TSC1 - TSC1

TSC1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologů : PDBe RCSB
Seznam ID kódů PDB
	5EJC , 4Z6Y
Identifikátory
Přezdívky	TSC1 , LAM, TSC, tuberózní skleróza 1, podjednotka komplexu TSC 1
Externí ID	OMIM : 605284 MGI : 1929183 HomoloGene : 314 GeneCards : TSC1
Umístění genu ( člověk )
Chr.	Chromozom 9 (člověk)
Konec	132 946 874 bp
Umístění genu ( myš )
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	28 691 167 bp
Vzorec pro expresi RNA
	Více referenčních výrazů
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba chaperonu ; • GO: vazba proteinu 0001948 ; • vazba proteinu N-konce ; • vazba proteinu Hsp70 ; • aktivita inhibitoru ATPázy ; • vazba proteinu Hsp90 ; • vazba proteinu aktivující GTPázu;
Buněčná složka	• cytoplazma ; • buněčná kůra ; • růstový kužel ; • intracelulární membrána ohraničená organela ; • lamellipodium ; • membrána ; • aktinové vlákno ; • komplex TSC1-TSC2 ; • cytoskelet ; • cytosol ; • jádro ; • perinukleární oblast cytoplazmy ; • kapička lipidů ; • plazmatická membrána ; • projekce buněk ; • obsahující protein komplex ; • komplex chaperonů ; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota;
Biologický proces	• export rRNA z jádra ; • regulace buněčného cyklu ; • uzavření neurální trubice ; • vývoj mozkové kůry ; • diferenciace paměťových T buněk ; • regulace aktivity protein kinázy ; • pozitivní regulace sestavy fokální adheze ; • myelinizace ; • negativní regulace signální dráhy inzulínového receptoru ; • organizace synapsí ; • regulace translace ; • vývoj hippocampu ; • regulace aktivity fosfoprotein fosfatázy ; • adheze buněčné matrice ; • transport iontů draslíku ; • adaptivní imunitní odpověď ; • heterooligomerizace proteinů ; • vývoj ledvin ; • vývoj nervového systému ; • organizace projekce buněk ; • GO: 0032861, GO: 0032862, GO: 0032856 aktivace aktivity GTPázy ; • regulace sestavy fokální adheze ; • import glukózy ; • regulace adheze buňka-matrice ; • negativní regulace velikosti buňky ; • reakce na inzulín ; • diferenciace buněk srdečního svalu ; • negativní regulace translace ; • negativní regulace proliferace buněčné populace ; • buněčná reakce na kyslík-glu cose deprivace ; • lokomoční chování dospělých ; • negativní regulace signalizace TOR ; • regulace smrti neuronů ; • negativní regulace makroautofagie ; • negativní regulace vývoje projekce neuronů ; • pozitivní regulace makroautofagie ; • GO: 0034259 negativní regulace aktivity GTPázy ; • regulace sestavy stresových vláken ; • pozitivní regulace sestavy stresových vláken ; • negativní regulace smrti neuronů indukované oxidačním stresem ; • negativní regulace aktivity ATPázy ; • stabilizace bílkovin;
	Zdroje: Amigo / QuickGO
Ortology
	7248
	64930
	ENSG00000165699
	ENSMUSG00000026812
	Q92574
	Q9EP53
	NM_000368 ; NM_001008567 ; NM_001162426 ; NM_001162427 ; NM_001362177
	NM_022887 ; NM_001289575 ; NM_001289576
	NP_000359 ; NP_001155898 ; NP_001155899 ; NP_001349106
	NP_001276504 ; NP_001276505 ; NP_075025
	Wikidata
Zobrazit/upravit člověka	Zobrazit/upravit myš

Tuberózní skleróza 1 (TSC1) , také známý jako hamartin , je protein, který u lidí je kódován TSC1 genem .

Funkce

TSC1 funguje jako co-chaperone, který inhibuje aktivitu ATPázy chaperonu Hsp90 (protein tepelného šoku-90) a zpomaluje jeho chaperonový cyklus. Tsc1 funguje jako zprostředkovatel Hsp90 při chaperonování klientů kinázy a non-kinázy včetně Tsc2, čímž brání jejich ubikvitinaci a degradaci v proteazomu. TSC1, TSC2 a TBC1D7 je komplex více proteinů, známý také jako komplex TSC. Tento komplex negativně reguluje signalizaci mTORC1 tím, že funguje jako protein aktivující GTPázu (GAP) pro malou GTPázu Rheb , základní aktivátor mTORC1. Komplex TSC byl implikován jako nádorový supresor .

