Haploskupina E -M123 - Haplogroup E-M123

Haploskupina E-M123
Možné místo původu Africký roh , severovýchodní Afrika nebo Blízký východ
Předek E-Z830
Potomci E-M34
Definování mutací M123, L798.1, L799, L857

V lidské genetice , Y Haploskupina E-M123 je Y-chromosom haplogroup a definovaný jednonukleotidový polymorfismus (SNP) mutace M123. Stejně jako jeho nejbližší příbuzní ve větší haploskupině E-M215 se E-M123 nachází v Asii , Evropě a Africe .

Původ

Distribuční vzor E-M123 je nerovnoměrný, což vedlo k diskusi o tom, jak to lze vysvětlit. Cruciani a kol. (2004) navrhl, že ačkoliv klade může mít své kořeny v severovýchodní Africe, pravděpodobně se dostala do Etiopie přes Egypt a poté na Blízký východ, ačkoli blízký východ byl také považován za možnost. Luis a kol. (2004) , jak bylo rovněž uvedeno výše, dospěli k podobnému závěru porovnáním různých souborů dat. Luis navrhl, aby tato mužská linie (E-M123) pocházela z Afriky na Blízký východ přes Egypt a mohla poté cestovat na jih od Úrodného půlměsíce s farmářskou technologií.

Rozdělení

E-M123 je nejlépe známý pro svou hlavní sub-clade E-M34, která tomuto kladu dominuje. Dřívější studie však netestovaly na E-M34. Když se podíváme za hranice svých geografických vzorců, E-M123 je také docela běžný v mnoha komunitách semitských jazyků , včetně Ashkenazi a sefardských Židů , kteří tvoří více než 10% všech mužských linií ( Semino 2004 ) .

