ABO (gen) - ABO (gene)

ABO
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologů : PDBe RCSB
Seznam ID kódů PDB
	1LZ0 , 1LZ7 , 1LZI , 1LZJ , 1R7T , 1R7U , 1R7V , 1R7X , 1R7Y , 1R80 , 1R81 , 1R82 , 1WSZ , 1WT0 , 1WT1 , 1WT2 , 1WT3 , 1XZ6 , 1ZHJ , 1ZI1 , 1ZI3 , 1ZI4 , 1ZI5 , 1ZIZ , 1ZJ0 , 1ZJ1 , 1ZJ2 , 1ZJ3 , 1ZJO , 1ZJP , 2A8U , 2A8W , 2I7B , 2O1F , 2O1G , 2O1H , 2PGV , 2RIT , 2RIX , 2RIY , 2RIZ , 2RJ0 , 2RJ1 , 2RJ4 , 2RJ5 , 2RJ6 , 2RJ7 , 2RJ8 , 2RJ9 , 2Y7A , 3I0C , 3I0D , 3I0E , 3I0F , 3I0G , 3I0H , 3I0I , 3I0J , 3I0K , 3I0L , 3IOH , 3IOI , 3IOJ , 3SX3 , 3SX5 , 3SX7 , 3SX8 , 3SXA , 3SXB , 3SXC , 3SXD , 3SXE , 3SXG , 3U0X , 3U0Y , 3V0L , 3V0M , 3V0N , 3V0O , 3V0P , 3V0Q , 3ZGF , 4C2S , 4KC1 , 4KC2 , 4KC4 , 3ZGG , 4FQW , 4FRA , 4FRB , 4FRD , 4FRE , 4FRH , 4FRL , 4FRO , 4FRP , 4FRQ , 4GBP , 4KXO , 4Y62 , 4Y63 , 4Y64 , 5BXC , 5C1G , 5C1H , 5C1L , 5C36 , 5C38 , 5C3A , 5C3B , 5C3D , 5C47 , 5C48 , 5C49 , 5C4B , 5C4C , 5C4D , 5C4E , 5C4F , 5C8R , 5CMI , 2PGY
Identifikátory
Přezdívky	Krevní skupina ABO , A3GALNT, A3GALT1, GTB, NAGAT, ABO (transferáza A, alfa 1-3-N-acetylgalaktosaminyltransferáza; transferáza B, alfa 1-3-galaktosyltransferáza), alfa 1-3-N-acetylgalaktosaminyltransferáza a alfa 1-3 -galaktosyltransferáza
Externí ID	OMIM : 110300 MGI : 2135738 HomoloGene : 69306 Genové karty : ABO
Číslo ES	2.4.1.37 2.4.1.40, 2.4.1.37
Umístění genu ( člověk )
Chr.	Chromozom 9 (člověk)
Konec	133 276 024 bp
Umístění genu ( myš )
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	26 864 979 bp
Vzorec pro expresi RNA
	; ;
	Více referenčních výrazů
Genová ontologie
Molekulární funkce	• acyltransferázové aktivity ; • aktivitu hexosyltransferasy ; • vázání kovových iontů ; • fucosylgalactoside 3-alfa-galaktosyltransf erázy aktivitu ; • glykoprotein-fucosylgalactoside alfa-N-acetylgalactosaminyltransferase aktivity ; • aktivitu glykosyltransferázy ; • nukleotid vázající ; • GO: vázající antigen 0003823 ; • mangan ion-vázající;
Buněčná složka	• integrální součást membrány ; • extracelulární oblast ; • Golgiho cisterna membrána ; • membrána ; • Golgiho aparát ; • váček;
Biologický proces	• proteinová glykosylace ; • biosyntetický proces glykolipidů ; • lipidová glykosylace ; • metabolický proces sacharidů;
	Zdroje: Amigo / QuickGO
Ortology
	28
	80908
	ENSG00000175164 ; ENSG00000281879
	ENSMUSG00000015787
	P16442
	P38649
	NM_020469
	NM_030718 ; NM_001290444
	NP_065202
	NP_001277373 ; NP_109643
	Wikidata
Zobrazit/upravit člověka	Zobrazit/upravit myš

