Haploskupina C -M130 - Haplogroup C-M130

Haploskupina C
Možná doba vzniku 53 000 let BP [1]
Možné místo původu Východní Asie , jihozápadní Asie nebo střední Asie ,
Předek CF
Potomci C1 F3393/Z1426 (dříve CxC3)
C2 (dříve C3*) M217
Definování mutací M130/RPS4Y 711 , P184, P255, P260

Haploskupina C je hlavní haploskupina chromozomů Y , definovaná UEPs M130/RPS4Y 711 , P184, P255 a P260, což jsou všechny SNP mutace . Jedná se o jednu ze dvou hlavních větví Haplogroup CF vedle Haplogroup F . Haploskupina C se nachází ve starověkých populacích na všech kontinentech kromě Afriky a je převládající haploskupinou Y-DNA mezi muži patřícími k mnoha národům původem z východní Asie , střední Asie , Sibiře , Severní Ameriky a Austrálie , stejně jako některé populace v Evropě , Levant a později Japonsko . Haploskupina se také vyskytuje s mírnou až nízkou frekvencí u mnoha současných populací jihovýchodní Asie , jižní Asie a jihozápadní Asie .

Kromě bazální paragroup C*má tato haploskupina nyní ještě dvě hlavní větve: C1 (F3393/Z1426; dříve CxC3, tj. Stará C1, stará C2, stará C4, stará C5 a stará C6) a C2 (M217; bývalá C3 ).

Původy

Odhadovaný kořen migrace haploskupiny C

Zdá se, že Haploskupina C-M130 vznikla krátce poté, co se poprvé objevila mutace SNP M168, čímž vznikla moderní CT Haploskupiny , ze které pochází Haploskupina CF a Haploskupina C. To bylo pravděpodobně nejméně před 60 000 lety.

Haploskupina C-M130 dosahuje svých nejvyšších frekvencí mezi domorodými populacemi Kazachstánu , Mongolska , ruského Dálného východu , Polynésie , určitých skupin Austrálie a s mírnou frekvencí v Koreji a Manchu . Proto se předpokládá, že Haploskupina C-M130 buď vznikla, nebo prošla nejdelším vývojovým obdobím ve větší středoasijské oblasti nebo v regionech jihovýchodní Asie. Jeho expanze ve východní Asii byla zahájena přibližně před 40 000 lety.

Předpokládá se, že muži nesoucí C-M130 se stěhovali do Ameriky asi před 6 000–8 000 lety a byli neseni národy mluvícími Na-Dené na severozápadní pacifické pobřeží Severní Ameriky .

Asie je také oblastí, ve které je soustředěna Haploskupina D-M174 . D-M174 je však blíže příbuzný haploskupině E než C-M130 a geografické distribuce Haploskupin C-M130 a D-M174 jsou zcela a zcela odlišné, přičemž různé podtypy Haploskupiny C-M130 se mezi nimi nacházejí s vysokou frekvencí moderní Kazaši a Mongolové , stejně jako v některých domorodých národech Ameriky , Mandžusci . Se střední frekvencí se vyskytuje také v Korejcích , domorodých obyvatelích ruského Dálného východu , určitých skupin domorodých Australanů a v mírných frekvencích i jinde v Asii a Oceánii. Nosiči Haploskupiny C mezi pozdějšími japonskými lidmi Jomonů a některými paleolitickými a neolitickými Evropany nesli C1a, C1b a C1a2. Zatímco haploskupina D se vyskytuje ve vysokých frekvencích pouze mezi Tibeťany, japonskými národy a andamanskými ostrovany a nebyla nalezena ani v Indii, ani mezi domorodými obyvateli Ameriky nebo Oceánie.

Podle Sakitani et al., Haploskupina C-M130 vznikla ve Střední Asii a odtud se rozšířila do dalších částí Eurasie a do částí Austrálie. Předpokládá se, že C-M130 byl nalezen ve východoevropských lovčích sběračích, stejně jako ve starověkých vzorcích východní a jihovýchodní Asie a Evropy.

