo EAggEC), pravděpodobně získané horizontálním přenosem genu .

Jediný předchozí zdokumentovaný případ EHEC O104: H4 byl v Jižní Koreji v roce 2005 a vědci poukázali na kontaminované hamburgery jako na možnou příčinu.

Dne 4. června němečtí a evropští úředníci údajně zkoumali údaje, které naznačovaly, že otevřená cateringová akce v restauraci v německém Lübecku byla možným výchozím bodem pokračujícího smrtelného vypuknutí E. coli v Evropě. Německé nemocnice byly téměř zahlceny počtem obětí E. coli .

Mluvčí ministerstva zemědělství v Dolním Sasku varoval 5. června lidi, aby přestali jíst místní klíčky fazolí , protože se staly nejnovější podezřelou příčinou vypuknutí E. coli . Jako pravděpodobný zdroj byla oznámena farma v Bienenbuettel v Dolním Sasku, ale 6. června úředníci uvedli, že to nelze doložit testy. Ze 40 vzorků z farmy, které byly zkoumány, mělo 23 negativní test. Ale 10. června vedoucí Institutu Roberta Kocha potvrdil, že zdrojem ohniska jsou klíčky a u lidí, kteří klíčky jedli, byla devětkrát vyšší pravděpodobnost krvavého průjmu. WHO potvrdila dne 10. června tohoto prohlášení o aktualizaci 13 EHEC ohniska.

Podle vedoucího národní laboratoře E. coli v německém Spolkovém institutu pro hodnocení rizik koluje kmen zodpovědný za vypuknutí v Německu již 10 let a u lidí nikoli skotu. Řekl, že se do potravin pravděpodobně dostalo lidskými výkaly.

Společné hodnocení rizik EFSA / ECDC , vydané 29. června 2011, vytvořilo spojení mezi německým ohniskem a vypuknutím HUS v oblasti Bordeaux ve Francii, které bylo poprvé hlášeno 24. června a při kterém došlo k infekci E. coli O104: H4 bylo potvrzeno u několika pacientů. Hodnocení zahrnovalo semena pískavice dovážená z Egypta v letech 2009 a 2010, z nichž byly pěstovány klíčky, jako společný zdroj obou ohnisek, ale varoval: „stále existuje velká nejistota ohledně toho, zda je to skutečně běžnou příčinou infekcí“, protože testy na semenech dosud nenalezly žádné bakterie E. coli kmene O104: H4. Potenciálně kontaminovaná semena byla široce distribuována v Evropě. Egypt naopak vytrvale popíral, že by mohl být zdrojem smrtícího kmene E. coli , přičemž ministr zemědělství nazval spekulace v tomto smyslu „naprosté lži“.

Pomocí epidemiologických metod byla ohniska v roce 2011 vysledována k přepravě semen z Egypta, která dorazila do Německa v prosinci 2009.

Mezinárodní reakce

Evropská unie

Dne 22. května komisař pro zdraví John Dalli z Evropské komise prohlásil tento problém za 'absolutní prioritu', přičemž řekl, že komise spolupracuje s členskými státy, zejména s Německem, na identifikaci zdroje ohniska. Komisař Dalli, který hovořil znovu 1. června, poznamenal, že ohniska jsou omezena na původ ve větší oblasti Hamburku a prohlásil, že jakýkoli zákaz produktů by byl nepřiměřený. Řekl také, že spolupracuje s komisařem pro zemědělství Dacianem Cioloşem "na řešení těžkostí, kterým čelí tato skupina našich občanů, která byla také silně zasažena vypuknutím E. coli ". Také řekl: „V budoucnu musíme zjistit, jak může být načasování výstrah blíže skutečnému vědeckému základu a důkazům.“

Do 7. června uspořádali ministři EU mimořádné zasedání v Lucemburku, aby prodiskutovali rostoucí krizi, která si vyžádala 23 mrtvých a dosud více než 2 000 nemocných. Německá spolková ministryně zemědělství Ilse Aignerová zopakovala svá varování pro spotřebitele z EU, aby se vyhnuli konzumaci jakýchkoli fazolových klíčků, okurek, rajčat a salátů .

Americké centrum pro kontrolu nemocí a americké ministerstvo zemědělství se dlouhodobě obávají rizik spojených s rizikem E. coli při produkci surových klíčků.

Členské státy EU

Kromě německé vlády, která varovala před konzumací všech syrových okurek, rajčat a salátu, zavedlo několik zemí omezení nebo zákaz dovozu produktů.

Evropské země mimo EU

Mnoho dalších evropských zemí přijalo omezující opatření nebo ztratilo prodej produktů, včetně Albánie, Chorvatska a Ruska.

Zákaz zeleniny v EU byl zrušen 10. června, ale přísná bezpečnostní opatření zůstala v platnosti.

střední východ

Mnoho zemí přijalo omezující opatření. Egypt byl ohniskem epidemiologického vyšetřování, protože semena pískavice byla dovezena do Německa z Egypta.

Egyptský ministr zdravotnictví Ashraf Hatem popřel, že by jeho národ měl nějaké pacienty nakažené novým kmenem E. coli , kvůli přísným opatřením zavedeným k testování zámořských turistů vstupujících do země 2. června.