Histo-krevní skupiny ABO systém transferáza je enzym s glykosyltransferázy činnosti, který je kódován ABO genu u lidí. Je všudypřítomně exprimován v mnoha tkáních a typech buněk. ABO určuje krevní skupinu ABO jedince úpravou oligosacharidů na glykoproteinech na povrchu buněk. Variace v sekvenci proteinu mezi jednotlivci určují typ modifikace a krevní skupinu. ABO gen také obsahuje jeden z 27 SNP spojených se zvýšeným rizikem ischemické choroby srdeční .

Struktura

ABO gen je umístěn na chromosomu 9 v pásmu 9q34.2 a obsahuje 7 exonů . ABO lokus kóduje tři alely . Alela A produkuje a-1,3-N-acetylgalaktosamintransferázu (A-transferázu), která katalyzuje přenos GalNAc zbytků z UDP-GalNAc donorového nukleotidu na Gal zbytky akceptorového H antigenu , převádějící H antigen na A antigen u jedinců A a AB. Alela B kóduje a-1,3-galaktosyltransferázu (B-transferázu), která katalyzuje přenos Gal zbytků z UDP -Gal donorového nukleotidu na Gal zbytky akceptorového H antigenu, převádí H antigen na B antigen v Jednotlivci B a AB. Je pozoruhodné, že rozdíl mezi enzymy glykosyltransferázy A a B je pouze čtyři aminokyseliny . Alele O chybí obě enzymatické aktivity kvůli posunu rámce způsobenému delecí guaninu-258 v genu, který odpovídá oblasti poblíž N-konce proteinu. To má za následek posun snímků a translaci téměř úplně jiného proteinu. Tato mutace vede k tomu, že protein není schopen modifikovat oligosacharidy, které končí fukózou spojenou s galaktózou . U O jedinců tedy není nalezen žádný A nebo B antigen. Tato kombinace cukrů se nazývá H antigen . Tyto antigeny hrají důležitou roli ve shodě transfuze krve a transplantace orgánů . Pro tento gen byly nalezeny další menší alely.

Běžné alely

U jedinců evropského původu je šest společných alel . Téměř každý živý lidský fenotyp pro gen ABO je kombinací právě těchto šesti alel:

A
- A101 (A1)
- A201 (A2)
B
- B101 (B1)
Ó
- O01 (O1)
- O02 (O1v)
- O03 (O2)

V lidské populaci po celém světě bylo nalezeno mnoho vzácných variant těchto alel.

Klinický význam

V lidských buňkách byly alely ABO a jejich kódované glykosyltransferázy popsány v několika onkologických podmínkách. Pomocí anti-GTA/GTB monoklonálních protilátek bylo prokázáno, že ztráta těchto enzymů korelovala s maligním močovým měchýřem a orálním epitelem. Exprese antigenů krevních skupin ABO v normálních lidských tkáních navíc závisí na typu diferenciace epitelu. U většiny lidských karcinomů, včetně orálního, je významnou událostí jako součásti základního mechanismu snížená exprese A a B antigenů. Několik studií zjistilo, že relativní down-regulace GTA a GTB se vyskytuje u orálních karcinomů v souvislosti s vývojem nádoru. Nověji studie široké asociace genomu (GWAS) identifikovala varianty v lokusu ABO spojené s náchylností k rakovině slinivky břišní .

Klinický marker

Studie skóre lokálního genetického rizika založená na kombinaci 27 lokusů , včetně genu ABO, identifikovala jedince se zvýšeným rizikem jak incidentů, tak rekurentních příhod koronární arteriální choroby, jakož i zvýšený klinický přínos léčby statiny. Studie vycházela z komunitní kohortové studie (studie Malmo Diet and Cancer) a čtyř dalších randomizovaných kontrolovaných studií s kohortami primární prevence (JUPITER a ASCOT) a kohortami sekundární prevence (CARE a PROVE IT-TIMI 22).