Klinický význam

Vady tohoto genu mohou způsobit tuberózní sklerózu v důsledku funkčního poškození komplexu TSC. Vady TSC1 mohou být také příčinou fokální kortikální dysplazie . TSC1 se může podílet na ochraně mozkových neuronů v oblasti CA3 hippocampu před účinky mrtvice .

Interakce

Bylo prokázáno, že TSC1 interaguje s:

AKT1 ,
HSP70
HSP90
NEFL ,
PLK1 a
TSC2 .

Viz také

Protein tuberózní sklerózy

Reference

Další čtení

Hengstschläger M (srpen 2001). „Komplexní geny tuberózní sklerózy: od much k lidské genetice“. Archivy dermatologického výzkumu . 293 (8): 383–6. doi : 10,1007/s004030100250 . PMID 11686512 . S2CID 35702323 .
Ramesh V (červen 2003). „Aspekty proteinové funkce komplexu tuberózní sklerózy (TSC) v mozku“. Transakce biochemické společnosti . 31 (Pt 3): 579–83. doi : 10,1042/BST0310579 . PMID 12773159 .
Knowles MA, Hornigold N, Pitt E (červen 2003). „Zapojení genu genu pro komplex tuberkulózní sklerózy (TSC) do sporadických nádorů“. Transakce biochemické společnosti . 31 (Pt 3): 597–602. doi : 10,1042/BST0310597 . PMID 12773163 .
Ellisen LW (listopad 2005). „Řízení růstu ve stresu: regulace mTOR prostřednictvím dráhy REDD1-TSC“ . Buněčný cyklus . 4 (11): 1500–02. doi : 10,4161/cc.4.11.2139 . PMID 16258273 .
Jozwiak J, Jozwiak S (březen 2007). „Obří buňky: rozpor s modelem tvorby hlíz se dvěma zásahy?“. Buněčná a molekulární neurobiologie . 27 (2): 251–61. doi : 10,1007/s10571-006-9106-0 . PMID 16897363 . S2CID 31624726 .
Nagase T, Seki N, Ishikawa K, Ohira M, Kawarabayasi Y, Ohara O, Tanaka A, Kotani H, Miyajima N, Nomura N (říjen 1996). "Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. VI. Kódující sekvence 80 nových genů (KIAA0201-KIAA0280) odvozené analýzou klonů cDNA z buněčné linie KG-1 a mozku" . Výzkum DNA . 3 (5): 321–9, 341–54. doi : 10,1093/dnares/3,5.321 . PMID 9039502 .
van Slegtenhorst M, de Hoogt R, Hermans C, Nellist M, Janssen B, Verhoef S, Lindhout D, van den Ouweland A, Halley D, Young J, Burley M, Jeremiah S, Woodward K, Nahmias J, Fox M, Ekong R, Osborne J, Wolfe J, Povey S, Snell RG, Cheadle JP, Jones AC, Tachataki M, Ravine D, Sampson JR, Reeve MP, Richardson P, Wilmer F, Munro C, Hawkins TL, Sepp T, Ali JB, Ward S, Green AJ, Yates JR, Kwiatkowska J, Henske EP, Short MP, Haines JH, Jozwiak S, Kwiatkowski DJ (srpen 1997). „Identifikace genu tuberkulózní sklerózy TSC1 na chromozomu 9q34“. Věda . 277 (5327): 805–8. doi : 10,1126/věda.277.5327.805 . PMID 9242607 .
Jones AC, Daniells CE, Snell RG, Tachataki M, Idziaszczyk SA, Krawczak M, Sampson JR, Cheadle JP (listopad 1997). „Molekulárně genetická a fenotypová analýza odhaluje rozdíly mezi familiární a sporadickou tuberózní sklerózou spojenou s TSC1 a TSC2“ . Lidská molekulární genetika . 6 (12): 2155–61. doi : 10,1093/hmg/6.12.2155 . PMID 9328481 .
van Slegtenhorst M, Nellist M, Nagelkerken B, Cheadle J, Snell R, van den Ouweland A, Reuser A, Sampson J, Halley D, van der Sluijs P (červen 1998). „Interakce mezi hamartinem a tuberinem, produkty genů TSC1 a TSC2“ . Lidská molekulární genetika . 7 (6): 1053–7. doi : 10,1093/hmg/7,6,1053 . PMID 9580671 .
Plank TL, Yeung RS, Henske EP (listopad 1998). „Hamartin, produkt genu pro tuberózní sklerózu 1 (TSC1), interaguje s tuberinem a zdá se, že je lokalizován v cytoplazmatických vezikulách“. Výzkum rakoviny . 58 (21): 4766–70. PMID 9809973 .