Egyptský ministr zemědělství Ayman Abu-Hadid v reakci na tvrzení, že příčinou vypuknutí E. coli byla semena pískavice řecké egyptské, sdělil egyptský ministr zemědělství Ayman Abu-Hadid egyptskému tisku, že problém nemá s Egyptem nic společného, a místo toho prohlásil: „Izrael vede obchodní válku proti egyptskému vývoz. "

Severní Amerika

Kanada a Spojené státy hlásily případy infekce E. coli získané v Evropě.

Dne 2. června Kanada zavedla přísnější kontroly potravin související s E. coli a do 3. června Kanadská agentura pro veřejné zdraví uvedla, že k tomuto datu nebyl hlášen žádný Kanaďan nemocný kmenem. Kanadská vláda také zavedla přísnější dovozní a hygienická omezení pro okurky, saláty a rajčata z EU.

United States Department of Agriculture a Food and Drug Administration (FDA) uvedl, že rozvíjející se kmeny E. coli jsou významným problémem, ale regulační orgány ve Spojených státech amerických se soustředili na další nechvalně známé E. coli O157 sérotyp.

FDA poznamenal, že téměř všechny americké čerstvé produkty se pěstují v USA a oblastech Střední Ameriky a EU pro USA nepředstavuje významný zdroj čerstvé produkce.

Ostatní země

Jiné země, včetně Nigérie, Hongkongu a Thajska, vyjádřily obavy ohledně dovážené produkce.

Ekonomika

Do 1. června začaly prodeje italských, rakouských a francouzských okurek prudce klesat, ale úředník rakouského ministerstva zdravotnictví dr. Pamela Rendi-Wagner tvrdil, že rakouští zákazníci jsou stále v bezpečí.

Dne 3. června vlády Španělska, Portugalska a Německa uvedly, že formálně požádají zemědělskou pomoc EU pro zemědělce zasažené epidemií. Ten den Rusko také stanovilo plány na nový dovoz okurek z Ukrajiny, Ázerbájdžánu, Egypta a Turecka.

Do 7. června farmáři EU oznámili, že během vypuknutí nákazy přišli o miliony dolarů na vývoz, přičemž španělská skupina pro ovocný a zeleninový průmysl Fepex uvedla, že její pěstitelé mají obrat 256 000 000 USD. Podobně byli postiženi také francouzští, švýcarští, bulharští, němečtí, holandští, belgičtí a portugalští výrobci.

Toho dne EU navrhla vydat zemědělcům kompenzaci ve výši 135 000 000 GBP. Eurokomisař pro zemědělství uvedl, že zemědělci EU by mohli získat zpět až 30% nákladů na zeleninu, kterou nebyli schopni prodat. Evropský komisař pro zdraví John Dalli ten den formálně kritizoval Německo za unáhlení „předčasných závěrů“ o zdroji ohniska nákazy a pomohlo pouze rozšířit poplach mezi veřejností a zemědělci a předčasně vést k poškození zemědělského odvětví EU . John Dalli také řekl evropskému parlamentu ve Štrasburku, že tvrzení musí být vědecky podložená, nezaujatá a spolehlivá, než bude v budoucnu zveřejněna.

Španělsko poté odmítlo kompenzační dohodu Evropské komise o 150 000 000 EUR/135 000 000 GBP pro jejich farmáře, kteří byli zasaženi vypuknutím E. coli , 8. června s tím, že je příliš malá. Francie, největší zemědělský pěstitel v Evropské unii, uvedla, že podle francouzského ministra zemědělství Bruna Le Maira podpoří plán na odškodnění producentů poškozených vypuknutím epidemie .

Ministři z EU i Ruska se měli sejít 8. června kvůli dřívějšímu ruskému rozhodnutí zakázat veškerý dovoz zeleniny z EU.

Odhaduje se , že 8. června stálo ohnisko E. coli O104: H4 v EU 2 840 000 000 USD na lidských ztrátách (například nemocenské), bez ohledu na materiální ztráty (například na dumpingové okurky).

Spotřebitelé v celé Evropě se do 8. června hromadně vyhýbali ovoci a zelenině , protože německý vládní dekret proti pojídání syrových okurek, rajčat, salátu a klíčků zůstal zachován. Zemědělci v EU tvrdili, že mají ztráty až 417 000 000 C týdně, protože na jejich polích a ve skladech shnívá zralá zelenina. Dne 8. června komisař EU pro zemědělství Dacian Ciolos uvedl, že EU zvýšila svou nabídku kompenzací zemědělcům za ztráty způsobené vypuknutím E. coli na 210 000 000 C $.

Způsobit

Vypuknutí bylo způsobeno kmenem E. coli sérotypu O104: H4, který byl neobvyklý pro vlastnosti jak enteroagregativní E. coli, tak enterohemoragické E. coli . Kmen má řadu genů virulence typické pro enteroaggregační E. coli , včetně attA , aggR , aap , aggA a aggC , navíc k variantě Shiga toxinu 2. Všechny bakterie izolované od pacientů v tomto ohnisku byly rezistentní na beta-laktam antibiotika, cefalosporiny třetí generace a částečně rezistentní na kyselinu nalidixovou , ale citlivou na karbapenemy a ciprofloxacin .

Languages

In other projects