Reference

Další čtení

Nagai M, Davè V, Kaplan BE, Yoshida A (leden 1978). "Glykosyltransferázy lidské krevní skupiny. I. Čištění n-acetylgalaktosaminyltransferázy" . The Journal of Biological Chemistry . 253 (2): 377–9. doi : 10,1016/S0021-9258 (17) 38216-9 . PMID 618875 .
Takeya A, Hosomi O, Shimoda N, Yazawa S (září 1992). „Biosyntéza antigenu podobné GalNAc beta 1-> 3Gal beta 1-> 4GlcNAc/Glc struktury krevní skupiny P: nová N-acetylgalaktosaminyltransferáza v lidské krevní plazmě“. Časopis biochemie . 112 (3): 389–95. doi : 10,1093/oxfordjournals.jbchem.a123910 . PMID 1429528 .
Kominato Y, McNeill PD, Yamamoto M, Russell M, Hakomori S, Yamamoto F (listopad 1992). „Zvířecí histokrevní skupina ABO geny“. Komunikace biochemického a biofyzikálního výzkumu . 189 (1): 154–64. doi : 10,1016/0006-291X (92) 91538-2 . PMID 1449469 .
Yamamoto F, McNeill PD, Hakomori S (srpen 1992). „Lidská histo-krevní skupina A2 transferáza kódovaná alelou A2, jedním z podtypů A, je charakterizována delecí jedné báze v kódující sekvenci, což vede k další doméně na karboxylovém konci“. Komunikace biochemického a biofyzikálního výzkumu . 187 (1): 366–74. doi : 10,1016/S0006-291X (05) 81502-5 . PMID 1520322 .
Clausen H, White T, Takio K, Titani K, Stroud M, Holmes E, Karkov J, Thim L, Hakomori S (leden 1990). „Izolace na homogenitu a částečná charakterizace histokrevní skupiny A definovaná Fuc alfa 1 ---- 2Gal alfa 1 ---- 3-N-acetylgalaktosaminyltransferáza z lidské plicní tkáně“ . The Journal of Biological Chemistry . 265 (2): 1139–45. doi : 10,1016/S0021-9258 (19) 40169-5 . PMID 2104827 .
Yamamoto F, Marken J, Tsuji T, White T, Clausen H, Hakomori S (leden 1990). „Klonování a charakterizace DNA komplementární k lidské UDP-GalNAc: mRNA Fuc alfa 1 ---- 2Gal alfa 1 ---- 3GalNAc transferáza (transferáza histo-krevní skupiny A)“ . The Journal of Biological Chemistry . 265 (2): 1146–51. doi : 10,1016/S0021-9258 (19) 40170-1 . PMID 2104828 .
Yamamoto F, Hakomori S (listopad 1990). „Specifičnost donora cukru a nukleotidů histo-krevní skupiny A a B transferáz je založena na substitucích aminokyselin“ . The Journal of Biological Chemistry . 265 (31): 19257–62. doi : 10,1016/S0021-9258 (17) 30652-X . PMID 2121736 .
Whitehead JS, Bella S, Kim YS (červen 1974). „N-acetylgalaktosaminyltransferáza z plazmy lidské krevní skupiny A. II. Kinetické a fyzikálně chemické vlastnosti“ . The Journal of Biological Chemistry . 249 (11): 3448–52. doi : 10,1016/S0021-9258 (19) 42593-3 . PMID 4831223 .
Whitehead JS, Bella A, Kim YS (červen 1974). „N-acetylgalaktosaminyltransferáza z plazmy lidské krevní skupiny A. I. Čištění a vazebné vlastnosti pro agarózu“ . The Journal of Biological Chemistry . 249 (11): 442–7. doi : 10,1016/S0021-9258 (19) 42592-1 . PMID 4831233 .