Region a populace N. E-M34 Studie
Natufiani (severní Izrael, 10 000 ybp) 5 40-100 (neúplné údaje) Lazaridis a kol. 2016
Jordánci (Mrtvé moře) 45 31.1 Flores a kol. 2005
Etiopská Amhara 34 23.5 Cruciani a kol. 2004
Maronitský Kypřan 57 21.05 Srovnávací Y-chromozomální analýza mezi Kypřany v kontextu historických událostí a migrací. 2021
Libyjští Židé 20 20.0 Shen a kol. 2004
Řecký Kypr 344 13.10 Y-chromozomální analýza kyperských Řeků odhaluje primárně společný předosmanský otcovský původ s kyperskými Turky. 2017
Etiopští Židé 22 13.6 Cruciani a kol. 2004
Kurd 59 13.6 Grugni a kol. 2012
Italská Kalábrie 68 13.2 Semino a kol. 2004
Jordánci 146 13.01 Floris a kol. 2005
Beja Portugalsko 8 12.5 Beleza a kol. 2006
Omán 121 12.0 Abu-amero a kol. 2009
Sahara/Mauretánie 189 11.1 Bekada a kol. 2013
Asyrský Teherán Írán 9 11.1 Grugni a kol. 2012
Mazara del Vallo Sicílie Itálie 18 11.1 Di Gaetano a kol. 2009
Piazza Armerina Sicílie Itálie 28 10,71 Di Gaetano a kol. 2009
Troina Sicílie Itálie 30 10.0 Di Gaetano a kol. 2009
Alžírské Kabyles 19 10.5 Arredi a kol. 2004
Severní Egypťané 49 10.2 Trombetta a kol. 2015
Hazara ( Bamiyan ) 69 10.1 Di Cristofaro a kol. 2013
Jemenští Židé 20 10.0 Shen a kol. 2004
Sephardim židovský 40 10.0 Semino a kol. 2004
Ashkenazi Židé
nelevitští, neohanimští 		74 10.0 Hammer a kol. 2009
Palestinci 367 9.5 Zalloua a kol. 2008
Ázerbájdžán Írán 63 9.5 Grugni a kol. 2012
Etiopská Wolayta 12 8.3 Cruciani a kol. 2004
Jemen 62 8.1 Cadenas a kol. 2007
Etiopský Oromo 25 8 Cruciani a kol. 2004
Erzurum turecký 25 8 Cruciani a kol. 2004
Omanite 13 7.7 Cruciani a kol. 2004
Beduíni 28 7.1 Cruciani a kol. 2004
Sicilští 136 6.6 Cruciani a kol. 2004
Sefardská turečtina 19 5.3 Cruciani a kol. 2004
Spojené arabské emiráty 41 4.9 Cruciani a kol. 2004
Severní Egypťané 21 4.8 Cruciani a kol. 2004
Jihovýchodní turečtina 24 4.2 Cruciani a kol. 2004
Arméni 413 4.1 Herrera a kol. 2011
Drúzští Arabové 28 3.6 Cruciani a kol. 2004
Sardinci 367 3.5 Cruciani a kol. 2004
Marrákeši Berbeři 29 3.4 Cruciani a kol. 2004
Palestinci 29 3.4 Cruciani a kol. 2004
Centrální anatolský 61 3.3 Cruciani a kol. 2004
Istanbulská turečtina 35 2.9 Cruciani a kol. 2004
Jihozápadní turečtina 40 2.5 Cruciani a kol. 2004
Jižní Italové 87 2.3 Cruciani a kol. 2004
Kyperští Turci 46 2.2 Cruciani a kol. 2004
Azeri 97 2.1 Cruciani a kol. 2004
Severní Italové 67 1.5 Cruciani a kol. 2004
Korsičané 140 1.4 Cruciani a kol. 2004
Asturians 90 1.1 Cruciani a kol. 2004
Kavkaz 1952 0,4 Yunusbayev a kol. 2011
Severní portugalština 50 ... Cruciani a kol. 2004
Jižní portugalština 49 ... Cruciani a kol. 2004
Pasiegos z Kantábrie 56 ... Cruciani a kol. 2004
Jižní Španělé 62 ... Cruciani a kol. 2004
Španělští Baskové 55 ... Cruciani a kol. 2004
francouzština 85 ... Cruciani a kol. 2004
Francouzští Baskové 16 ... Cruciani a kol. 2004
Orkneje Islanders 7 ... Cruciani a kol. 2004
dánština 35 ... Cruciani a kol. 2004
Střední Italové 89 ... Cruciani a kol. 2004
polština 38 ... Cruciani a kol. 2004
Estonci 74 ... Cruciani a kol. 2004
Rusové 42 ... Cruciani a kol. 2004
Rumuni 14 ... Cruciani a kol. 2004
Bulhaři 808 1.9 Karachanak a kol. 2013
Albánci 19 ... Cruciani a kol. 2004

Distribuce subclade

E-M123* (testováno a rozhodně bez E-M34)

Takové případy jsou poměrně vzácné, ale byly hlášeny následující.

  • Cruciani a kol. (2004) lokalizovali jednoho jedince v Bulharsku po testování 3401 jedinců z pěti kontinentů (z toho 116 bulharských) a Underhill et al. (2000) lokalizovali jednoho jednotlivce ve Střední Asii z 1062 testovaných lidí, včetně 184 ze Střední Asie a Sibiře.
  • Ve studii s 568-osoby v Iberia , Flores et al. (2005) našli dva jedince E-M123*, oba v severním Portugalsku ze 109 testovaných osob.
  • Ve studii Portugalska o 553 osobách Gonçalves et al. (2005) také našli dva osoby E-M123* v severním Portugalsku, ze 101 lidí, a také 2 na Madeiře ze 129 testovaných osob.
  • Flores a kol. (2005) zjistili jednu osobu ze 146 Jordánců , což je jeden ze 101 jedinců testovaných v Ammánu .
  • Arredi a kol. (2004) našli 1 Tunisana z Tunisu ve své studii 275 mužů v severní Africe, která zahrnovala 148 lidí z Tunisu.
  • Studie, které testovaly E-M123*, ale nenašly žádné, zahrnují ...