Kwiatkowska J, Jozwiak S, Hall F, Henske EP, Haines JL, McNamara P, Braiser J, Wigowska-Sowinska J, Kasprzyk-Obara J, Short MP, Kwiatkowski DJ (červenec 1998). „Komplexní mutační analýza genu TSC1: pozorování frekvence mutací, přidružených znaků a neproniknutí“ . Annals of Human Genetics . 62 (Pt 4): 277–85. doi : 10,1046/j.1469-1809.1998.6240277.x . PMID 9924605 . S2CID 12987381 .
van Slegtenhorst M, Verhoef S, Tempelaars A, Bakker L, Wang Q, Wessels M, Bakker R, Nellist M, Lindhout D, Halley D, van den Ouweland A (duben 1999). „Mutační spektrum genu TSC1 v kohortě 225 pacientů s komplexem tuberózní sklerózy: žádný důkaz korelace genotypu a fenotypu“ . Journal of Medical Genetics . 36 (4): 285–9. doi : 10,1136/jmg.36.4.285 (neaktivní 31. května 2021). PMC 1734341 . PMID 10227394 .CS1 maint: DOI inactive as May 2021 ( link )
Niida Y, Lawrence-Smith N, Banwell A, Hammer E, Lewis J, Beauchamp RL, Sims K, Ramesh V, Ozelius L (2000). „Analýza TSC1 i TSC2 na zárodečné mutace u 126 nesouvisejících pacientů s tuberózní sklerózou“. Lidská mutace . 14 (5): 412–22. doi : 10,1002/(SICI) 1098-1004 (199911) 14: 5 <412 :: AID-HUMU7> 3.0.CO; 2-K . PMID 10533067 .
Zhang H, Nanba E, Yamamoto T, Ninomiya H, Ohno K, Mizuguchi M, Takeshita K (2000). „Mutační analýza genů TSC1 a TSC2 u japonských pacientů s komplexem tuberózní sklerózy“ . Journal of Human Genetics . 44 (6): 391–6. doi : 10,1007/s100380050185 . PMID 10570911 .
Nellist M, van Slegtenhorst MA, Goedbloed M, van den Ouweland AM, Halley DJ, van der Sluijs P (prosinec 1999). "Charakterizace cytosolického komplexu tuberin-hamartin. Tuberin je cytosolický chaperon pro hamartin" . The Journal of Biological Chemistry . 274 (50): 35647–52. doi : 10,1074/jbc.274.50.35647 . PMID 10585443 .
Yamashita Y, Ono J, Okada S, Wataya-Kaneda M, Yoshikawa K, Nishizawa M, Hirayama Y, Kobayashi E, Seyama K, Hino O (leden 2000). „Analýza všech exonů genů TSC1 a TSC2 na zárodečné mutace u japonských pacientů s tuberózní sklerózou: zpráva o 10 mutacích“. American Journal of Medical Genetics . 90 (2): 123–6. doi : 10,1002/(SICI) 1096-8628 (20000117) 90: 2 <123 :: AID-AJMG7> 3.0.CO; 2-L . PMID 10607950 .
Lamb RF, Roy C, Diefenbach TJ, Vinters HV, Johnson MW, Jay DG, hala A (květen 2000). „Hamartin potlačující nádor TSC1 reguluje buněčnou adhezi prostřednictvím proteinů ERM a GTPázy Rho“. Přírodní buněčná biologie . 2 (5): 281–7. doi : 10,1038/35010550 . PMID 10806479 . S2CID 25353057 .
Miloloza A, Rosner M, Nellist M, Halley D, Bernaschek G, Hengstschläger M (červenec 2000). „Genový produkt TSC1, hamartin, negativně reguluje buněčnou proliferaci“ . Lidská molekulární genetika . 9 (12): 1721–7. doi : 10,1093/hmg/9.12.1721 . PMID 10915759 .
Murthy V, Stemmer-Rachamimov AO, Haddad LA, Roy JE, Cutone AN, Beauchamp RL, Smith N, Louis DN, Ramesh V (březen 2001). „Vývojová exprese proteinů tuberózní sklerózy tuberin a hamartin“. Acta Neuropathologica . 101 (3): 202–10. doi : 10,1007/s004010000269 . PMID 11307618 . S2CID 8067136 .
Catania MG, Mischel PS , Vinters HV (červenec 2001). „Interakce hamartinu a tuberinu s G2/M cyklin-dependentní kinázou CDK1 a jejími regulačními cykliny A a B“ . Časopis neuropatologie a experimentální neurologie . 60 (7): 711–23. doi : 10,1093/jnen/60.7.711 . PMID 11444800 .

externí odkazy

GeneReviews/NIH/NCBI/UW entry on Tuberous Sclerosis Complex or Bourneville Disease
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt : Q92574 (Hamartin) na PDBe-KB .

Languages

In other projects