Struktura

C* (M130/Strana51/RPS4Y711, M216)

  • C1 (F3393)
    • C1a (CTS11043)
      • C1a1 (M8)
        • C1a1a (P121)
          • C1a1a1 (CTS9336)
            • C1a1a1a (CTS6678) Japonsko, Jižní Korea (Soul)
            • C1a1a1b (Z1356) Japonsko
          • C1a1a2 (Z45460) Čína (Liaoning)
      • C1a2 (dříve C6) - (V20)
        • C1a2a (V182)
          • C1a2a1 (V222)
          • C1a2a2 (Z29329)
        • C1a2b (Z38888) Ukrajina
    • C1b (F1370)
      • C1b1 (K281)
        • C1b1a (B66/Z16458)
          • C1b1a1 (dříve C5) - (M356)
          • C1b1a2 (B65)
      • C1b2 (B477/Z31885)
        • C1b2a (dříve C2) - (M38)
          • C1b2a1 (M208)
            • C1b2a1a (P33)
            • C1b2a1b (P54)
        • C1b2b (dříve C4) - (M347)
          • C1b2b1 (M210)
  • C2 (dříve C3) - (M217)
    • C2a (M93)
    • C2b (L1373/F1396)
      • C2b1
        • C2b1a
          • C2b1a1
            • C2b1a1a (P39)
          • C2b1a2 (dříve C3c) - (M48)
    • C2c (C-F1067)
      • C2c1 (F2613/Z1338)
        • C2c1a (Z1300)
          • C2c1a1
            • C2c1a1a
              • C2c1a1a1 (M407)
  • Jiné, ntaxonomizované subclades :
    • C-P343 : mimo C1a1 (M8), C1b2a (M38), C1b1a1 (dříve C5; M356), C1b2b (dříve C4; M347) a C2 (ex-C3; M217), ale jeho vztah k jiným větvím zatím není testováno.
    • C-P55 : mimo C1b2a (M38), ale jeho vztah k jiným větvím zatím nebyl ověřen, a;

(Výše uvedená fylogenetická struktura podskupin haploskupiny C-M130 vychází ze stromu ISOGG 2015, stromu YCC 2008 a následného publikovaného výzkumu.)

Rozdělení

Předpokládané rozdělení prostorové frekvence pro haploskupinu C ve východní Asii.

Distribuce Haploskupiny C-M130 je obecně omezena na populace Sibiře, částí východní Asie, Oceánie a Ameriky . Vzhledem k obrovskému stáří Haploskupiny C došlo k akumulaci mnoha sekundárních mutací a bylo identifikováno mnoho regionálně důležitých podvětví Haploskupiny C-M130.

Podle studie z roku 2015 až 46% domorodých australských mužů mělo buď bazální C* (C-M130*), C1b2b* (C-M347*) nebo C1b2b1 (C-M210), před kontaktem s Evropanem a významnou imigrací od Nagle a kol. To znamená, že 20,0% chromozomů Y 657 moderních jedinců, než bylo 56% těchto vzorků vyloučeno jako „nepůvodní“. C-M130* zjevně neslo až 2,7% domorodých mužů před kolonizací; 43% neslo C-M347, který nebyl nalezen mimo Austrálii. Ostatní haploskupiny domorodých Australanů jsou podobné Papuánům nebo jiným Negritům ( Haplogroup S-M230 a M-P256 ).

Nízké hladiny C-M130* nosí muži:

Bazální C1a* (CTS11043) byl nalezen u mladopaleolitických Evropanů ( aurignacienů ), GoyetQ116-1 a Pestera Muerii2.

C1b byl identifikován v prehistorických pozůstatcích pocházejících z 34 000 let BP, nalezených v Rusku a známých jako „ Kostenki 14 “.