E-M123 byl někdy hlášen bez kontroly M-34 SNP, například:

  • Bosch a kol. (2006) našli příklady E-M123 v Řecku , Republice Makedonie a Rumunsku .
  • Beleza a kol. (2006) také našel příklady v Portugalsku.
  • Sanchez a kol. (2005) našel jeden vzorek v Somálsku.
  • Semino a kol. (2004) uvádí relativně vysoké úrovně 13% v albánské komunitě Cosenza v Kalábrii . Zejména vysoká regionální frekvence pro E-M123 byla v Ománu , kde je zjevně dominantní clade E-M35.
  • Luis a kol. (2004) zjistili, že 12 mužů ze 121 bylo pozitivních na E-M123, zatímco v Egyptě jich bylo 7 ze 147. Ale v této studii diverzita Omani E-M123 znamenala mladší věk než E-M123 nalezený v Egyptě. ( Cruciani et al. (2004) testovali na E-M34 v Ománu a zjistili, že 7,7% je E-M34+, bez E-M123*.)
  • Di Gaetano a kol. (2008) zjistili ve své studii o 236 osobách na Sicílii celkově 4,66%, s vyššími úrovněmi na východě ostrova. V Trapani (33 osob), Alcamo (24 osob) a Cacamo (16 osob) podél západního severního pobřeží nenašli žádné ; 3,23% v San Ninfa (31 lidí) ve vnitrozemí na západě; 3,57% v Sciacca (28 osob) a Ragusa (28 osob) podél jižního pobřeží; a poté vysoké úrovně na východě v Troině (10% z 30 osob), Piazza Armerina (10,71% z 28 osob), stejně jako v blízkosti jihozápadního extrému čelícího Africe v Mazaro de Vallo (11,11% z 18 lidí).
  • Adams a kol. (2008) nalezlo 11 lidí E-M123 v jejich studii Iberie s 1140 osobami: 1 z 95 východních Andalusanů; 1 ze 100 SZ kastilů; 1 z 80 Katalánců; 2 z 52 Extramaduranů; 2 ze 60 severních portugalců, 1 ze 78 jižních portugalců, 1 ze 73 jižních portugalců; 1 ze 73 Valencianů; a nejvyšší úrovně zjevně na Baleářích s 5 z 37 Minorcanů a 4 z 54 Ibizanů. Nebyly žádné na Mallorce (62 osob), Gaskoňsku (24), Galicii (88), NE Kastilie (31), Castilla la Mancha (63), Baskicku (116), Asturii (20), Západní Andalusii (73 ) a Aragona (34).
  • Contu a kol. (2008) našel 9 z 323 lidí ve 3 oblastech Sardinie. 4 ze 187 v Cagliari, 1 ze 103 v Sorgono a 4 z 86 v Tempio .
  • Shen a kol. (2004) zjistili, že 10 ze 169 Izraelců a Palestinců různého původu je M123+ a M34+, přičemž skupina nejvyšší úrovně je 4 z 20 izraelských Židů libyjského původu

A E-M34 byl někdy testován bez testování pro M123:

  • Podle Cruciani et al. (2004) , E-M34 se vyskytuje v malých frekvencích v severní Africe a jižní Evropě (například 6,6% na Sicílii) a má nejvyšší koncentraci v Etiopii a na Blízkém východě (s nejvyššími úrovněmi v Ománu a Turecku). Protože je však diverzita v Etiopii zjevně nízká, autoři naznačují, že E-M34 byl do Etiopie pravděpodobně zaveden z Blízkého východu.
  • V Turecku Cinnioğlu a kol. (2004) zjistili o něco více E-M34 (29) než E-M78 (26) z 523 testovaných jedinců (mnohem odlišná populace E1b1b, než byla nalezena na blízkém Balkáně).
  • Flores a kol. (2004) uvedli E-M34 v několika částech Iberie, ale nejvýrazněji asi 10% v Haliči .
  • Gonçalves a kol. (2005) zjistili v Portugalsku přibližně stejné hladiny E-M34 jako E-M123*, ale E-M34 hlavně ve středním Portugalsku (testovali se tam 4 lidé ze 102), přičemž v Açores byla nalezena ještě jedna osoba .
  • Pozoruhodné je, Flores et al. (2005) zjistili, že 14 ze 45 testovaných mužů v oblasti Mrtvého moře v Jordánsku je pozitivní na M34 (31,1%), zatímco v hlavním městě Ammánu to byli pouze 4 ze 101.
  • Cadenas a kol. (2007) zjistili, že 8,1%ze 62 mužů testovaných v Jemenu bylo pozitivních na M34, ve srovnání s mnohem nižšími úrovněmi v Kataru (1,4%) a SAE (3,1%).
  • Arredi a kol. (2004) ve své studii s 275 muži v severní Africe zjistili 2 ze 148 Tunisanů z Tunisu, 2 z 19 alžírských Berberů z Tizi Ouzu v Kabylie (10,5%) a 3 ze 44 severních Egypťanů, 4 z 29 jižních Egypťané (Takže 9,5% u všech Egypťanů ).
  • Martinez a kol. (2007) našli 3 ve své 168členné studii na Krétě, 2 v Heraklionu a 1 v Lasithi.
  • Regueiro a kol. (2006) našel jednoho v jižním Íránu ze 117 lidí a žádný v severním Íránu z 33 lidí.
  • Zalloua a kol. (2008) zjistili na Kypru 26 případů E-M123 ze 164 testovaných mužů; a 27 Palestinců z 291 testovaných. To bylo zjevně vyšší než hladina E-M78.

Subclades of E-M34

  • E-M84 , definovaný mutací SNP M84, přičemž M136 definuje subtyp k říjnu 2008. Projekt E-M35 Phylogeny odhaduje na základě dosavadních testů (v lednu 2009), že E-M84 je dominantní v 6 z 8 klastrů E-M34, které tento projekt identifikuje.
  • E-M290 , definovaný mutací SNP M290. Shen a kol. (2004) našel 1 palestinský exemplář.
  • E-V23 , definovaný mutací SNP V23. Trombetta a kol. (2011) oznámil objev této kladu. Našli to u dvou afrických jedinců. Autoři varovali, že dosud nepotvrdili, že tato kladu nebyla subtypem nebo mateřskou kladu buď M84 nebo M290, takže fylogenetická poloha E1b1b1c1c je předběžná.

Starověká DNA

  • Podle genetických analýz provedených na šesti natufiánských pozůstatcích ze severního Izraele nesli Natufiani haploskupinu Y-DNA E-Z830, poněkud navětrnou kladu E-M123 (a tedy rodovou). Natufiani byli jedním z prvních osídlených národů na světě a možná přispěli k domestikaci určitých plodin, a tím i k příchodu zemědělství. Objev E-Z830 (bez dalších kladů) naznačuje domorodou přítomnost v Kanaánu a Izraeli, která předchází všechny ostatní klady, o kterých se v té době (10 000 let před současností) v této oblasti vůbec nevědělo. Předpokládá se, že E-M123 má TMRCA asi před 18 000 lety, tedy 8 000 let před tím, než pocházejí pozůstatky Natufianů (možná rodových).
  • Studie populační genomiky Anatolie , Kavkazu a Levant našla v Arslantepe jednoho jedince, který žil kolem roku 3369-3110 př. N. L., Který patřil k E-M84 (E1b1b1b2a1a1 ~).
  • Studie o jihoasijské historii, Narasimhan et al. (2019), našli několik jedinců, kteří patřili k E-Y31991 ve vzorcích pozdní doby bronzové/starší doby železné v údolí Swat, moderní severní Pákistán.
  • Studie 137 vzorků starověkých euroasijských genomů našla jednoho středního Scythiana, který patřil k E-M123* (E-Y31991), v moderním severovýchodním Kazachstánu, datovaný od 800-750 př. N. L. Podle souboru BAM, který autoři zpřístupnili, se předpokládá, že je E-Y168273, kladu za PF4428, který je sám pod E-M123*.

