Rhizobium binae -Rhizobium binae
| Rhizobium binae | |
|---|---|
| Vědecká klasifikace | |
| Království: | |
| Kmen: | |
| Třída: | |
| Objednat: | |
| Rodina: | |
| Rod: | |
| Druh: |
R. binae
|
| Binomické jméno | |
|
Rhizobium binae Harun nebo Rashid et al. 2015
|
|
Rhizobium binae je gram-negativní bakterie , která se izoluje z kořenových nodulů z čočky v Bangladéši .
Popis
R. binae jsou tyčinkovité bakterie nacházející se v půdě. Oni potřebují kyslík a nebudou tvořit spóry .
R. binae dobře rostou na středním agaru YEMA , kde tvoří kolonie, které jsou kruhové, konvexní a krémově bílé. Kmeny přežívají při hodnotách pH mezi 5,5 a 10. Jsou velmi citlivé na ampicilin a rezistentní na kanamycin a kyselinu nalidixovou . Kmeny netolerují tetracyklin a nerostou na LB médiu .
R. binae mohou využívat různé živiny, včetně dextrinu , D-maltózy , D-trehalózy , D-celobiózy , gentiobiosy , sacharózy , D-rafinózy , α-D-glukózy, D-turanózy , α-D laktózy, D- fruktóza , D-melibióza , β-methyl-D-glukosid, salicin , N-acetyl-D-galaktosamin, D-manóza , D-galaktóza , D-mannitol , D-sorrbitol , D-arabitol , glycerol , D-glukóza- 6-fosfát , D-fruktóza-6-fosfát , D-alanin , L-asparagovou kyselinu , L-histidin , L-pyroglutamové kyseliny chinové , kyselina D-cukrová , methyl pyruvát , kyselina L-mléčná, kyselina citrónová , D - kyselina jablečná, kyselina L-jablečná, kyselina bromsukcinová, β-hydroxy-d, kyselina l-máselná a kyselina octová . R. binae nelze použít živiny N-acetyle-D-mannosamin, 3-methylen glukózy, inosin , glycyl-L-prolin, L-arginin , D-galakturonovou kyseliny , kyseliny D-glukuronové , glukuronamid , p-hydroxy-fenyloctové kyselina, methylester kyseliny D-mléčné, kyselina α-keto-glutarová, tween 40 , kyselina propionová nebo kyselina mravenčí .
R. binae může růst v přítomnosti antibiotických sloučenin linkomycinu a teluritu draselného , ale ne v přítomnosti 1% laktátu sodného , troleandomycinu , chloridu lithného nebo butyrátu sodného .
Typovým kmenem R. binae je kmen BLR195T (= LMG 28443T = DSM 29288T).
Aplikace
Různé kmeny tohoto druhu mohou vytvářet účinné uzliny a zvyšovat růst čočky, hrášku a lathyrus a jsou užitečné pro výrobu biohnojiv.
Genetika
R. binae je geneticky velmi podobný svým blízkým příbuzným Rhizobium etli a Rhizobum phaseoli . Obsah GC v DNA typového kmene R. binae je 61,5%.
Sekvence genomu je k dispozici v NCBI a v evropském archivu nukleotidů .
Dějiny
R. binae byl poprvé popsán v roce 2015 M. Harunem nebo Rashidem a dalšími. Byl izolován z kořenových uzlin Lens culinaris v okrese Feni v Bengladéši. To bylo pojmenováno "binae" jako zkratka pro Bangladéšský institut jaderného zemědělství , výzkumný ústav, kde byly bakterie původně studovány.
Reference
Další čtení
- Rashid, MH, Gonzalez, H., Young, JPW a Wink, M. (2014) Rhizobium leguminosarum je symbiont čočky na Středním východě a v Evropě, nikoli však v Bangladéši. FEMS Microbiology Ecology, 87: 64-77.
- Rashid, MH, Schafer, H., Gonzalez, H a Wink, M. (2012) Genetická rozmanitost rhizobie nodulační čočky ( Lens culinaris ) v Bangladéši. Systematic and Applied Microbiology, 35: 98-109.