Haploskupina C2 (M217) - nejpočetnější a nejrozšířenější linie C - se kdysi věřilo, že pochází ze Střední Asie , odtud se rozšířila do severní Asie a Ameriky, zatímco jiná teorie pocházela z východní Asie. C-M217 se táhne podélně ze střední Evropy a Turecka , k lidem Wayuuů z Kolumbie a Venezuely a zeměpisně šířky od atabaskských národů Aljašky po Vietnam až po malajské souostroví . Nalezeno v nízkých koncentracích ve východní Evropě , kde může jít o dědictví invazí/migrací Hunů , Turků a/nebo Mongolů ve středověku. Nalézt na zvláště vysokých frekvencích v Buryats , Daurs , Hazaras , Itelmens , Kalmyks , Koryaks , Manchus , Mongolové , Oroqens a Sibes , s mírnou distribucí mimo jiné Tungusic národy , Korejci , Ainus , Nivkhs , Altaians , Tuvinians , Uzbeků , Han Číňanů , Tujia , Hani a Hui . Nejvyšší frekvence Haploskupiny C-M217 se nacházejí mezi populacemi Mongolska a Dálného východu Ruska , kde se jedná o modální haploskupinu. Haploskupina C-M217 je jedinou odrůdou Haploskupiny C-M130, kterou lze nalézt mezi domorodými Američany , mezi nimiž dosahuje nejvyšší frekvence v populacích Na-Dené .

Další subclades jsou specifické pro určité populace, v omezeném geografickém rozsahu; i když jsou tyto další větve nalezeny, mají tendenci se jevit jako velmi nízkofrekvenční, menší složka palety rozmanitosti chromozomů Y na těchto územích:

  • C-M8 (C1a1), se nyní pravidelně vyskytuje pouze s nízkou frekvencí (přibližně 5%; rozmezí 3,3%-10% všech vzorků) v Japonsku. Bylo také zjištěno v akademické studii u jedné osoby na ostrově Jeju a v komerčním testování u jedné osoby, která nahlásila původ v čínské provincii Liao -ning, a jedné osoby, která uvedla původ v Soulu. Starověcí lidé Jomonů měli frekvenci asi 30% C1a1.
  • C-V20 (C1a2; dříve C6) se nachází v nízkých frekvencích mezi jižními Evropany. 7 000 let staré pozůstatky lovce a sběrače z La Braňa (moderní Asturie , Španělsko) to nesly a C1a2 byl také přibližně v téže době přítomen v Maďarsku . V roce 2016 byly s tímto nalezeny 35 000 let staré pozůstatky loveckého sběrače z Goyetských jeskyní ( Namur , Belgie) a 30 000 let staré ostatky loveckého sběrače z Dolních Vestonic (Vestonice16, Morava , Česká republika) haploskupina.
  • C-B66/Z16458 (C1b1a) se vyskytuje v nízkých frekvencích v jižní Asii , střední Asii a jihozápadní Asii .
  • C-M356 (C1b1a1; dříve C5) byl detekován s nízkou frekvencí ve vzorcích z Indie , Nepálu , Pákistánu , Afghánistánu , Arábie a severní Číny .
  • C-M38 (C1b2a; dříve C2), mezi některými místními populacemi v Indonésii , Melanésii (zejména na Nové Guineji ), Mikronézii a na některých ostrovech Polynésie , se z C-M38 stala modální haploskupina, pravděpodobně v důsledku závažných účinků zakladatele a genetického driftu .
  • C-P33 (C1b2a1a): nalezeno na vysokých frekvencích mezi polynéskými muži.
  • C-P55 (C1b3) se nachází na Nové Guinejské vysočině s nízkou frekvencí .
  • C-M93 (C2a) se vyskytuje sporadicky u Japonců .
  • C-L1373/F1396 (C2b) byl identifikován ve střední Asii.
  • C-P39 (C2b1a1a) se nachází mezi několik původních obyvatel Severní Ameriky, včetně některých Na-Dene -, Algonquian - a Siouan mluvící populace .
  • C-M48 (C2b1b, dříve C3c) se nachází ve vysokých frekvencích v severní Tungusic národy , Kazaši , Oirats , Kalmyks , Mongolians , Yukaghirs , Nivkhs , Koryaks , Itelmens a Udegeys , s mírným rozdělení mezi jižní Tungusic národů , Buryats , Tuvinians , Yakuts , Chukchi , Kyrgyzové , Ujgurové , Uzbekové , Karakalpakové a Tádžici .
  • C-P53.1 (C2c) nese asi 10% mužů Xinjiang Sibe s nízkou frekvencí v Mongolsku a mezi Evenky , Ningxia Hui , Xizang Tibetan , Xinjiang Uyghur a Gansu Han .
  • C-F2613/Z1338 (C2e): střední Asie i východní Asie .
  • C-M407 (C2e1a1a) bylo zjištěno, s vysokou frekvencí mezi Barghuts , Buryats , Soyots a Khamnigans , středně frekvence mimo jiné Mongolů a Kalmyks a nízkou frekvencí v arménské , Bai , kambodžské , Evenk , Číňanů , Japonců , kazašské , Korean , Manchu , Teleut , tujia , tuvinština , ujgurské a Yakut populace.
  • C-P343 se vyskytuje s vysokou frekvencí u mužů z Lembaty (17,4% z 92 vzorků), s nižší frekvencí ve Floresu , Pantaru a Timoru . P343 je mimo C1a1 (M8), C1b2a (M38), C2 (ex-C3; M217), C1b2b (dříve C4; M347) nebo C1b1a1 (dříve C5; M356), ale jeho vztah k jiným větvím zatím nebyl testován.
  • Mezi nespecifikované instance C-M130, které případně mohou patřit do jednoho z výše uvedených subclades, patří:
    • Kayser a kol. (2006) našli C-M130 (xM38, 390,1 del, M217) v 10,3% (4/39) vzorku etnických menšinových skupin z Filipín, 10,0% (6/60) ve vzorku z Arnhemské země , 6,5% (2/31) vzorku z Nusa Tenggara , 5,3% (3/57) vzorku ze Sumatry, 3,0% (1/33) vzorku z pobřeží Papuy -Nové Guineje, 2,9% (1/34) vzorek z Moluccas , 1,9% (1/53) vzorku z Javy a 0,9% (1/107) vzorku z Fidži .