Fylogenetika

Fylogenetická historie

Hlavní článek: Převodní tabulka pro haploskupiny chromozomů Y

Před rokem 2002 existovalo v akademické literatuře alespoň sedm pojmenovacích systémů pro Y-chromozomový fylogenetický strom. To vedlo ke značnému zmatku. V roce 2002 se hlavní výzkumné skupiny spojily a vytvořily Y-Chromosome Consortium (YCC). Vydali společný dokument, který vytvořil jediný nový strom, který všichni souhlasili s použitím. Později skupina občanských vědců se zájmem o populační genetiku a genetickou genealogii vytvořila pracovní skupinu pro vytvoření amatérského stromu, jehož cílem je být především včas. Níže uvedená tabulka shrnuje všechna tato díla v bodě významného stromu YCC 2002. To umožňuje výzkumníkovi revidujícímu starší publikovanou literaturu rychle přecházet mezi nomenklaturami.

YCC 2002/2008 (zkratka) (α) (β) (γ) (δ) (ε) (ζ) (η) YCC 2002 (Longhand) YCC 2005 (Longhand) YCC 2008 (Longhand) YCC 2010r (Longhand) ISOGG 2006 ISOGG 2007 ISOGG 2008 ISOGG 2009 ISOGG 2010 ISOGG 2011 ISOGG 2012
E-P29 21 III 3A 13 Eu3 H2 B E* E E E E E E E E E E
E-M33 21 III 3A 13 Eu3 H2 B E1* E1 E1a E1a E1 E1 E1a E1a E1a E1a E1a
E-M44 21 III 3A 13 Eu3 H2 B E1a E1a E1a1 E1a1 E1a E1a E1a1 E1a1 E1a1 E1a1 E1a1
E-M75 21 III 3A 13 Eu3 H2 B E2a E2 E2 E2 E2 E2 E2 E2 E2 E2 E2
E-M54 21 III 3A 13 Eu3 H2 B E2b E2b E2b E2b1 - - - - - - -
E-P2 25 III 4 14 Eu3 H2 B E3* E3 E1b E1b1 E3 E3 E1b1 E1b1 E1b1 E1b1 E1b1
E-M2 8 III 5 15 Eu2 H2 B E3a* E3a E1b1 E1b1a E3a E3a E1b1a E1b1a E1b1a E1b1a1 E1b1a1
E-M58 8 III 5 15 Eu2 H2 B E3a1 E3a1 E1b1a1 E1b1a1 E3a1 E3a1 E1b1a1 E1b1a1 E1b1a1 E1b1a1a1a E1b1a1a1a
E-M116.2 8 III 5 15 Eu2 H2 B E3a2 E3a2 E1b1a2 E1b1a2 E3a2 E3a2 E1b1a2 E1b1a2 E1ba12 odstraněny odstraněny
E-M149 8 III 5 15 Eu2 H2 B E3a3 E3a3 E1b1a3 E1b1a3 E3a3 E3a3 E1b1a3 E1b1a3 E1b1a3 E1b1a1a1c E1b1a1a1c
E-M154 8 III 5 15 Eu2 H2 B E3a4 E3a4 E1b1a4 E1b1a4 E3a4 E3a4 E1b1a4 E1b1a4 E1b1a4 E1b1a1a1g1c E1b1a1a1g1c