Kobata A, Ginsburg V (březen 1970). „Uridindifosfát-N-acetyl-D-galaktosamin: D-galaktóza alfa-3-N-acetyl-D-galaktosaminyltransferáza, produkt genu, který určuje krevní skupinu A u člověka“ . The Journal of Biological Chemistry . 245 (6): 1484–90. doi : 10,1016/S0021-9258 (18) 63261-2 . PMID 5442829 .
Yoshida A, Yamaguchi H, Okubo Y (květen 1980). „Genetický mechanismus dědičnosti cis-AB. I. Případ spojený s nerovným chromozomálním křížením“ . American Journal of Human Genetics . 32 (3): 332–8. PMC 1686052 . PMID 6770676 .
Olsson ML, Thuresson B, Chester MA (listopad 1995). „Inzerce nukleotidů specifických pro alelovu alelu v lokusu ABO krevní skupiny a jejich detekce pomocí sekvenčně specifické polymerázové řetězové reakce“. Komunikace biochemického a biofyzikálního výzkumu . 216 (2): 642–7. doi : 10,1006/bbrc.1995.2670 . PMID 7488159 .
Bennett EP, Steffensen R, Clausen H, Weghuis DO, van Kessel AG (leden 1995). „Genomické klonování lokusu lidské histokrevní skupiny ABO“. Komunikace biochemického a biofyzikálního výzkumu . 206 (1): 318–25. doi : 10,1006/bbrc.1995.1044 . hdl : 2066/22100 . PMID 7598760 .
Yamamoto F, McNeill PD, Hakomori S (únor 1995). „Genomická organizace genů lidské histokrevní skupiny ABO“. Glycobiologie . 5 (1): 51–8. doi : 10,1093/glycob/5.1.51 . PMID 7772867 .
Bennett EP, Steffensen R, Clausen H, Weghuis DO, Geurts van Kessel A (červen 1995). „Genomické klonování lokusu lidské histokrevní skupiny ABO“. Komunikace biochemického a biofyzikálního výzkumu . 211 (1): 347. doi : 10,1006/bbrc.1995.1817 . hdl : 2066/22100 . PMID 7779106 .
Yamamoto F, McNeill PD, Kominato Y, Yamamoto M, Hakomori S, Ishimoto S, Nishida S, Shima M, Fujimura Y (1993). „Molekulárně genetická analýza systému krevních skupin ABO: 2. alely cis-AB“. Vox Sanguinis . 64 (2): 120–3. doi : 10.1111/j.1423-0410.1993.tb02529.x . PMID 8456556 . S2CID 23119465 .
Yamamoto F, McNeill PD, Yamamoto M, Hakomori S, Harris T (1993). „Molekulárně genetická analýza systému krevních skupin ABO: 3. A (X) a B (A) alely“. Vox Sanguinis . 64 (3): 171–4. doi : 10.1111/j.1423-0410.1993.tb05157.x . hdl : 2027,42/71979 . PMID 8484250 . S2CID 43662514 .
Ogasawara K, Yabe R, Uchikawa M, Saitou N, Bannai M, Nakata K, Takenaka M, Fujisawa K, Ishikawa Y, Juji T, Tokunaga K (říjen 1996). „Molekulárně genetická analýza variantních fenotypů systému krevních skupin ABO“ . Krev . 88 (7): 2732–7. doi : 10,1182/krev . V88.7.2732.bloodjournal8872732 . PMID 8839869 .

Viz také

RHD (gen)

externí odkazy

Umístění lidského genomu ABO a podrobnosti o genu ABO v prohlížeči genomu UCSC .
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt : P16442 (systémová transferáza systému ABO histo -krevní skupiny) na PDBe-KB .

Tento článek včlení text z Národní lékařské knihovny Spojených států , který je veřejně dostupný .

Languages

In other projects