    • C-RPS4Y (nyní C-RPS4Y 711 ) (xM38) Y-DNA je poměrně běžná populace indonéské provincii Východní Nusa Tenggara a nezávislý Východní Timor : 13/31 = 41,9% Lembata , 16/71 = 22,5% Flores , 5/43 = 11,6% Solor , 10/96 = 10,4% Adonara , 3/39 = 7,7% Východní Timor , 1/26 = 3,8% Alor , 1/38 = 2,6% Pantar . Všichni jedinci C-RPS4Y (xM38) kromě singletonu od Alora byli popsáni jako austronéští mluvčí.
    • C-RPS4Y (nyní C-RPS4Y 711 ) (xM38, M217) Y-DNA se podle studie publikované v roce 2010 vyskytuje ve většině populací střední Indonésie na poměrně vysokých frekvencích (115/394 = 29,2% Flores, 21/92 = 22,8% Lembata, 19/86 = 22,1% Borneo, 6/54 = 11,1% Mandar , 1/9 = 11,1% Timor, ale pouze 1/350 = 0,3% Sumba). C-RPS4Y (xM38, M217) Y-DNA se obecně stává na západě vzácnou (2/61 = 3,3% Java, 1/32 = 3,1% Malajsie, 9/641 = 1,4% Balijec, 0/38 Batak Toba, 0/ 60 Nias, ale 10/74 = 13,5% Mentawai) a směrem na východ (1/28 = 3,6% Alor, 0/30 Moluccas, 1/15 = 6,7% PNG Coast, 0/33 PNG Highland, 0/10 Nasioi, 0/44 Maewo (Vanuatu), 1/16 = 6,3% Mikronésie, 0/64 Polynésie).
    • C-RPS4Y 711 (xM8, M217) Y-DNA byla nalezena v 17% (6/35) vzorku Yao z Bama , Guangxi v jiho-centrální Číně, 4/35 = 11% vzorku Hui a 2/70 = 3% z dvojice vzorků Ujgurů ze severozápadní Číny a 3/45 = 7% ze vzorku Hezhe a 1/26 = 4% ze vzorku Ewenki ze severovýchodní Číny.
    • C-RPS4Y 711 (xM8, M38, M217) byl nalezen u 48,5% (16/33) vzorku domorodých Australanů , 20% (12/60) vzorku Yao , 6,1% (3/49) vzorek Tujia , 5,9% (1/17) vzorku Micronesians , 5,5% (3/55) vzorku východních Indonésani , 4,0% (1/25) vzorku západních Indonésani, 3,3% (3 /91) vzorku Srí Lanky , 3,1% (1/32) vzorku Malajců , 2,5% (10/405) vzorku Indů , 2,2% (1/46) vzorku Papuy -Nové Guineje , 1,7% (1/58) vzorku Miao a 1,5% (1/67) vzorku Ujgurů .
    • Zhong a kol. (2010) našli C-M130 (xM8, M38, M217, M347, M356, P55) Y-DNA v 9,09% (1/11) vzorku Mulao z Guangxi, 8,20% (5/61) vzorku z Hui z Ningxie, 7,96% (9/113) vzorku Yao z Guangxi, 7,69% (2/26) ze vzorku Tujia z Hubei, 6,90% (2/29) ze vzorku Shui z Guizhou, 3,28% (2/61) vzorku Xibe z Xinjiangu, 1,45% (1/69) vzorku Zhuang z Guangxi, 0,92% (1/109) vzorku Buyi z Guizhou, 0,87% (2/ 231) vzorku Han z Guizhou a 0,74% (1/136) vzorku Han z Yunnanu. Většina těchto jedinců má stejný haplotyp Y-STR s 8 lokusy: DYS19 = 15, DYS389I = 12, DYS389b = 16, DYS388 = 13, DYS390 = 21, DYS391 = 10, DYS392 = 11, DYS393 = 12.
    • Di Cristofaro a kol. (2013) nalezli C-M130 (xC2-PK2/M386, C1b1a1-M356) ve 1,9% (1/53) vzorku paštunské společnosti z Kunduzu v Afghánistánu a v 1,4% (1/69) ve vzorku Hazara z Bamiyanu v Afghánistánu.
    • Wang a kol. (2014) nalezli C-M130 (xM105, M38, M217, M347, M356) v 5,6% (1/18) vzorku Horpa Qiang z Danba County of Sichuan, Čína a v 2,2% (1/46) z vzorek Khams Tibeťanů z Xinlong County of Sichuan, Čína. Haplotypy Y-STR těchto dvou jedinců odpovídají modálnímu haplotypu C* ze studie Zhong et al. (2010) na každém srovnatelném lokusu.
    • "C-M216", SNP, který je nyní považován za synonymum pro C-M130-(xM8, M38, M217, M210, M356), byl nalezen u 3,9% (3/77) vzorku obecné populace Káthmándú , Nepál. Další příklady C-M216 byly u mongolský a Turkic národy , včetně: Jalairs , Tatarů , Kazakhs , krymských Tatarů , Merkits , Jochids a Uzbeks ;