E-M155 8 III 5 15 Eu2 H2 B E3a5 E3a5 E1b1a5 E1b1a5 E3a5 E3a5 E1b1a5 E1b1a5 E1b1a5 E1b1a1a1d E1b1a1a1d
E-M10 8 III 5 15 Eu2 H2 B E3a6 E3a6 E1b1a6 E1b1a6 E3a6 E3a6 E1b1a6 E1b1a6 E1b1a6 E1b1a1a1e E1b1a1a1e
E-M35 25 III 4 14 Eu4 H2 B E3b* E3b E1b1b1 E1b1b1 E3b1 E3b1 E1b1b1 E1b1b1 E1b1b1 odstraněny odstraněny
E-M78 25 III 4 14 Eu4 H2 B E3b1* E3b1 E1b1b1a E1b1b1a1 E3b1a E3b1a E1b1b1a E1b1b1a E1b1b1a E1b1b1a1 E1b1b1a1
E-M148 25 III 4 14 Eu4 H2 B E3b1a E3b1a E1b1b1a3a E1b1b1a1c1 E3b1a3a E3b1a3a E1b1b1a3a E1b1b1a3a E1b1b1a3a E1b1b1a1c1 E1b1b1a1c1
E-M81 25 III 4 14 Eu4 H2 B E3b2* E3b2 E1b1b1b E1b1b1b1 E3b1b E3b1b E1b1b1b E1b1b1b E1b1b1b E1b1b1b1 E1b1b1b1a
E-M107 25 III 4 14 Eu4 H2 B E3b2a E3b2a E1b1b1b1 E1b1b1b1a E3b1b1 E3b1b1 E1b1b1b1 E1b1b1b1 E1b1b1b1 E1b1b1b1a E1b1b1b1a1
E-M165 25 III 4 14 Eu4 H2 B E3b2b E3b2b E1b1b1b2 E1b1b1b1b1 E3b1b2 E3b1b2 E1b1b1b2a E1b1b1b2a E1b1b1b2a E1b1b1b2a E1b1b1b1a2a
E-M123 25 III 4 14 Eu4 H2 B E3b3* E3b3 E1b1b1c E1b1b1c E3b1c E3b1c E1b1b1c E1b1b1c E1b1b1c E1b1b1c E1b1b1b2a
E-M34 25 III 4 14 Eu4 H2 B E3b3a* E3b3a E1b1b1c1 E1b1b1c1 E3b1c1 E3b1c1 E1b1b1c1 E1b1b1c1 E1b1b1c1 E1b1b1c1 E1b1b1b2a1
E-M136 25 III 4 14 Eu4 H2 B E3ba1 E3b3a1 E1b1b1c1a E1b1b1c1a1 E3b1c1a E3b1c1a E1b1b1c1a1 E1b1b1c1a1 E1b1b1c1a1 E1b1b1c1a1 E1b1b1b2a1a1

Výzkumné publikace

Při vytváření stromu YCC byly zastoupeny následující výzkumné týmy podle jejich publikací.

Fylogenetické stromy

  • E-M123 (M123)
    • E-M34 (M34)
      • E-M84 (M84)
        • E-M136 (M136)
      • E-M290 (M290)
      • E-V23 (V23)
      • E-L791 (L791, L792)

Viz také

Genetika

Y-DNA E subclades

Páteřní strom Y-DNA

Fylogenetický strom haploskupin DNA lidského chromozomu Y
" Y-chromozomální Adam "
A00 A0-T 
A0 A1 
A1a A1b
A1b1 BT
B CT
DE CF
D E C F
F1  F2  F3  GHIJK
G Ahoj
IJK H
IJ K
Já   J.     LT        K2 
L     T    K2a         K2b      K2c     K2d K2e   
K-M2313      K2b1  P 
NE   S   M     P1     P2
N. Ó Otázka R.

Reference

Poznámky

Citované práce

Další zdroje