Fylogenetika

Fylogenetická historie

Před rokem 2002 existovalo v akademické literatuře nejméně sedm pojmenovacích systémů pro Y-chromozomový fylogenetický strom. To vedlo ke značnému zmatku. V roce 2002 se hlavní výzkumné skupiny spojily a vytvořily Y-Chromosome Consortium (YCC). Vydali společný dokument, který vytvořil jediný nový strom, který všichni souhlasili s použitím. Níže uvedená tabulka shrnuje všechna tato díla v bodě významného stromu YCC 2002. To umožňuje výzkumníkovi revidujícímu starší publikovanou literaturu rychle přecházet mezi nomenklaturami.

YCC 2002/2008 (zkratka) (α) (β) (γ) (δ) (ε) (ζ) (η) YCC 2002 (Longhand) YCC 2005 (Longhand) YCC 2008 (Longhand) YCC 2010r (Longhand) ISOGG 2006 ISOGG 2007 ISOGG 2008 ISOGG 2009 ISOGG 2010 ISOGG 2011 ISOGG 2012
C-M216 10 PROTI 1F 16 Eu6 H1 C C* C C C C C C C C C C
C-M8 10 PROTI 1F 19 Eu6 H1 C C1 C1 C1 C1 C1 C1 C1 C1 C1 C1 C1
C-M38 10 PROTI 1F 16 Eu6 H1 C C2* C2 C2 C2 C2 C2 C2 C2 C2 C2 C2
C-P33 10 PROTI 1F 18 Eu6 H1 C C2a C2a C2a1 C2a1 C2a C2a C2a1 C2a1 C2a1 odstraněny odstraněny
C-P44 10 PROTI 1F 17 Eu6 H1 C C3* C3 C3 C3 C3 C3 C3 C3 C3 C3 C3
C-M93 10 PROTI 1F 17 Eu6 H1 C C3a C3a C3a C3a C3a C3a C3a C3a C3a C3a C3a1
C-M208 10 PROTI 1F 17 Eu6 H1 C C3b C2b C2a C2a C2b C2b C2a C2a C2a C2a C2a
C-M210 36 PROTI 1F 17 Eu6 H1 C C3c C2c C4a C4a C4b C4b C4a C4a C4a C4a C4a

Výzkumné publikace

Při vytváření stromu YCC byly zastoupeny následující výzkumné týmy podle jejich publikací.

Pozoruhodné členy

Jeden konkrétní haplotyp v Haploskupině C-M217 získal velkou pozornost kvůli možnosti, že může představovat přímý patrilineální původ z Čingischána .

Výzkumný dokument publikovaný v roce 2017-„Genetická stezka pro rané migrace Aisin Gioro, císařského domu dynastie Qing“ potvrdil, že klan Aisin Gioro patří do haploskupiny C3b1a3a2-F8951, bratrské větve C3*-Star Cluster (v současné době pojmenovaný jako C3b1a3a1-F3796, jednou spojený s Čingischánem ).

Viz také

Genetika

Subclades Y-DNA C

Páteřní strom Y-DNA

Fylogenetický strom haploskupin DNA lidského chromozomu Y
" Y-chromozomální Adam "
A00 A0-T 
A0 A1 
A1a A1b
A1b1 BT
B CT
DE CF
D E C F
F1  F2  F3  GHIJK
G Ahoj
IJK H
IJ K
   J.     LT        K2 
L     T    K2a         K2b      K2c     K2d K2e   
K-M2313      K2b1  P 
NE   S   M     P1     P2
N. Ó Otázka R.

Reference

externí odkazy

Fylogenetický strom haploskupin DNA lidského chromozomu Y
" Y-chromozomální Adam "
A00 A0-T 
A0 A1 
A1a A1b
A1b1 BT
B CT
DE CF
D E C F
F1  F2  F3  GHIJK
G Ahoj
IJK H
IJ K
   J.     LT        K2 
L     T    K2a         K2b      K2c     K2d K2e   
K-M2313      K2b1  P 
NE   S   M     P1     P2
N. Ó Otázka R.